More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2627 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  51.21 
 
 
730 aa  658    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  100 
 
 
701 aa  1340    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  53.62 
 
 
713 aa  617  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  51.16 
 
 
712 aa  597  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  50.51 
 
 
699 aa  569  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  50 
 
 
745 aa  547  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  46.79 
 
 
699 aa  530  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  49.78 
 
 
682 aa  528  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  47.01 
 
 
706 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  49.06 
 
 
702 aa  513  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  46.87 
 
 
709 aa  509  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  49.05 
 
 
714 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  47.35 
 
 
733 aa  506  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  47.54 
 
 
778 aa  500  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  44.82 
 
 
702 aa  488  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  42.39 
 
 
753 aa  486  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  45.02 
 
 
699 aa  477  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  42.9 
 
 
737 aa  474  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  42.23 
 
 
812 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  43.72 
 
 
780 aa  461  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  48.41 
 
 
714 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  45.47 
 
 
697 aa  462  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  45.83 
 
 
775 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  45.83 
 
 
713 aa  435  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  44.63 
 
 
750 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  46.13 
 
 
700 aa  419  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  41.55 
 
 
777 aa  409  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  42.23 
 
 
764 aa  407  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  46.15 
 
 
727 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  44.68 
 
 
576 aa  383  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  44.71 
 
 
762 aa  379  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  41.15 
 
 
674 aa  352  1e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  41.15 
 
 
674 aa  352  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  40.99 
 
 
674 aa  350  5e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  43.7 
 
 
704 aa  343  4e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  44.22 
 
 
679 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  42.18 
 
 
707 aa  333  5e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  43.52 
 
 
678 aa  327  5e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  41.81 
 
 
673 aa  325  3e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  41.71 
 
 
711 aa  317  3e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  45.09 
 
 
686 aa  313  9e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  54.08 
 
 
339 aa  308  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  42.92 
 
 
708 aa  301  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  29.28 
 
 
713 aa  294  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  31.48 
 
 
743 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  31.48 
 
 
743 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  38.53 
 
 
712 aa  282  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  31.34 
 
 
743 aa  280  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  31.21 
 
 
743 aa  279  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  30.65 
 
 
743 aa  278  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  30.54 
 
 
743 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  31.49 
 
 
743 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  29.99 
 
 
743 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  30.69 
 
 
743 aa  272  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  31.3 
 
 
743 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  30.68 
 
 
723 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  31.57 
 
 
882 aa  229  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  42.56 
 
 
358 aa  227  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  29.96 
 
 
740 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  34.01 
 
 
747 aa  209  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  32.52 
 
 
719 aa  197  8.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  30.38 
 
 
778 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  33.14 
 
 
726 aa  187  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  28.61 
 
 
737 aa  163  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  29.69 
 
 
836 aa  160  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  29.79 
 
 
758 aa  158  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  40.36 
 
 
974 aa  158  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.54 
 
 
736 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  28.55 
 
 
717 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  30.38 
 
 
740 aa  150  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  26.7 
 
 
997 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  36.32 
 
 
981 aa  148  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  38.94 
 
 
1146 aa  146  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  36.56 
 
 
974 aa  145  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  27.45 
 
 
743 aa  145  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  27.45 
 
 
779 aa  144  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  31.34 
 
 
741 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  32.23 
 
 
723 aa  144  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  31.5 
 
 
718 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  32.86 
 
 
717 aa  142  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1952  MMPL domain-containing protein  26.18 
 
 
729 aa  141  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0752797  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  29.01 
 
 
732 aa  141  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  29.96 
 
 
766 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  26.2 
 
 
920 aa  140  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  24.28 
 
 
704 aa  139  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  27.26 
 
 
746 aa  139  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  29.51 
 
 
737 aa  138  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  28.87 
 
 
729 aa  138  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  32.18 
 
 
714 aa  137  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  28.97 
 
 
749 aa  136  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  28.84 
 
 
832 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  28.9 
 
 
728 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.47 
 
 
796 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  31.43 
 
 
761 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  30.31 
 
 
750 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  31.45 
 
 
1002 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  38.14 
 
 
1077 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0161  hypothetical protein  26.09 
 
 
934 aa  131  4.0000000000000003e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.703618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  26.44 
 
 
740 aa  131  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6982  MMPL domain protein  27.81 
 
 
794 aa  131  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>