More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3564 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  59.07 
 
 		 777 aa  670    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  100 
 
 		 727 aa  1370    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  46.96 
 
 		 753 aa  561  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  47.44 
 
 		 737 aa  562  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  50.63 
 
 		 699 aa  555  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  50.49 
 
 		 682 aa  541  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  49.73 
 
 		 775 aa  524  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  49.02 
 
 		 733 aa  521  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  49.79 
 
 		 697 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  46.88 
 
 		 780 aa  498  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  45.08 
 
 		 702 aa  479  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  49.65 
 
 		 700 aa  477  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  43.56 
 
 		 702 aa  478  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  49.65 
 
 		 750 aa  476  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  43.45 
 
 		 699 aa  462  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  48.43 
 
 		 764 aa  459  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  50.42 
 
 		 762 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  42.84 
 
 		 706 aa  443  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  44.62 
 
 		 714 aa  442  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  44.63 
 
 		 713 aa  438  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  46.22 
 
 		 714 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  46.37 
 
 		 701 aa  433  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  43.79 
 
 		 745 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  43.48 
 
 		 778 aa  425  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  42.13 
 
 		 709 aa  407  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  40.67 
 
 		 712 aa  402  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  40 
 
 		 699 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  37.4 
 
 		 730 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  42.9 
 
 		 713 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.52 
 
 		 812 aa  347  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  41.92 
 
 		 576 aa  342  2e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  40.6 
 
 		 674 aa  334  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  40.6 
 
 		 674 aa  334  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  40.3 
 
 		 674 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  41.94 
 
 		 707 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  41.68 
 
 		 704 aa  307  5.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  40.51 
 
 		 678 aa  299  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  41.06 
 
 		 679 aa  296  9e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  30.26 
 
 		 713 aa  289  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  41.68 
 
 		 711 aa  284  5.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  52.71 
 
 		 339 aa  283  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  40.57 
 
 		 708 aa  272  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  40.33 
 
 		 673 aa  271  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  48.35 
 
 		 358 aa  263  6.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  29.93 
 
 		 743 aa  263  8.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  29.93 
 
 		 743 aa  263  8.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  30.17 
 
 		 743 aa  263  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  30.04 
 
 		 743 aa  262  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  30.07 
 
 		 743 aa  261  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  29.87 
 
 		 743 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  30.07 
 
 		 743 aa  260  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  30.01 
 
 		 743 aa  260  7e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  40.63 
 
 		 686 aa  258  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  29.76 
 
 		 743 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  29.93 
 
 		 743 aa  247  6e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  35.36 
 
 		 712 aa  223  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  31.93 
 
 		 778 aa  201  3e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  32.18 
 
 		 747 aa  197  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  29.62 
 
 		 882 aa  197  6e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  28.37 
 
 		 723 aa  192  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  28.69 
 
 		 740 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  31.25 
 
 		 726 aa  187  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  31.47 
 
 		 719 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  30.54 
 
 		 717 aa  170  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  29.11 
 
 		 741 aa  160  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  38.56 
 
 		 981 aa  159  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  39.46 
 
 		 974 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  38.77 
 
 		 974 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  39.57 
 
 		 1146 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  28.7 
 
 		 758 aa  145  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  26.65 
 
 		 737 aa  145  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  32.05 
 
 		 740 aa  145  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  32.58 
 
 		 724 aa  142  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  29.11 
 
 		 718 aa  141  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  27.21 
 
 		 741 aa  140  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.05 
 
 		 736 aa  140  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  25.36 
 
 		 997 aa  139  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  29.18 
 
 		 726 aa  138  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  27.17 
 
 		 796 aa  137  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  35.23 
 
 		 1077 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  40.5 
 
 		 998 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  40.5 
 
 		 998 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  40.5 
 
 		 998 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  33.07 
 
 		 1109 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6982  MMPL domain protein  27.48 
 
 		 794 aa  135  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  32.68 
 
 		 1109 aa  134  6e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  30.64 
 
 		 979 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  30.64 
 
 		 983 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  30.64 
 
 		 983 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1952  MMPL domain-containing protein  26.53 
 
 		 729 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0752797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  31 
 
 		 842 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  37.18 
 
 		 1011 aa  132  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  29.94 
 
 		 731 aa  132  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  36.44 
 
 		 945 aa  131  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  36.44 
 
 		 945 aa  131  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  29.69 
 
 		 729 aa  130  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  30.96 
 
 		 766 aa  130  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  27.11 
 
 		 740 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  31.39 
 
 		 1040 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  28.07 
 
 		 743 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>