More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_01110 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  100 
 
 		 711 aa  1342    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  51.93 
 
 		 674 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  51.93 
 
 		 674 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  51.64 
 
 		 674 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  50.88 
 
 		 678 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  50.38 
 
 		 679 aa  478  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  46.71 
 
 		 576 aa  440  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  48.35 
 
 		 686 aa  425  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  43.52 
 
 		 707 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  40.85 
 
 		 745 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  38.52 
 
 		 753 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  46.09 
 
 		 673 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  39.5 
 
 		 699 aa  361  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  43.31 
 
 		 708 aa  355  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  40.12 
 
 		 699 aa  353  5.9999999999999994e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  38.98 
 
 		 709 aa  347  4e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  37.74 
 
 		 780 aa  346  7e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  37.19 
 
 		 737 aa  339  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  41.87 
 
 		 701 aa  337  3.9999999999999995e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  39.65 
 
 		 733 aa  336  7.999999999999999e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  37.57 
 
 		 699 aa  335  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  38.09 
 
 		 713 aa  325  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  36.96 
 
 		 775 aa  325  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  34.22 
 
 		 730 aa  322  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  35.84 
 
 		 702 aa  318  3e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  36.4 
 
 		 706 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  39.41 
 
 		 682 aa  315  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  38.32 
 
 		 702 aa  313  4.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  36.63 
 
 		 712 aa  312  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  39.22 
 
 		 714 aa  301  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  38.65 
 
 		 764 aa  299  2e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  40.82 
 
 		 778 aa  288  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  39.25 
 
 		 700 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  40.95 
 
 		 714 aa  283  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  37.74 
 
 		 762 aa  278  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  40.34 
 
 		 727 aa  277  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  37.94 
 
 		 777 aa  275  3e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  29.21 
 
 		 713 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.26 
 
 		 812 aa  273  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.31 
 
 		 697 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  30.6 
 
 		 743 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  30.88 
 
 		 743 aa  260  6e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  30.78 
 
 		 743 aa  260  6e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  30.6 
 
 		 743 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  30.46 
 
 		 743 aa  259  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  30.6 
 
 		 743 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  34.5 
 
 		 712 aa  259  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  30.83 
 
 		 743 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  30.6 
 
 		 743 aa  257  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  37.86 
 
 		 713 aa  257  4e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  30.41 
 
 		 743 aa  257  6e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  36.69 
 
 		 704 aa  254  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  34.76 
 
 		 750 aa  247  6.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  30.32 
 
 		 743 aa  243  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  30.54 
 
 		 719 aa  206  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  28.97 
 
 		 723 aa  201  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  32.29 
 
 		 747 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0027  MMPL domain protein  42.03 
 
 		 352 aa  186  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.232375 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  26.75 
 
 		 882 aa  182  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  37.79 
 
 		 339 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  28.02 
 
 		 740 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  27.05 
 
 		 758 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  31.87 
 
 		 778 aa  161  3e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  31.22 
 
 		 726 aa  157  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  30.69 
 
 		 717 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  26.94 
 
 		 740 aa  150  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  37.21 
 
 		 358 aa  148  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.11 
 
 		 736 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  38.25 
 
 		 1077 aa  146  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  28.81 
 
 		 766 aa  144  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  27.92 
 
 		 796 aa  144  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  27.72 
 
 		 743 aa  138  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  30.99 
 
 		 738 aa  137  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  30.75 
 
 		 731 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  29.7 
 
 		 832 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  28.63 
 
 		 729 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  28.55 
 
 		 731 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  29.84 
 
 		 741 aa  135  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  24.83 
 
 		 997 aa  134  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  29.77 
 
 		 718 aa  134  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  28.61 
 
 		 714 aa  133  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.14 
 
 		 746 aa  133  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  27.8 
 
 		 761 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  26.79 
 
 		 779 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  26.93 
 
 		 724 aa  131  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  27.62 
 
 		 979 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  26.11 
 
 		 737 aa  130  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7301  MmpL domain-containing protein  28.4 
 
 		 704 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.573175  normal  0.0728725 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  27.62 
 
 		 983 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  27.62 
 
 		 983 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  27.76 
 
 		 981 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  37 
 
 		 1146 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  28.15 
 
 		 734 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  26.41 
 
 		 733 aa  128  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  27.86 
 
 		 974 aa  128  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.88 
 
 		 1308 aa  128  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  38.33 
 
 		 1062 aa  127  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  38.33 
 
 		 1062 aa  127  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  27.44 
 
 		 710 aa  127  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2167  RND superfamily drug efflux protein  28.26 
 
 		 825 aa  126  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00341827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>