More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2330 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  100 
 
 		 730 aa  1449    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  51.14 
 
 		 701 aa  572  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  48.17 
 
 		 713 aa  554  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  47.27 
 
 		 712 aa  543  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  44.44 
 
 		 745 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  44.35 
 
 		 682 aa  468  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  43.28 
 
 		 699 aa  464  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  45.4 
 
 		 702 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  39.02 
 
 		 812 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  41.84 
 
 		 709 aa  449  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  43.7 
 
 		 714 aa  445  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  38.87 
 
 		 699 aa  439  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  41.44 
 
 		 778 aa  422  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  39.18 
 
 		 699 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  39.22 
 
 		 706 aa  405  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  44.05 
 
 		 714 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  37.24 
 
 		 753 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  35.88 
 
 		 737 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  39.89 
 
 		 697 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  38.83 
 
 		 733 aa  378  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  37.89 
 
 		 702 aa  377  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  39.56 
 
 		 713 aa  373  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  38.49 
 
 		 780 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  38.75 
 
 		 775 aa  368  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  39.83 
 
 		 750 aa  358  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  36.38 
 
 		 764 aa  351  3e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  40.35 
 
 		 700 aa  350  5e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  40.04 
 
 		 576 aa  340  5e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  36.87 
 
 		 777 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  36.98 
 
 		 727 aa  320  5e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  37.25 
 
 		 674 aa  307  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  37.25 
 
 		 674 aa  307  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  36.95 
 
 		 674 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  31.03 
 
 		 713 aa  300  8e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  38.97 
 
 		 704 aa  299  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  36.97 
 
 		 762 aa  296  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  41.86 
 
 		 686 aa  290  8e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  36.02 
 
 		 707 aa  283  7.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  38.71 
 
 		 679 aa  279  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  36.21 
 
 		 673 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  36.65 
 
 		 678 aa  269  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  47.76 
 
 		 339 aa  265  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  35.78 
 
 		 711 aa  260  7e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  30.01 
 
 		 743 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  28.8 
 
 		 743 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  29.85 
 
 		 743 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  29.85 
 
 		 743 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  29.85 
 
 		 743 aa  254  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  29.72 
 
 		 743 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  29.81 
 
 		 743 aa  253  6e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  29.58 
 
 		 743 aa  253  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  36.4 
 
 		 708 aa  251  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  28.84 
 
 		 743 aa  247  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  29.58 
 
 		 743 aa  241  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  32.75 
 
 		 712 aa  240  8e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  30.91 
 
 		 747 aa  228  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  29.86 
 
 		 740 aa  214  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  28.18 
 
 		 723 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  30.15 
 
 		 719 aa  211  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  38.37 
 
 		 358 aa  209  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  29.96 
 
 		 778 aa  194  5e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  30.18 
 
 		 726 aa  194  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  28.82 
 
 		 882 aa  184  7e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.53 
 
 		 736 aa  183  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  27.47 
 
 		 836 aa  158  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  27.15 
 
 		 781 aa  151  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  28.34 
 
 		 766 aa  150  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  39.55 
 
 		 974 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  28.71 
 
 		 717 aa  147  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  28.59 
 
 		 735 aa  145  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  40.09 
 
 		 1146 aa  145  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  26.91 
 
 		 974 aa  144  5e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  39.27 
 
 		 981 aa  142  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  24.97 
 
 		 746 aa  137  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  26.9 
 
 		 729 aa  136  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  43.09 
 
 		 1077 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  30.25 
 
 		 733 aa  133  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  26.51 
 
 		 738 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  26.31 
 
 		 829 aa  131  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  26.31 
 
 		 829 aa  131  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  30.54 
 
 		 723 aa  131  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  24.93 
 
 		 737 aa  131  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  28.91 
 
 		 740 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  26.06 
 
 		 737 aa  129  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  26.57 
 
 		 920 aa  128  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0161  hypothetical protein  25.85 
 
 		 934 aa  128  4.0000000000000003e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.703618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1952  MMPL domain-containing protein  26.37 
 
 		 729 aa  127  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0752797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  28.12 
 
 		 735 aa  128  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  27.45 
 
 		 761 aa  127  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  26.76 
 
 		 758 aa  127  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  29.95 
 
 		 1002 aa  127  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  25.31 
 
 		 743 aa  127  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  24.9 
 
 		 979 aa  127  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3339  MmpL domain-containing protein  27.5 
 
 		 732 aa  127  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0617981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  27.33 
 
 		 732 aa  127  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  24.76 
 
 		 983 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  26.83 
 
 		 842 aa  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  24.76 
 
 		 983 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  28.46 
 
 		 761 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  27.87 
 
 		 832 aa  125  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>