More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4418 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  61.83 
 
 
959 aa  1214    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3435  transport protein  69.84 
 
 
968 aa  1343    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541306  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2705  transport protein  60.46 
 
 
957 aa  1097    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4825  transport protein  62.36 
 
 
1001 aa  1236    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10407  transmembrane transport protein mmpL1  56.75 
 
 
958 aa  1133    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.665513  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10518  transmembrane transport protein mmpL2  59.13 
 
 
968 aa  1116    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.930398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3401  transport protein  64.57 
 
 
955 aa  1256    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.057109  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5174  transport protein  66.99 
 
 
968 aa  1310    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  48.03 
 
 
945 aa  924    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  100 
 
 
948 aa  1925    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  48.03 
 
 
945 aa  924    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10690  transmembrane transport protein mmpL5  67.28 
 
 
964 aa  1312    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3464  transport protein  64.57 
 
 
955 aa  1256    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0593599 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5263  transport protein  66.99 
 
 
968 aa  1310    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1057  transport protein  60.06 
 
 
963 aa  1169    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  60.59 
 
 
962 aa  1135    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1614  transport protein  63.02 
 
 
968 aa  1263    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  92.42 
 
 
941 aa  1763    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3189  transport protein  69.08 
 
 
968 aa  1335    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  60.15 
 
 
944 aa  1130    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  63.68 
 
 
967 aa  1253    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3412  transport protein  64.57 
 
 
955 aa  1256    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0674616  normal  0.562796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5555  transport protein  66.99 
 
 
968 aa  1310    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188099  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11589  transmembrane transport protein mmpL6  64.09 
 
 
397 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.9101799999999998e-86  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11778  MmpL family membrane protein  31.5 
 
 
945 aa  449  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000786949  decreased coverage  0.0000000000113435 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  31.19 
 
 
1011 aa  441  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  30.82 
 
 
1002 aa  424  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  30.01 
 
 
1003 aa  414  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  29.72 
 
 
1013 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  29.96 
 
 
1022 aa  403  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  29.96 
 
 
1022 aa  403  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  30.08 
 
 
1000 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  29.03 
 
 
1146 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  29.25 
 
 
998 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  29.25 
 
 
998 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  29.25 
 
 
998 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  29.93 
 
 
1028 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  29.59 
 
 
1040 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  29.29 
 
 
1001 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  29.36 
 
 
1089 aa  374  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  29.04 
 
 
1077 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  29.06 
 
 
1062 aa  363  6e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  29.06 
 
 
1062 aa  363  6e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  28.18 
 
 
1013 aa  363  9e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  30.62 
 
 
681 aa  215  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4635  MMPL domain-containing protein  31.8 
 
 
470 aa  190  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12956  transmembrane transport protein mmpL7  23.62 
 
 
920 aa  182  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  27.62 
 
 
1054 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  24.37 
 
 
974 aa  134  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  22.34 
 
 
1109 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  23.14 
 
 
981 aa  132  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  24.53 
 
 
974 aa  132  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  22.55 
 
 
1109 aa  132  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  25.28 
 
 
1040 aa  126  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  25.87 
 
 
1041 aa  125  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  33.89 
 
 
702 aa  124  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  25.29 
 
 
1038 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  27.01 
 
 
1038 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0814  hypothetical protein  26.02 
 
 
1002 aa  122  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  25.58 
 
 
1041 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  36.07 
 
 
576 aa  121  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2949  putative membrane protein, MmpL family  26.07 
 
 
888 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4025e-34 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  30.03 
 
 
764 aa  120  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  36.51 
 
 
702 aa  119  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  23.51 
 
 
1049 aa  118  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  25.67 
 
 
1038 aa  118  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  29.03 
 
 
713 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  34.04 
 
 
778 aa  116  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  35.48 
 
 
780 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  33.89 
 
 
775 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  36.95 
 
 
701 aa  114  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  34.82 
 
 
753 aa  114  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  25.85 
 
 
1038 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  32.5 
 
 
709 aa  114  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  34.19 
 
 
682 aa  112  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  31.06 
 
 
750 aa  111  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  24.78 
 
 
1038 aa  111  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  34.06 
 
 
745 aa  111  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1580  hypothetical protein  35.64 
 
 
869 aa  110  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000620673 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  30.56 
 
 
339 aa  110  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  29.57 
 
 
882 aa  109  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  32.98 
 
 
733 aa  110  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  35.75 
 
 
713 aa  109  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  38.1 
 
 
714 aa  110  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  30 
 
 
747 aa  109  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  38.01 
 
 
699 aa  109  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  28.96 
 
 
743 aa  108  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  28.96 
 
 
743 aa  108  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  29.79 
 
 
743 aa  108  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  26.68 
 
 
1068 aa  108  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  28.96 
 
 
743 aa  108  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  28.96 
 
 
743 aa  108  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  28.79 
 
 
743 aa  108  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  28.79 
 
 
743 aa  107  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  34.36 
 
 
714 aa  107  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  42.95 
 
 
673 aa  107  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  34.47 
 
 
712 aa  107  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1013  hypothetical protein  32.26 
 
 
860 aa  106  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000218575 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  28.46 
 
 
743 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  29.2 
 
 
743 aa  105  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>