More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6213 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  100 
 
 		 736 aa  1433    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  45.65 
 
 		 747 aa  516  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  37.18 
 
 		 723 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  38.4 
 
 		 719 aa  346  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  35.86 
 
 		 740 aa  343  5e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  37.28 
 
 		 726 aa  333  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  29.67 
 
 		 730 aa  243  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  31.29 
 
 		 745 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  30.97 
 
 		 713 aa  211  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  30.23 
 
 		 709 aa  207  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  24.2 
 
 		 713 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  32.68 
 
 		 576 aa  199  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  28.42 
 
 		 753 aa  195  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  26.73 
 
 		 743 aa  194  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  29.78 
 
 		 712 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  26.83 
 
 		 743 aa  191  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  26.37 
 
 		 743 aa  191  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  26.76 
 
 		 743 aa  191  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  26.76 
 
 		 743 aa  191  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  27.43 
 
 		 743 aa  190  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  26.44 
 
 		 743 aa  189  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  34.74 
 
 		 701 aa  189  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  31.06 
 
 		 702 aa  189  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  30.58 
 
 		 699 aa  189  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  26.67 
 
 		 743 aa  188  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  28.51 
 
 		 737 aa  186  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  26.61 
 
 		 882 aa  185  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  29.89 
 
 		 699 aa  185  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  31.58 
 
 		 712 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  26.67 
 
 		 743 aa  184  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  33.89 
 
 		 682 aa  182  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  28.65 
 
 		 717 aa  182  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  30.45 
 
 		 706 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  33.43 
 
 		 707 aa  177  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  30.61 
 
 		 674 aa  177  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  30.61 
 
 		 674 aa  177  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  26.96 
 
 		 743 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  30.3 
 
 		 674 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.92 
 
 		 697 aa  172  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.57 
 
 		 812 aa  171  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  29.69 
 
 		 702 aa  171  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  32.27 
 
 		 780 aa  169  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  34.39 
 
 		 673 aa  169  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  32.53 
 
 		 764 aa  169  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  28.43 
 
 		 729 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  32.48 
 
 		 711 aa  166  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  34.72 
 
 		 714 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  35.19 
 
 		 686 aa  166  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  28.53 
 
 		 699 aa  165  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  27.78 
 
 		 740 aa  165  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  33.2 
 
 		 775 aa  163  9e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.05 
 
 		 746 aa  163  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  33.94 
 
 		 750 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  33.54 
 
 		 778 aa  162  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  30.3 
 
 		 735 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  34.55 
 
 		 708 aa  157  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  31.24 
 
 		 733 aa  155  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  35.37 
 
 		 974 aa  154  4e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  34.33 
 
 		 981 aa  153  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  32.85 
 
 		 727 aa  152  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  34 
 
 		 714 aa  151  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  29.75 
 
 		 731 aa  150  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  29.39 
 
 		 723 aa  150  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  31.29 
 
 		 678 aa  150  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  27.71 
 
 		 893 aa  148  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  23.85 
 
 		 829 aa  144  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  23.85 
 
 		 829 aa  144  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  30.36 
 
 		 700 aa  143  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  33.75 
 
 		 679 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  29.2 
 
 		 732 aa  141  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  34.88 
 
 		 974 aa  140  6e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  27.62 
 
 		 832 aa  139  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  25.94 
 
 		 758 aa  138  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  26.75 
 
 		 704 aa  135  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  25.87 
 
 		 734 aa  134  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.06 
 
 		 724 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  25.49 
 
 		 743 aa  133  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  29.16 
 
 		 737 aa  133  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  31.41 
 
 		 726 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  28.1 
 
 		 779 aa  132  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  27.48 
 
 		 750 aa  131  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  27.43 
 
 		 979 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  27.43 
 
 		 983 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  27.43 
 
 		 983 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.23 
 
 		 1382 aa  130  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  29.25 
 
 		 787 aa  130  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1013  hypothetical protein  26.81 
 
 		 860 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000218575 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  41.37 
 
 		 339 aa  129  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  25.84 
 
 		 920 aa  129  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  26.69 
 
 		 728 aa  128  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  26.89 
 
 		 740 aa  127  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  35.56 
 
 		 1146 aa  126  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  26.89 
 
 		 779 aa  126  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  29.44 
 
 		 968 aa  127  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  29.46 
 
 		 978 aa  126  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  25.87 
 
 		 772 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  30.04 
 
 		 842 aa  124  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  25.87 
 
 		 772 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  25.07 
 
 		 737 aa  124  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  28.21 
 
 		 718 aa  124  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>