More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15430 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  54.33 
 
 		 702 aa  671    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  100 
 
 		 733 aa  1415    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  52.95 
 
 		 737 aa  661    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  53.85 
 
 		 753 aa  689    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  53.25 
 
 		 699 aa  609  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  52.54 
 
 		 682 aa  581  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  50.65 
 
 		 780 aa  557  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  50.59 
 
 		 775 aa  555  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  49.58 
 
 		 697 aa  542  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  48.14 
 
 		 764 aa  528  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  47.64 
 
 		 777 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  46.95 
 
 		 702 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  48.31 
 
 		 714 aa  485  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  42.88 
 
 		 699 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  47.2 
 
 		 750 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  47.45 
 
 		 701 aa  462  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  48.88 
 
 		 727 aa  462  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  48.78 
 
 		 762 aa  457  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  47.32 
 
 		 700 aa  457  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  43.25 
 
 		 706 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  47.98 
 
 		 714 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  44.29 
 
 		 713 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  45.14 
 
 		 778 aa  433  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  38.83 
 
 		 730 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  43.08 
 
 		 745 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  40.84 
 
 		 709 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  38.4 
 
 		 699 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  37.99 
 
 		 712 aa  388  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  42.96 
 
 		 713 aa  376  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.66 
 
 		 812 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  40.13 
 
 		 576 aa  325  1e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  39.32 
 
 		 707 aa  311  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  47.75 
 
 		 358 aa  307  4.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  36.91 
 
 		 674 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  54.6 
 
 		 339 aa  304  3.0000000000000004e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  36.76 
 
 		 674 aa  304  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  36.76 
 
 		 674 aa  304  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  38.71 
 
 		 704 aa  303  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  29.12 
 
 		 713 aa  297  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  39.65 
 
 		 711 aa  290  5.0000000000000004e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  37.79 
 
 		 686 aa  282  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  40.25 
 
 		 679 aa  280  5e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  40.03 
 
 		 673 aa  279  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  38.91 
 
 		 708 aa  273  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  37.66 
 
 		 678 aa  272  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  32.81 
 
 		 712 aa  259  9e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  29.74 
 
 		 743 aa  226  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  29.97 
 
 		 743 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  29.97 
 
 		 743 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  29.97 
 
 		 743 aa  221  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  29.7 
 
 		 743 aa  219  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  29.12 
 
 		 743 aa  218  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  28.85 
 
 		 743 aa  216  9e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  28.55 
 
 		 743 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  28.87 
 
 		 743 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  29.97 
 
 		 743 aa  206  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  31.08 
 
 		 882 aa  195  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  30.76 
 
 		 747 aa  187  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  32.93 
 
 		 778 aa  182  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  26.68 
 
 		 723 aa  171  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  27.82 
 
 		 740 aa  163  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  40.54 
 
 		 974 aa  159  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  28.37 
 
 		 758 aa  158  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  27.45 
 
 		 737 aa  156  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  29.13 
 
 		 717 aa  149  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  38.86 
 
 		 981 aa  148  5e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  31.04 
 
 		 726 aa  147  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  42.05 
 
 		 1146 aa  145  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  25.91 
 
 		 997 aa  144  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  28.98 
 
 		 719 aa  143  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  30.7 
 
 		 741 aa  143  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  38.46 
 
 		 974 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  45.03 
 
 		 1077 aa  141  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  27.44 
 
 		 746 aa  137  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  27.91 
 
 		 836 aa  137  9e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  30.14 
 
 		 723 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  27.48 
 
 		 749 aa  134  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  42.93 
 
 		 1089 aa  132  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  29.21 
 
 		 718 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  45.16 
 
 		 998 aa  131  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  28.41 
 
 		 766 aa  131  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  45.16 
 
 		 998 aa  131  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  45.16 
 
 		 998 aa  131  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  30.94 
 
 		 726 aa  130  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  26.94 
 
 		 743 aa  130  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  25.95 
 
 		 736 aa  130  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  39 
 
 		 1040 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  45.16 
 
 		 1001 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  45.51 
 
 		 1002 aa  128  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  27.96 
 
 		 796 aa  129  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  37.84 
 
 		 959 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  45.33 
 
 		 1062 aa  128  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  45.33 
 
 		 1062 aa  128  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  27.82 
 
 		 781 aa  126  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  29.9 
 
 		 714 aa  127  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  42.55 
 
 		 1000 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  47.97 
 
 		 1003 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  25.66 
 
 		 779 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  28.01 
 
 		 729 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  38.35 
 
 		 1054 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>