More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5263 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3401  transport protein  71.17 
 
 
955 aa  1372    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.057109  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5174  transport protein  100 
 
 
968 aa  1974    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  46.71 
 
 
945 aa  925    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  63.92 
 
 
967 aa  1268    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  65.3 
 
 
959 aa  1341    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3435  transport protein  80.02 
 
 
968 aa  1585    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541306  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  46.71 
 
 
945 aa  925    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10690  transmembrane transport protein mmpL5  77.05 
 
 
964 aa  1545    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2705  transport protein  59.14 
 
 
957 aa  1112    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3464  transport protein  71.17 
 
 
955 aa  1372    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0593599 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5263  transport protein  100 
 
 
968 aa  1974    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1057  transport protein  63.87 
 
 
963 aa  1284    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  66.99 
 
 
948 aa  1308    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1614  transport protein  68.85 
 
 
968 aa  1367    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  66.81 
 
 
941 aa  1310    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3189  transport protein  79.08 
 
 
968 aa  1576    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  60.63 
 
 
944 aa  1170    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  59.7 
 
 
962 aa  1154    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3412  transport protein  71.17 
 
 
955 aa  1372    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0674616  normal  0.562796 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4825  transport protein  67.63 
 
 
1001 aa  1349    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5555  transport protein  100 
 
 
968 aa  1974    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188099  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10407  transmembrane transport protein mmpL1  55.15 
 
 
958 aa  1090    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.665513  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10518  transmembrane transport protein mmpL2  58.02 
 
 
968 aa  1084    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.930398 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11778  MmpL family membrane protein  32 
 
 
945 aa  479  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000786949  decreased coverage  0.0000000000113435 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11589  transmembrane transport protein mmpL6  61.04 
 
 
397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.9101799999999998e-86  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  30.58 
 
 
1002 aa  434  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  30.96 
 
 
1022 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  30.96 
 
 
1022 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  30.48 
 
 
1003 aa  426  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  29.52 
 
 
998 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  29.57 
 
 
998 aa  416  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  29.57 
 
 
998 aa  416  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  30.09 
 
 
1000 aa  411  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  30.01 
 
 
1028 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  28 
 
 
1011 aa  397  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  29.55 
 
 
1077 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  30.02 
 
 
1040 aa  396  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  29.15 
 
 
1013 aa  391  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  27.24 
 
 
1146 aa  392  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  29.22 
 
 
1013 aa  388  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  29.11 
 
 
1001 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  27.35 
 
 
1089 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  29.39 
 
 
1062 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  29.39 
 
 
1062 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  31.3 
 
 
681 aa  220  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4635  MMPL domain-containing protein  32.17 
 
 
470 aa  198  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12956  transmembrane transport protein mmpL7  24.74 
 
 
920 aa  196  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  24.2 
 
 
1109 aa  139  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  23.63 
 
 
974 aa  138  4e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  23.77 
 
 
1109 aa  135  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  21.78 
 
 
981 aa  129  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  23.32 
 
 
974 aa  127  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  28.63 
 
 
1054 aa  125  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  27.67 
 
 
1040 aa  124  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  25.58 
 
 
1041 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  24.71 
 
 
1038 aa  121  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2949  putative membrane protein, MmpL family  24.71 
 
 
888 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4025e-34 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  31.65 
 
 
702 aa  119  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  25 
 
 
1038 aa  119  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  26.13 
 
 
1038 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  28.16 
 
 
713 aa  118  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  24.93 
 
 
1041 aa  118  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  31.8 
 
 
576 aa  117  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  25.72 
 
 
1038 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  32.84 
 
 
750 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  34.21 
 
 
764 aa  116  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  26.89 
 
 
1038 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  31.45 
 
 
747 aa  115  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  25.65 
 
 
1049 aa  115  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  33.33 
 
 
702 aa  114  9e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  33.04 
 
 
745 aa  113  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  31.47 
 
 
780 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  35.71 
 
 
700 aa  110  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  31.33 
 
 
775 aa  110  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  26.34 
 
 
753 aa  110  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  33.49 
 
 
714 aa  108  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  34.93 
 
 
701 aa  108  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  32.29 
 
 
699 aa  107  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  31.28 
 
 
709 aa  107  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  25.42 
 
 
1068 aa  107  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  29.96 
 
 
339 aa  107  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  33.33 
 
 
733 aa  107  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  38.31 
 
 
712 aa  106  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  26.39 
 
 
712 aa  106  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  26.63 
 
 
674 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1580  hypothetical protein  33.51 
 
 
869 aa  105  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000620673 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  26.63 
 
 
674 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  26.63 
 
 
674 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0161  hypothetical protein  35.21 
 
 
934 aa  105  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.703618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  33.68 
 
 
714 aa  105  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  31.55 
 
 
778 aa  105  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  31.25 
 
 
730 aa  105  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  26.04 
 
 
882 aa  103  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  25.22 
 
 
737 aa  103  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  30.51 
 
 
713 aa  103  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  38.31 
 
 
679 aa  103  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  34.34 
 
 
762 aa  102  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  36.54 
 
 
673 aa  102  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.33 
 
 
697 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  32.31 
 
 
682 aa  100  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>