More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3356 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 708 aa  1336    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  87.43 
 
 		 707 aa  1046    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  51.42 
 
 		 576 aa  473  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  42.71 
 
 		 745 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  46.66 
 
 		 674 aa  432  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  46.66 
 
 		 674 aa  432  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  46.66 
 
 		 674 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  48.5 
 
 		 679 aa  421  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  43.56 
 
 		 699 aa  419  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  49.35 
 
 		 673 aa  402  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  50 
 
 		 686 aa  402  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  48.1 
 
 		 678 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  43.37 
 
 		 711 aa  390  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  40.54 
 
 		 713 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  42.33 
 
 		 699 aa  382  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  41.79 
 
 		 682 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  39.29 
 
 		 702 aa  367  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  40.28 
 
 		 709 aa  362  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  41.82 
 
 		 701 aa  359  9e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  37.73 
 
 		 753 aa  357  5.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  40.63 
 
 		 699 aa  356  7.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  39.88 
 
 		 706 aa  344  4e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  38.44 
 
 		 737 aa  339  9e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  43.43 
 
 		 700 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  36.39 
 
 		 730 aa  336  9e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  39.27 
 
 		 733 aa  333  6e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  38.06 
 
 		 702 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  37.22 
 
 		 712 aa  326  9e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  41.28 
 
 		 697 aa  326  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  40.06 
 
 		 714 aa  324  3e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  40.06 
 
 		 778 aa  319  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  39.01 
 
 		 780 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  38.9 
 
 		 775 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  32.79 
 
 		 743 aa  301  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  32.79 
 
 		 743 aa  301  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  39.41 
 
 		 812 aa  299  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  38.68 
 
 		 714 aa  297  5e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  32.56 
 
 		 743 aa  296  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  32.24 
 
 		 743 aa  294  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  32.24 
 
 		 743 aa  295  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  32.15 
 
 		 743 aa  293  8e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  32.11 
 
 		 743 aa  292  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  38.16 
 
 		 777 aa  293  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  38.72 
 
 		 713 aa  293  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  31.92 
 
 		 743 aa  290  9e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  40.29 
 
 		 727 aa  287  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  31.84 
 
 		 743 aa  286  7e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  38.61 
 
 		 750 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  41.44 
 
 		 704 aa  284  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  32.24 
 
 		 743 aa  282  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  27.23 
 
 		 713 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  39.02 
 
 		 762 aa  270  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  40.31 
 
 		 764 aa  261  3e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  33.38 
 
 		 712 aa  251  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  30.92 
 
 		 723 aa  234  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  28.24 
 
 		 882 aa  200  6e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  34.03 
 
 		 747 aa  194  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  30.29 
 
 		 719 aa  190  9e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0027  MMPL domain protein  40.65 
 
 		 352 aa  185  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.232375 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  41.93 
 
 		 339 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  28.57 
 
 		 740 aa  178  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  30.64 
 
 		 726 aa  172  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.2 
 
 		 736 aa  171  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  39.74 
 
 		 358 aa  169  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  28.69 
 
 		 717 aa  164  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  27.89 
 
 		 737 aa  159  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  32.83 
 
 		 724 aa  151  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  27.65 
 
 		 846 aa  147  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  30.26 
 
 		 718 aa  145  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  37.85 
 
 		 1077 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  26.47 
 
 		 740 aa  138  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  27.57 
 
 		 758 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  28.24 
 
 		 766 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  26.25 
 
 		 779 aa  132  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  30.6 
 
 		 983 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  30.6 
 
 		 983 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  27.38 
 
 		 836 aa  130  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  26.19 
 
 		 710 aa  130  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  39.46 
 
 		 974 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  30.8 
 
 		 979 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  31.78 
 
 		 726 aa  127  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  27.87 
 
 		 978 aa  127  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  29.02 
 
 		 738 aa  127  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  27.58 
 
 		 981 aa  127  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  30.16 
 
 		 723 aa  127  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  30.1 
 
 		 731 aa  125  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  37.24 
 
 		 974 aa  125  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  35.08 
 
 		 1146 aa  125  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  31.7 
 
 		 743 aa  124  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  27.72 
 
 		 741 aa  123  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  23.4 
 
 		 997 aa  123  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7301  MmpL domain-containing protein  31.06 
 
 		 704 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.573175  normal  0.0728725 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  29.51 
 
 		 968 aa  122  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  26.45 
 
 		 743 aa  121  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  26.67 
 
 		 749 aa  120  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  27.65 
 
 		 781 aa  120  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1952  MMPL domain-containing protein  27.77 
 
 		 729 aa  120  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0752797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7430  MMPL domain protein  26.74 
 
 		 744 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  43.23 
 
 		 1001 aa  121  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  28.89 
 
 		 966 aa  120  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>