More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4494 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  100 
 
 		 339 aa  654    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  64.63 
 
 		 682 aa  374  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  63.44 
 
 		 699 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  55.85 
 
 		 753 aa  339  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  56.77 
 
 		 737 aa  332  5e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  57.1 
 
 		 780 aa  330  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  54.01 
 
 		 702 aa  317  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  51.83 
 
 		 702 aa  313  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  51.14 
 
 		 764 aa  310  2e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  53.78 
 
 		 775 aa  305  6e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  54.6 
 
 		 733 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  54.08 
 
 		 701 aa  302  5.000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  51.5 
 
 		 697 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  50.99 
 
 		 778 aa  288  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  53.4 
 
 		 750 aa  287  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  47.76 
 
 		 730 aa  287  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  53.37 
 
 		 713 aa  285  9e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  50.14 
 
 		 714 aa  280  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  48.71 
 
 		 714 aa  272  7e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  46.88 
 
 		 699 aa  267  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  53.71 
 
 		 700 aa  261  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  49.24 
 
 		 699 aa  259  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  52.71 
 
 		 727 aa  253  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  50.15 
 
 		 745 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  44.9 
 
 		 706 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  51.43 
 
 		 762 aa  250  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  45.76 
 
 		 712 aa  250  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  48.18 
 
 		 777 aa  246  6e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  48.99 
 
 		 713 aa  239  5e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  45.76 
 
 		 709 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  47.93 
 
 		 812 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  46.69 
 
 		 673 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  41.9 
 
 		 576 aa  202  8e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  45.4 
 
 		 679 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  42.22 
 
 		 674 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  42.22 
 
 		 674 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  42.22 
 
 		 674 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  42.28 
 
 		 678 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  45.4 
 
 		 704 aa  189  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  34.9 
 
 		 743 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  35.57 
 
 		 743 aa  178  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  35.57 
 
 		 743 aa  179  9e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  35.57 
 
 		 743 aa  178  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  43.48 
 
 		 686 aa  176  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  34.99 
 
 		 743 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  34.01 
 
 		 743 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  34.31 
 
 		 743 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  44.44 
 
 		 707 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  34.99 
 
 		 743 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  35.48 
 
 		 743 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  43.28 
 
 		 708 aa  170  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  35.57 
 
 		 743 aa  165  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  33.55 
 
 		 713 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  37.64 
 
 		 711 aa  164  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  39.39 
 
 		 974 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  36.73 
 
 		 712 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  36.56 
 
 		 974 aa  144  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  34.04 
 
 		 981 aa  142  7e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  35.94 
 
 		 1146 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  38.08 
 
 		 1077 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  35.27 
 
 		 747 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  33.74 
 
 		 719 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  31.79 
 
 		 740 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  34.36 
 
 		 1040 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  41.95 
 
 		 998 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  38.49 
 
 		 1062 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  41.95 
 
 		 998 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  38.49 
 
 		 1062 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  41.95 
 
 		 998 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  38.27 
 
 		 1001 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  30.83 
 
 		 1109 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  30.83 
 
 		 1109 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  31.74 
 
 		 723 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  41.1 
 
 		 1000 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  39.08 
 
 		 1089 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  31.33 
 
 		 959 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  36.68 
 
 		 1054 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  37.25 
 
 		 882 aa  123  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  44.59 
 
 		 1003 aa  123  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  36.76 
 
 		 726 aa  122  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  41.37 
 
 		 736 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  30.68 
 
 		 941 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  39.57 
 
 		 1002 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  34.7 
 
 		 1011 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  30.3 
 
 		 948 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  28.2 
 
 		 962 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  34.19 
 
 		 945 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  34.19 
 
 		 945 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  30.46 
 
 		 717 aa  116  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1057  transport protein  34.45 
 
 		 963 aa  116  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  40.49 
 
 		 778 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  47.22 
 
 		 1013 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1580  hypothetical protein  40 
 
 		 869 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000620673 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  34.86 
 
 		 1049 aa  113  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10690  transmembrane transport protein mmpL5  30.71 
 
 		 964 aa  113  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  35.75 
 
 		 944 aa  113  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5174  transport protein  30 
 
 		 968 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  36.78 
 
 		 1013 aa  112  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5263  transport protein  30 
 
 		 968 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5555  transport protein  30 
 
 		 968 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188099  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>