More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0335 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  54.91 
 
 		 733 aa  666    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  100 
 
 		 702 aa  1377    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  50.86 
 
 		 753 aa  654    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  49.17 
 
 		 737 aa  631  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  51.51 
 
 		 682 aa  601  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  51.89 
 
 		 699 aa  597  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  47.35 
 
 		 697 aa  521  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  47.43 
 
 		 775 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  46.5 
 
 		 780 aa  511  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  43.71 
 
 		 702 aa  473  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  44.38 
 
 		 764 aa  469  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  45.34 
 
 		 714 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  46.08 
 
 		 700 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  42.22 
 
 		 713 aa  450  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  44.14 
 
 		 701 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  46.16 
 
 		 762 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  43.25 
 
 		 777 aa  444  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  40.4 
 
 		 699 aa  438  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  42.86 
 
 		 750 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  41.34 
 
 		 699 aa  435  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  43.52 
 
 		 778 aa  425  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  45.04 
 
 		 714 aa  420  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  39.77 
 
 		 706 aa  420  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  43.28 
 
 		 727 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  41.59 
 
 		 745 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  37.89 
 
 		 730 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  41.84 
 
 		 709 aa  409  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  38.63 
 
 		 712 aa  385  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.07 
 
 		 812 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  40.23 
 
 		 707 aa  348  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  41.09 
 
 		 576 aa  346  8e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  39 
 
 		 713 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  38.79 
 
 		 674 aa  320  5e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  38.47 
 
 		 674 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  38.47 
 
 		 674 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  39.2 
 
 		 673 aa  316  9e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  54.01 
 
 		 339 aa  314  3.9999999999999997e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  31.49 
 
 		 713 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  40.41 
 
 		 708 aa  291  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  38.25 
 
 		 679 aa  288  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  38.05 
 
 		 704 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  48.8 
 
 		 358 aa  285  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  38.49 
 
 		 678 aa  284  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  37.63 
 
 		 686 aa  279  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  35.2 
 
 		 711 aa  271  2e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  36.33 
 
 		 712 aa  261  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  35.35 
 
 		 743 aa  248  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  35.35 
 
 		 743 aa  248  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  35.51 
 
 		 743 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  35.35 
 
 		 743 aa  247  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  35.17 
 
 		 743 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  35.64 
 
 		 743 aa  243  9e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  35.51 
 
 		 743 aa  241  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  35.46 
 
 		 743 aa  240  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  34.75 
 
 		 743 aa  239  9e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  35.52 
 
 		 743 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  28.02 
 
 		 723 aa  201  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  31.78 
 
 		 747 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  31.09 
 
 		 726 aa  193  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  29.62 
 
 		 882 aa  189  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  27.31 
 
 		 719 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  33.94 
 
 		 974 aa  164  7e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  26.34 
 
 		 740 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.93 
 
 		 736 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  29.48 
 
 		 718 aa  154  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  26.82 
 
 		 717 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  28.31 
 
 		 758 aa  151  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  24.49 
 
 		 997 aa  149  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  28.23 
 
 		 966 aa  146  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  28.48 
 
 		 983 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  28.48 
 
 		 983 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  28.48 
 
 		 979 aa  147  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  25.89 
 
 		 832 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  30.93 
 
 		 741 aa  145  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  27.32 
 
 		 738 aa  145  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  29.67 
 
 		 723 aa  145  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  26.53 
 
 		 781 aa  144  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  36.65 
 
 		 981 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  31.08 
 
 		 974 aa  141  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  43.46 
 
 		 1077 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  25.97 
 
 		 920 aa  140  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0161  hypothetical protein  28.22 
 
 		 934 aa  140  6e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.703618 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  28.77 
 
 		 717 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  25.89 
 
 		 740 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2167  RND superfamily drug efflux protein  29.91 
 
 		 825 aa  137  5e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00341827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  41.08 
 
 		 1146 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  26.41 
 
 		 737 aa  137  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  27.85 
 
 		 728 aa  136  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  27.79 
 
 		 842 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  26.79 
 
 		 740 aa  134  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  29.27 
 
 		 731 aa  133  9e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  27.75 
 
 		 729 aa  133  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  28.08 
 
 		 724 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  27.84 
 
 		 836 aa  133  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  37.67 
 
 		 959 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  30.62 
 
 		 726 aa  132  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  25.82 
 
 		 735 aa  131  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  28.6 
 
 		 740 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  26.85 
 
 		 734 aa  130  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3339  MmpL domain-containing protein  27.73 
 
 		 732 aa  130  9.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0617981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>