More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0308 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  100 
 
 		 740 aa  1457    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  45.66 
 
 		 723 aa  550  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  44.88 
 
 		 719 aa  485  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  44.9 
 
 		 726 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  38.67 
 
 		 747 aa  400  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36 
 
 		 736 aa  310  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  30.17 
 
 		 745 aa  241  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  30.53 
 
 		 709 aa  240  8e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  29.86 
 
 		 730 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  30.14 
 
 		 699 aa  238  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  24.54 
 
 		 713 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  30.01 
 
 		 713 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  28.36 
 
 		 753 aa  212  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  27.96 
 
 		 882 aa  207  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  29.49 
 
 		 706 aa  201  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  26.23 
 
 		 743 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  28.47 
 
 		 737 aa  201  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  26.23 
 
 		 743 aa  201  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  26.23 
 
 		 743 aa  201  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  29.17 
 
 		 699 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  26.23 
 
 		 743 aa  198  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  29.14 
 
 		 712 aa  198  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  26.13 
 
 		 743 aa  198  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  26.1 
 
 		 743 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  26.46 
 
 		 743 aa  197  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  26.1 
 
 		 743 aa  196  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  30.79 
 
 		 701 aa  194  7e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  25.53 
 
 		 743 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  27.93 
 
 		 712 aa  189  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  29.36 
 
 		 682 aa  187  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  27.9 
 
 		 576 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  26.23 
 
 		 743 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  27.59 
 
 		 981 aa  182  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  27.51 
 
 		 699 aa  181  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  29.31 
 
 		 702 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  29.17 
 
 		 778 aa  174  6.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  27.88 
 
 		 697 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  29.43 
 
 		 780 aa  171  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  25 
 
 		 974 aa  167  9e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  29.38 
 
 		 674 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  29.38 
 
 		 674 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  29.93 
 
 		 674 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  26.54 
 
 		 974 aa  162  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  27.3 
 
 		 775 aa  161  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  26.34 
 
 		 702 aa  160  8e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  25.37 
 
 		 743 aa  159  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  26.03 
 
 		 749 aa  158  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  27.18 
 
 		 733 aa  157  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  32.11 
 
 		 778 aa  157  9e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  26.25 
 
 		 717 aa  156  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  27.94 
 
 		 836 aa  156  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  25.78 
 
 		 746 aa  154  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  28.78 
 
 		 707 aa  153  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  27.67 
 
 		 714 aa  152  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  27.81 
 
 		 727 aa  151  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  29.37 
 
 		 700 aa  151  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  30.88 
 
 		 679 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  25.78 
 
 		 735 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  26.51 
 
 		 737 aa  147  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  22.85 
 
 		 829 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  26.81 
 
 		 734 aa  145  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  22.85 
 
 		 829 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  29.54 
 
 		 678 aa  145  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  29.23 
 
 		 673 aa  144  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  33.8 
 
 		 1077 aa  142  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  27.18 
 
 		 832 aa  140  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  25.97 
 
 		 920 aa  139  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  28.22 
 
 		 711 aa  138  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  24.55 
 
 		 779 aa  139  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  26.05 
 
 		 718 aa  138  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  26.44 
 
 		 752 aa  137  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  23.31 
 
 		 893 aa  137  8e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  28.92 
 
 		 686 aa  136  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  23.67 
 
 		 1049 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  25.79 
 
 		 777 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  28.61 
 
 		 714 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  33.82 
 
 		 1146 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  26.06 
 
 		 731 aa  132  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  25.52 
 
 		 770 aa  131  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  26.9 
 
 		 723 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  24.53 
 
 		 740 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  25.63 
 
 		 781 aa  128  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  25.03 
 
 		 733 aa  128  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  28.44 
 
 		 1089 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  26.12 
 
 		 741 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  37.17 
 
 		 750 aa  127  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  23.75 
 
 		 729 aa  127  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  25.1 
 
 		 731 aa  126  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  22.5 
 
 		 704 aa  126  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  34.15 
 
 		 1062 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  27.34 
 
 		 1002 aa  126  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  27.78 
 
 		 1013 aa  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  24.45 
 
 		 710 aa  126  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  34.15 
 
 		 1062 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  26.45 
 
 		 726 aa  125  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  26.14 
 
 		 1013 aa  125  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  26.1 
 
 		 764 aa  124  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  27.19 
 
 		 762 aa  124  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  27.96 
 
 		 1003 aa  124  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  24.69 
 
 		 737 aa  124  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>