More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1049 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  100 
 
 
723 aa  1429    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  45.66 
 
 
740 aa  541  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  46.4 
 
 
719 aa  525  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  43.71 
 
 
726 aa  438  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  38.56 
 
 
747 aa  416  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.18 
 
 
736 aa  323  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  31.29 
 
 
745 aa  262  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  32.03 
 
 
709 aa  248  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  28.18 
 
 
730 aa  238  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  28.36 
 
 
699 aa  236  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  28.61 
 
 
743 aa  234  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  28.69 
 
 
743 aa  230  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  28.69 
 
 
743 aa  230  9e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  28.45 
 
 
743 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  28.71 
 
 
743 aa  228  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  28.81 
 
 
743 aa  228  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  28.61 
 
 
743 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  25.14 
 
 
713 aa  226  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  30.44 
 
 
701 aa  224  4e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  28.39 
 
 
743 aa  224  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  29.17 
 
 
743 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  30.77 
 
 
713 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  29.23 
 
 
712 aa  221  3.9999999999999997e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  30.13 
 
 
778 aa  219  1e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  30.11 
 
 
712 aa  219  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  30.88 
 
 
707 aa  218  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  28.67 
 
 
743 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  28.02 
 
 
737 aa  212  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  28.98 
 
 
753 aa  211  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  30.43 
 
 
576 aa  206  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  29.45 
 
 
699 aa  206  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  28.07 
 
 
682 aa  203  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  28.02 
 
 
702 aa  199  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  30.9 
 
 
674 aa  198  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  30.9 
 
 
674 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  30.9 
 
 
674 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  30.33 
 
 
714 aa  190  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  27.9 
 
 
882 aa  189  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  28.51 
 
 
699 aa  187  8e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.11 
 
 
697 aa  185  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  31.08 
 
 
673 aa  181  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  29.86 
 
 
679 aa  178  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  31.18 
 
 
708 aa  177  8e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  27.63 
 
 
717 aa  176  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  28.1 
 
 
706 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  26.34 
 
 
974 aa  172  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  28.91 
 
 
750 aa  171  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  28.66 
 
 
678 aa  171  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  29.38 
 
 
711 aa  170  7e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  30.68 
 
 
686 aa  170  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  26.76 
 
 
981 aa  169  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  25.22 
 
 
812 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  26.68 
 
 
733 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  28.76 
 
 
702 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  26.46 
 
 
737 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  25.93 
 
 
746 aa  162  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  28.53 
 
 
714 aa  162  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  29.73 
 
 
764 aa  161  4e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  28.69 
 
 
700 aa  161  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  25.41 
 
 
974 aa  159  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  26.66 
 
 
752 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  27.68 
 
 
780 aa  159  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  30.81 
 
 
723 aa  157  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  25.85 
 
 
743 aa  156  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  27.53 
 
 
726 aa  156  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  28.69 
 
 
727 aa  154  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  25.43 
 
 
737 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  26.07 
 
 
735 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  27.16 
 
 
778 aa  152  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  27.99 
 
 
1146 aa  151  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  27.9 
 
 
728 aa  150  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  23.44 
 
 
829 aa  150  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  23.44 
 
 
829 aa  150  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  29.03 
 
 
762 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  25.35 
 
 
710 aa  150  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  23.18 
 
 
893 aa  149  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  26.24 
 
 
836 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  27.13 
 
 
713 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  27.09 
 
 
734 aa  148  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  28.33 
 
 
729 aa  147  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  25.75 
 
 
749 aa  147  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  28.32 
 
 
718 aa  145  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  27.56 
 
 
775 aa  145  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  29.92 
 
 
724 aa  144  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  27.22 
 
 
1062 aa  144  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  27.22 
 
 
1062 aa  144  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  26.58 
 
 
731 aa  143  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  28.81 
 
 
983 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1013  hypothetical protein  29.51 
 
 
860 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000218575 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  28.81 
 
 
983 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  28.33 
 
 
704 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  26.45 
 
 
717 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  29.81 
 
 
1022 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  29.81 
 
 
1022 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  27.79 
 
 
832 aa  141  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  24.28 
 
 
779 aa  141  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  28.08 
 
 
779 aa  139  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  28.63 
 
 
979 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  28.04 
 
 
737 aa  138  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  25.5 
 
 
755 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>