More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3333 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  100 
 
 		 686 aa  1265    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  51.56 
 
 		 674 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  51.56 
 
 		 674 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  51.4 
 
 		 674 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  53.4 
 
 		 679 aa  484  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  51.19 
 
 		 678 aa  479  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  52.17 
 
 		 711 aa  470  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  50.97 
 
 		 576 aa  456  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  49.5 
 
 		 707 aa  452  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  45.96 
 
 		 699 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  44.98 
 
 		 745 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  49.05 
 
 		 673 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  49.28 
 
 		 708 aa  399  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  43.23 
 
 		 709 aa  392  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  39.74 
 
 		 712 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  38.5 
 
 		 730 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  41.62 
 
 		 713 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  40.94 
 
 		 699 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  42.23 
 
 		 701 aa  365  2e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  41.54 
 
 		 699 aa  361  3e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  42.57 
 
 		 682 aa  360  3e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  37.61 
 
 		 753 aa  357  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  42.54 
 
 		 714 aa  355  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  40.33 
 
 		 706 aa  345  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  37.56 
 
 		 737 aa  340  5.9999999999999996e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  39.94 
 
 		 702 aa  338  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  36.56 
 
 		 702 aa  333  7.000000000000001e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  39.27 
 
 		 775 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  39.93 
 
 		 733 aa  326  9e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  37.66 
 
 		 780 aa  317  7e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  40.54 
 
 		 697 aa  316  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  40.63 
 
 		 714 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  41.28 
 
 		 812 aa  311  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  39.92 
 
 		 764 aa  310  5.9999999999999995e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  38.85 
 
 		 778 aa  306  8.000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  41.63 
 
 		 700 aa  296  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  32.03 
 
 		 713 aa  293  6e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  30.97 
 
 		 743 aa  291  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  31.1 
 
 		 743 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  31.1 
 
 		 743 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  30.97 
 
 		 743 aa  290  8e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  30.7 
 
 		 743 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  30.7 
 
 		 743 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  30.29 
 
 		 743 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  29.76 
 
 		 743 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  41.1 
 
 		 704 aa  281  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  42.18 
 
 		 762 aa  280  5e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  30.75 
 
 		 743 aa  280  7e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  37.57 
 
 		 750 aa  278  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  30.83 
 
 		 743 aa  277  6e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  36.93 
 
 		 777 aa  261  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  37.86 
 
 		 713 aa  258  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  37.24 
 
 		 712 aa  258  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  38.77 
 
 		 727 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  31.13 
 
 		 723 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  32.21 
 
 		 719 aa  213  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  31.88 
 
 		 747 aa  205  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  42.73 
 
 		 339 aa  204  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0027  MMPL domain protein  45.57 
 
 		 352 aa  204  6e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.232375 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  28.37 
 
 		 882 aa  198  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  35.26 
 
 		 726 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.96 
 
 		 736 aa  178  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  30.67 
 
 		 717 aa  170  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  30.24 
 
 		 731 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  29.72 
 
 		 740 aa  163  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  27.67 
 
 		 740 aa  160  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  36 
 
 		 974 aa  154  4e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  36.56 
 
 		 974 aa  151  5e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  31.56 
 
 		 733 aa  150  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  30.9 
 
 		 966 aa  150  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  37.56 
 
 		 981 aa  146  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  31.72 
 
 		 729 aa  146  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  27.3 
 
 		 766 aa  144  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  31.34 
 
 		 741 aa  144  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.08 
 
 		 724 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  29.98 
 
 		 978 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  31.59 
 
 		 714 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  30 
 
 		 979 aa  142  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  27.88 
 
 		 836 aa  141  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  30 
 
 		 983 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  30 
 
 		 983 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  43.89 
 
 		 1146 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  39.02 
 
 		 1001 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  30.31 
 
 		 968 aa  140  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  28.49 
 
 		 738 aa  140  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  31.31 
 
 		 761 aa  139  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1013  hypothetical protein  30.16 
 
 		 860 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000218575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  30.76 
 
 		 741 aa  138  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  29.15 
 
 		 717 aa  137  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  28.66 
 
 		 743 aa  137  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  36.22 
 
 		 998 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7301  MmpL domain-containing protein  31.33 
 
 		 704 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.573175  normal  0.0728725 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  36.22 
 
 		 998 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  36.22 
 
 		 998 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  27.05 
 
 		 779 aa  136  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  31.97 
 
 		 726 aa  135  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  25.29 
 
 		 893 aa  133  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0161  hypothetical protein  28.02 
 
 		 934 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.703618 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  36.95 
 
 		 358 aa  133  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  35.11 
 
 		 962 aa  132  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>