More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3234 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  100 
 
 		 836 aa  1645    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  32.41 
 
 		 734 aa  197  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  25.49 
 
 		 730 aa  194  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  25.33 
 
 		 730 aa  195  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  25.49 
 
 		 730 aa  194  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  25.49 
 
 		 730 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  25.34 
 
 		 730 aa  193  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  25.41 
 
 		 730 aa  193  9e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  25 
 
 		 730 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  30.7 
 
 		 731 aa  190  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  25.34 
 
 		 730 aa  189  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  30.05 
 
 		 717 aa  189  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  32.06 
 
 		 745 aa  188  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  27.41 
 
 		 758 aa  187  7e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  31.42 
 
 		 726 aa  185  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  28.65 
 
 		 832 aa  184  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  24.41 
 
 		 730 aa  184  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  30 
 
 		 737 aa  184  7e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  27.72 
 
 		 710 aa  182  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  31.98 
 
 		 842 aa  182  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  31.32 
 
 		 745 aa  181  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1013  hypothetical protein  27.14 
 
 		 860 aa  181  4e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000218575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  32.69 
 
 		 724 aa  180  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  25.19 
 
 		 729 aa  179  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  24.15 
 
 		 730 aa  177  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  29.53 
 
 		 734 aa  177  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  29.53 
 
 		 793 aa  177  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  27.7 
 
 		 796 aa  177  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  29.57 
 
 		 723 aa  176  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  27.84 
 
 		 729 aa  176  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  31.68 
 
 		 755 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  27.19 
 
 		 752 aa  174  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  30.03 
 
 		 709 aa  174  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  27.6 
 
 		 1155 aa  173  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  27.64 
 
 		 743 aa  172  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  27.47 
 
 		 730 aa  171  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  26.59 
 
 		 736 aa  170  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  30.57 
 
 		 728 aa  170  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  26.12 
 
 		 920 aa  169  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  26.4 
 
 		 733 aa  169  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  25.99 
 
 		 779 aa  166  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  28.43 
 
 		 738 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0161  hypothetical protein  28.84 
 
 		 934 aa  165  3e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.703618 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  27.99 
 
 		 758 aa  164  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  28.46 
 
 		 711 aa  164  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  26.88 
 
 		 979 aa  164  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  26.88 
 
 		 983 aa  164  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  26.88 
 
 		 983 aa  164  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  27.5 
 
 		 727 aa  161  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  27.34 
 
 		 760 aa  160  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  27.87 
 
 		 715 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  26.31 
 
 		 882 aa  160  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  26.62 
 
 		 978 aa  159  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  26.88 
 
 		 968 aa  158  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  27.04 
 
 		 770 aa  157  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  26.12 
 
 		 737 aa  157  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  26.37 
 
 		 737 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  27.37 
 
 		 735 aa  156  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.5 
 
 		 1382 aa  156  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  30.16 
 
 		 674 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  30.16 
 
 		 674 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  27.86 
 
 		 731 aa  155  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  30.16 
 
 		 674 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  28.96 
 
 		 731 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  28.26 
 
 		 735 aa  154  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  27.78 
 
 		 741 aa  154  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  27.22 
 
 		 743 aa  153  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  27.75 
 
 		 718 aa  153  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  27.72 
 
 		 704 aa  152  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  27.34 
 
 		 738 aa  152  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  28.6 
 
 		 761 aa  151  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  26.93 
 
 		 966 aa  151  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  28.15 
 
 		 735 aa  151  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  25.77 
 
 		 791 aa  150  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  28.13 
 
 		 706 aa  150  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  27.88 
 
 		 724 aa  150  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  30.51 
 
 		 701 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  28.77 
 
 		 805 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  23.85 
 
 		 997 aa  149  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  25.83 
 
 		 843 aa  148  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  26.4 
 
 		 732 aa  148  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.98 
 
 		 738 aa  147  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  26.54 
 
 		 723 aa  147  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  28.79 
 
 		 807 aa  146  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  29.74 
 
 		 758 aa  147  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  28.22 
 
 		 740 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  26.78 
 
 		 748 aa  146  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  29.3 
 
 		 903 aa  146  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  26.78 
 
 		 754 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  25.97 
 
 		 787 aa  146  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  27.96 
 
 		 741 aa  145  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  25.59 
 
 		 735 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  27.63 
 
 		 742 aa  144  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  23.9 
 
 		 1013 aa  144  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  28.18 
 
 		 737 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  27.12 
 
 		 779 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  27.67 
 
 		 699 aa  143  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  28.84 
 
 		 699 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  26.34 
 
 		 741 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  28.47 
 
 		 909 aa  141  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>