More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3129 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  87.43 
 
 		 708 aa  969    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 707 aa  1342    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  51.6 
 
 		 576 aa  483  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  47.13 
 
 		 674 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  47.13 
 
 		 674 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  47.13 
 
 		 674 aa  445  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  43.55 
 
 		 699 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  48.9 
 
 		 679 aa  423  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  42.24 
 
 		 745 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  48.89 
 
 		 678 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  50 
 
 		 686 aa  400  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  43.84 
 
 		 699 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  48.55 
 
 		 673 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  43.64 
 
 		 711 aa  392  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  40.23 
 
 		 702 aa  385  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  42.67 
 
 		 682 aa  383  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  42.68 
 
 		 699 aa  379  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  40.52 
 
 		 713 aa  379  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  42.02 
 
 		 706 aa  364  3e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  42.18 
 
 		 701 aa  362  2e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  38.08 
 
 		 753 aa  360  6e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  39.79 
 
 		 709 aa  357  3.9999999999999996e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  42.26 
 
 		 714 aa  354  2.9999999999999997e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  36.02 
 
 		 730 aa  345  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  38.51 
 
 		 737 aa  345  1e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  43.27 
 
 		 700 aa  342  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  39.28 
 
 		 733 aa  341  4e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  38.01 
 
 		 702 aa  335  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  42.18 
 
 		 697 aa  333  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  38.76 
 
 		 780 aa  322  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  37.18 
 
 		 712 aa  320  5e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  39.04 
 
 		 775 aa  317  4e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  39.35 
 
 		 778 aa  316  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  39.45 
 
 		 714 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  39.74 
 
 		 812 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  38.56 
 
 		 777 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  41.43 
 
 		 727 aa  297  4e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  38.29 
 
 		 750 aa  290  9e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  37.09 
 
 		 713 aa  289  1e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  32.15 
 
 		 743 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  32.15 
 
 		 743 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  41.94 
 
 		 704 aa  287  5e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  31.88 
 
 		 743 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  31.55 
 
 		 743 aa  283  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  32.02 
 
 		 743 aa  283  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  39.2 
 
 		 762 aa  282  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  31.74 
 
 		 743 aa  283  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  31.34 
 
 		 743 aa  282  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  32.29 
 
 		 743 aa  281  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  37.79 
 
 		 764 aa  278  2e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  31.66 
 
 		 743 aa  277  6e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  27.93 
 
 		 713 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  31.88 
 
 		 743 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  30.88 
 
 		 723 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  32.02 
 
 		 712 aa  243  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  29.07 
 
 		 740 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  27.21 
 
 		 882 aa  192  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  32.29 
 
 		 747 aa  191  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  43.61 
 
 		 339 aa  188  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  29.44 
 
 		 719 aa  182  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0027  MMPL domain protein  40.84 
 
 		 352 aa  181  5.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.232375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.67 
 
 		 736 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  40.89 
 
 		 358 aa  172  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  30.51 
 
 		 726 aa  171  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  28.14 
 
 		 717 aa  163  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  30.99 
 
 		 718 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  31.8 
 
 		 724 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  27.16 
 
 		 740 aa  140  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  30.77 
 
 		 983 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  30.77 
 
 		 983 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  30.77 
 
 		 979 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  30.2 
 
 		 738 aa  138  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  25.76 
 
 		 846 aa  137  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  28.75 
 
 		 978 aa  134  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  28.07 
 
 		 758 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  39.81 
 
 		 1077 aa  134  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  27.42 
 
 		 737 aa  133  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  29.46 
 
 		 766 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  26.93 
 
 		 729 aa  132  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  26 
 
 		 836 aa  127  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7301  MmpL domain-containing protein  31.34 
 
 		 704 aa  127  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.573175  normal  0.0728725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  25.52 
 
 		 743 aa  127  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  37.93 
 
 		 1146 aa  125  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  28.78 
 
 		 968 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  28.65 
 
 		 723 aa  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  28.51 
 
 		 741 aa  125  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  30.11 
 
 		 731 aa  124  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  34.36 
 
 		 974 aa  124  5e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  28.12 
 
 		 781 aa  124  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  25.32 
 
 		 710 aa  124  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  27.79 
 
 		 832 aa  123  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  31.63 
 
 		 726 aa  123  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  43.94 
 
 		 1001 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  27.89 
 
 		 974 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  30.66 
 
 		 743 aa  122  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7430  MMPL domain protein  28.79 
 
 		 744 aa  122  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1952  MMPL domain-containing protein  26.69 
 
 		 729 aa  121  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0752797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.49 
 
 		 1382 aa  121  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  26.25 
 
 		 997 aa  120  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  24.36 
 
 		 779 aa  120  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>