More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2105 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  100 
 
 
762 aa  1440    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  63.27 
 
 
775 aa  762    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  52.97 
 
 
780 aa  595  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  49.73 
 
 
753 aa  590  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  52.32 
 
 
699 aa  591  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  48.46 
 
 
737 aa  584  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  50.4 
 
 
682 aa  556  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  48.46 
 
 
733 aa  520  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  46.09 
 
 
702 aa  513  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  45.07 
 
 
699 aa  491  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  47.65 
 
 
697 aa  490  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  49.05 
 
 
777 aa  487  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  49.87 
 
 
764 aa  487  1e-136  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  46.01 
 
 
702 aa  477  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  47.01 
 
 
714 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  48.79 
 
 
700 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  44.87 
 
 
706 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  47.97 
 
 
750 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  44.2 
 
 
778 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  51.03 
 
 
727 aa  451  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  46.56 
 
 
714 aa  444  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  45.61 
 
 
745 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  43.8 
 
 
713 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  44.43 
 
 
701 aa  420  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  41.84 
 
 
709 aa  414  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  40.41 
 
 
699 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  37.5 
 
 
730 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  41.78 
 
 
713 aa  381  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  40.71 
 
 
712 aa  372  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  38.18 
 
 
812 aa  359  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  42.49 
 
 
576 aa  351  3e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  40.27 
 
 
704 aa  314  4.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  37.16 
 
 
674 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  36.87 
 
 
674 aa  305  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  36.87 
 
 
674 aa  305  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  39.74 
 
 
707 aa  292  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  39.39 
 
 
679 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  51.43 
 
 
339 aa  281  5e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  37.7 
 
 
678 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  50.14 
 
 
358 aa  274  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  39.46 
 
 
711 aa  271  4e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  41.57 
 
 
686 aa  270  7e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  27.45 
 
 
713 aa  261  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  39.97 
 
 
673 aa  261  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  33.38 
 
 
712 aa  254  4.0000000000000004e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  38.9 
 
 
708 aa  253  9.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  30.69 
 
 
743 aa  243  7e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  30.24 
 
 
743 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  30.64 
 
 
743 aa  233  9e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  30.46 
 
 
743 aa  232  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  30.46 
 
 
743 aa  232  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  30.64 
 
 
743 aa  231  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  31 
 
 
743 aa  231  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  30.73 
 
 
743 aa  231  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  29.8 
 
 
743 aa  231  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  30.37 
 
 
743 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  31.57 
 
 
747 aa  197  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  29.57 
 
 
723 aa  191  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  28.37 
 
 
882 aa  182  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  33.45 
 
 
778 aa  171  3e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  31.28 
 
 
719 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  27.26 
 
 
740 aa  160  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  29.19 
 
 
726 aa  157  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  29.21 
 
 
717 aa  157  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  30.44 
 
 
978 aa  145  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  30.47 
 
 
876 aa  141  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  27.74 
 
 
758 aa  140  7e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3339  MmpL domain-containing protein  29.53 
 
 
732 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0617981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  31.43 
 
 
741 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.88 
 
 
736 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  42.77 
 
 
1077 aa  135  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  28.49 
 
 
718 aa  134  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  40.11 
 
 
1146 aa  134  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  31.32 
 
 
726 aa  133  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  35.24 
 
 
974 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  38.54 
 
 
945 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  38.54 
 
 
945 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  36.28 
 
 
981 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  50 
 
 
1013 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  30.06 
 
 
968 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  27.35 
 
 
836 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  34.54 
 
 
959 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  32.5 
 
 
731 aa  129  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  30.35 
 
 
966 aa  127  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0161  hypothetical protein  26.54 
 
 
934 aa  126  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.703618 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  41.26 
 
 
1001 aa  126  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  26.04 
 
 
781 aa  125  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  35.87 
 
 
974 aa  125  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  29.3 
 
 
979 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  29.3 
 
 
983 aa  125  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  29.3 
 
 
983 aa  125  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  25.91 
 
 
997 aa  124  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  26.68 
 
 
737 aa  124  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  41.82 
 
 
998 aa  124  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  41.82 
 
 
998 aa  124  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  41.82 
 
 
998 aa  124  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  30.04 
 
 
766 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  36.84 
 
 
1089 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  30.04 
 
 
757 aa  122  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  38.84 
 
 
1000 aa  120  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.26507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>