More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0790 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  78.17 
 
 
981 aa  1555    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  100 
 
 
974 aa  1969    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  80.39 
 
 
974 aa  1566    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  26.1 
 
 
1013 aa  264  6e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0890  MMPL domain protein  25.41 
 
 
1026 aa  254  8.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000250771  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  23.82 
 
 
944 aa  247  8e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  25.77 
 
 
1028 aa  241  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  23.6 
 
 
945 aa  240  8e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  23.6 
 
 
945 aa  240  8e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  25.69 
 
 
1040 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  22.65 
 
 
962 aa  239  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  24.41 
 
 
1022 aa  237  9e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  24.41 
 
 
1022 aa  237  9e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11778  MmpL family membrane protein  24.41 
 
 
945 aa  233  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000786949  decreased coverage  0.0000000000113435 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  21.81 
 
 
967 aa  231  5e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2705  transport protein  23.3 
 
 
957 aa  227  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10518  transmembrane transport protein mmpL2  22.53 
 
 
968 aa  227  8e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.930398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  21.44 
 
 
959 aa  224  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10407  transmembrane transport protein mmpL1  22.22 
 
 
958 aa  219  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.665513  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1057  transport protein  21.59 
 
 
963 aa  207  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  28.69 
 
 
1054 aa  201  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  26.32 
 
 
1040 aa  197  6e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  27.73 
 
 
1013 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  24.3 
 
 
1049 aa  187  9e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  25.05 
 
 
1011 aa  177  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  35.55 
 
 
713 aa  175  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  27 
 
 
1002 aa  171  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  37.04 
 
 
1146 aa  171  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  27.9 
 
 
726 aa  170  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  26.24 
 
 
1068 aa  167  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  35.29 
 
 
1077 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  25.21 
 
 
1109 aa  165  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  31.45 
 
 
1109 aa  164  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  26.6 
 
 
743 aa  160  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  33.33 
 
 
882 aa  159  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  39.91 
 
 
743 aa  159  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  40.36 
 
 
743 aa  158  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  39.91 
 
 
743 aa  158  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  40.36 
 
 
743 aa  158  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  40.36 
 
 
743 aa  158  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  40.36 
 
 
743 aa  158  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  26.99 
 
 
998 aa  155  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  26.99 
 
 
998 aa  155  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  26.99 
 
 
998 aa  155  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  39.46 
 
 
743 aa  155  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  26.02 
 
 
1089 aa  154  8e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  40.36 
 
 
743 aa  154  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  39.74 
 
 
743 aa  154  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  23.22 
 
 
1003 aa  153  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  38.64 
 
 
730 aa  152  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0814  hypothetical protein  27.32 
 
 
1002 aa  150  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  25.59 
 
 
1000 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  33.73 
 
 
747 aa  149  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  28.1 
 
 
709 aa  149  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  37.8 
 
 
1001 aa  149  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  24.72 
 
 
723 aa  149  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  37.61 
 
 
699 aa  147  8.000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  34.96 
 
 
1062 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  34.96 
 
 
1062 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  27.31 
 
 
713 aa  145  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  25 
 
 
1038 aa  145  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  25.47 
 
 
745 aa  144  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  34.96 
 
 
750 aa  145  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  34.73 
 
 
712 aa  144  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  26.17 
 
 
1038 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  36.12 
 
 
576 aa  142  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  26.6 
 
 
1038 aa  142  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  38.89 
 
 
753 aa  142  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  29.47 
 
 
740 aa  141  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  36.28 
 
 
714 aa  141  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  31.08 
 
 
702 aa  140  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  38.7 
 
 
682 aa  140  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  36.56 
 
 
339 aa  139  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  21.7 
 
 
1246 aa  139  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  37.1 
 
 
714 aa  139  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  38.46 
 
 
733 aa  139  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  38.01 
 
 
697 aa  138  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1614  transport protein  22.67 
 
 
968 aa  138  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  35.62 
 
 
699 aa  138  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4825  transport protein  23.4 
 
 
1001 aa  138  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  39.39 
 
 
701 aa  137  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  38.99 
 
 
737 aa  137  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  25.53 
 
 
1041 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  25.74 
 
 
1041 aa  135  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  39.46 
 
 
727 aa  135  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  35.71 
 
 
673 aa  135  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  24.6 
 
 
681 aa  135  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  37.3 
 
 
764 aa  135  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3401  transport protein  23.32 
 
 
955 aa  135  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.057109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3464  transport protein  23.32 
 
 
955 aa  135  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0593599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3412  transport protein  23.32 
 
 
955 aa  135  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0674616  normal  0.562796 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  30.67 
 
 
941 aa  134  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  25.53 
 
 
1038 aa  134  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2741  hypothetical protein  25.53 
 
 
810 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  24.37 
 
 
948 aa  134  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  36.53 
 
 
702 aa  133  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  26.57 
 
 
699 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  25.53 
 
 
1038 aa  132  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  36.2 
 
 
712 aa  131  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  35.37 
 
 
706 aa  130  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>