More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5187 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  100 
 
 		 780 aa  1510    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  53.3 
 
 		 775 aa  617  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  52.1 
 
 		 682 aa  602  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  50.47 
 
 		 753 aa  596  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  50 
 
 		 699 aa  590  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  50.76 
 
 		 737 aa  575  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  51.85 
 
 		 733 aa  569  1e-161  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  47.02 
 
 		 702 aa  534  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  53.53 
 
 		 762 aa  519  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  48.7 
 
 		 697 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  46.47 
 
 		 777 aa  511  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  48.01 
 
 		 702 aa  505  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  47.54 
 
 		 750 aa  496  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  47.37 
 
 		 714 aa  483  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  47.88 
 
 		 764 aa  484  1e-135  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  44.25 
 
 		 699 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  44.13 
 
 		 745 aa  464  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  43.57 
 
 		 713 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  45.37 
 
 		 778 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  43.65 
 
 		 701 aa  449  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  46.62 
 
 		 714 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  47.14 
 
 		 727 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  43.8 
 
 		 706 aa  446  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  44.81 
 
 		 700 aa  441  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  38.77 
 
 		 730 aa  420  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  40.19 
 
 		 712 aa  411  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  43.35 
 
 		 713 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  40.54 
 
 		 709 aa  395  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.34 
 
 		 812 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  38.57 
 
 		 699 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  37.71 
 
 		 704 aa  318  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  40.37 
 
 		 576 aa  318  2e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  57.1 
 
 		 339 aa  318  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  37.5 
 
 		 674 aa  310  8e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  37.5 
 
 		 674 aa  310  8e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  37.5 
 
 		 674 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  38.91 
 
 		 707 aa  292  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  39.44 
 
 		 711 aa  290  6e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  38.13 
 
 		 678 aa  288  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  42.57 
 
 		 679 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  49.16 
 
 		 358 aa  280  9e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  37.21 
 
 		 673 aa  278  4e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  38.61 
 
 		 686 aa  275  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  28.3 
 
 		 713 aa  264  4.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  39.36 
 
 		 708 aa  255  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  31.08 
 
 		 743 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  31.08 
 
 		 743 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  29.93 
 
 		 743 aa  244  6e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  30.83 
 
 		 743 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  33.33 
 
 		 712 aa  240  8e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  30.81 
 
 		 743 aa  239  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  30.99 
 
 		 743 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  30.76 
 
 		 743 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  30.89 
 
 		 743 aa  234  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  30.31 
 
 		 743 aa  229  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  30.68 
 
 		 743 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  34.45 
 
 		 778 aa  191  5.999999999999999e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  32.78 
 
 		 747 aa  186  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  28.64 
 
 		 882 aa  184  6e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  30.05 
 
 		 719 aa  182  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  29.83 
 
 		 740 aa  180  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  27.82 
 
 		 723 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  29.9 
 
 		 726 aa  168  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  30.58 
 
 		 717 aa  159  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  29.23 
 
 		 758 aa  152  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  27.12 
 
 		 997 aa  151  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  28.97 
 
 		 741 aa  149  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.29 
 
 		 736 aa  143  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  38.64 
 
 		 1077 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  34.63 
 
 		 974 aa  139  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  37.5 
 
 		 1089 aa  132  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  26.29 
 
 		 836 aa  132  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  39.81 
 
 		 1062 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  39.81 
 
 		 1062 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  35.68 
 
 		 1146 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  45.13 
 
 		 998 aa  132  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  45.13 
 
 		 998 aa  132  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  28.88 
 
 		 781 aa  131  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  45.13 
 
 		 998 aa  132  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  34.85 
 
 		 981 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  41.13 
 
 		 1001 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  35.27 
 
 		 944 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1013  hypothetical protein  28.12 
 
 		 860 aa  130  9.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000218575 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  32.91 
 
 		 959 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  31.21 
 
 		 941 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  30.97 
 
 		 724 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  33.59 
 
 		 962 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  34.84 
 
 		 945 aa  127  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  34.84 
 
 		 945 aa  127  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  42.42 
 
 		 1000 aa  127  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  28.54 
 
 		 718 aa  127  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  37.43 
 
 		 974 aa  127  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  37.8 
 
 		 1040 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  29.36 
 
 		 729 aa  127  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  28.86 
 
 		 766 aa  125  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  28.91 
 
 		 731 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  35.48 
 
 		 948 aa  125  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11589  transmembrane transport protein mmpL6  34.51 
 
 		 397 aa  124  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.9101799999999998e-86  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  47.06 
 
 		 1013 aa  124  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  29.85 
 
 		 738 aa  124  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>