More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0114 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 673 aa  1261    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  49.04 
 
 		 674 aa  445  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  49.04 
 
 		 674 aa  445  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  48.89 
 
 		 674 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  50.83 
 
 		 576 aa  437  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  48.55 
 
 		 707 aa  436  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  49.93 
 
 		 678 aa  425  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  50.41 
 
 		 679 aa  413  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  49.49 
 
 		 708 aa  405  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  46.29 
 
 		 711 aa  401  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  47.47 
 
 		 686 aa  380  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  41.84 
 
 		 699 aa  379  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  42.19 
 
 		 699 aa  373  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  38.46 
 
 		 753 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  44.51 
 
 		 745 aa  368  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  45.64 
 
 		 701 aa  365  1e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  40.32 
 
 		 713 aa  362  9e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  40.34 
 
 		 709 aa  362  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  36.49 
 
 		 730 aa  355  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  39.01 
 
 		 737 aa  351  3e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  43.35 
 
 		 682 aa  350  4e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  39 
 
 		 702 aa  348  2e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  38.48 
 
 		 712 aa  347  4e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  41.2 
 
 		 702 aa  342  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.66 
 
 		 812 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  41.33 
 
 		 778 aa  320  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  40.85 
 
 		 697 aa  320  6e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  39.56 
 
 		 706 aa  317  4e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  39.05 
 
 		 699 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  40.48 
 
 		 733 aa  315  1.9999999999999998e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  37.45 
 
 		 780 aa  309  9e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  37.79 
 
 		 775 aa  300  6e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  42.2 
 
 		 700 aa  288  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  40.47 
 
 		 714 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  28.55 
 
 		 713 aa  286  8e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  40.27 
 
 		 764 aa  281  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  40.71 
 
 		 714 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  40.9 
 
 		 704 aa  274  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  42.42 
 
 		 727 aa  274  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  38.43 
 
 		 750 aa  271  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  30.55 
 
 		 743 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  30.46 
 
 		 743 aa  263  8.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  31.15 
 
 		 743 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  30.87 
 
 		 743 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  37.99 
 
 		 713 aa  262  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  30.33 
 
 		 743 aa  261  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  30.33 
 
 		 743 aa  261  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  30.33 
 
 		 743 aa  261  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  42.03 
 
 		 762 aa  261  4e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  30.46 
 
 		 743 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  30.93 
 
 		 743 aa  260  6e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  30.33 
 
 		 743 aa  249  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  36.04 
 
 		 712 aa  243  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  47.32 
 
 		 339 aa  215  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  31.26 
 
 		 723 aa  203  6e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  27.76 
 
 		 882 aa  185  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0027  MMPL domain protein  38.73 
 
 		 352 aa  176  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.232375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  30.7 
 
 		 726 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  32.55 
 
 		 747 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  28.68 
 
 		 719 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  51.54 
 
 		 777 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  33.19 
 
 		 717 aa  161  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  29.25 
 
 		 740 aa  154  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.77 
 
 		 736 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  27.26 
 
 		 740 aa  148  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  36.55 
 
 		 1077 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  33.6 
 
 		 974 aa  145  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  41.49 
 
 		 358 aa  144  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  35.71 
 
 		 974 aa  143  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1013  hypothetical protein  30.75 
 
 		 860 aa  139  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000218575 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  26.22 
 
 		 758 aa  139  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  27.8 
 
 		 779 aa  136  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  28.51 
 
 		 729 aa  136  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  39.46 
 
 		 981 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  29.51 
 
 		 731 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  36.21 
 
 		 1062 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  27.36 
 
 		 737 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  27.09 
 
 		 733 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  36.21 
 
 		 1062 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  38.51 
 
 		 1001 aa  132  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  42.37 
 
 		 1146 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  29.36 
 
 		 738 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  29.59 
 
 		 724 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  28.12 
 
 		 749 aa  128  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  37.41 
 
 		 998 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  37.41 
 
 		 998 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  37.41 
 
 		 998 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  27.91 
 
 		 920 aa  127  8.000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  49.33 
 
 		 1003 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  44.56 
 
 		 1000 aa  124  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0161  hypothetical protein  28.26 
 
 		 934 aa  124  6e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.703618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  29.85 
 
 		 718 aa  124  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  30.97 
 
 		 741 aa  123  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  38.1 
 
 		 941 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  30.18 
 
 		 761 aa  123  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  30.83 
 
 		 726 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  31.69 
 
 		 743 aa  122  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  41.59 
 
 		 1089 aa  120  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  30.74 
 
 		 945 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  30.74 
 
 		 945 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>