More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3419 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 714 aa  1380    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  57.8 
 
 		 706 aa  728    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  58.42 
 
 		 699 aa  733    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  86.96 
 
 		 714 aa  993    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  51.8 
 
 		 699 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  51.34 
 
 		 682 aa  604  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  50.73 
 
 		 713 aa  579  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  51.93 
 
 		 702 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  48.74 
 
 		 753 aa  575  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  48.46 
 
 		 737 aa  564  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  46.96 
 
 		 745 aa  543  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  48.64 
 
 		 778 aa  541  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  47.39 
 
 		 775 aa  537  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  48.23 
 
 		 733 aa  532  1e-150  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  43.78 
 
 		 730 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  45.27 
 
 		 699 aa  524  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  48.06 
 
 		 780 aa  519  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  49.33 
 
 		 701 aa  522  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  45.34 
 
 		 702 aa  511  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  48.85 
 
 		 750 aa  496  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  47.1 
 
 		 697 aa  489  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  45.35 
 
 		 709 aa  484  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  43.3 
 
 		 712 aa  482  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  44.97 
 
 		 777 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  41.96 
 
 		 812 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  46.14 
 
 		 764 aa  466  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  45.79 
 
 		 713 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  47.25 
 
 		 762 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  44.62 
 
 		 727 aa  449  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  47.56 
 
 		 700 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  43.44 
 
 		 576 aa  400  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  42.02 
 
 		 707 aa  371  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  41.19 
 
 		 674 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  41.19 
 
 		 674 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  41.19 
 
 		 674 aa  366  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  42.76 
 
 		 704 aa  353  5e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  41.18 
 
 		 686 aa  341  2.9999999999999998e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  42.52 
 
 		 679 aa  340  5e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  41.21 
 
 		 678 aa  334  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  39.73 
 
 		 708 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  38.66 
 
 		 711 aa  303  7.000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  29.67 
 
 		 713 aa  298  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  51.08 
 
 		 358 aa  293  9e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  33.86 
 
 		 712 aa  289  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  32.64 
 
 		 743 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  32.5 
 
 		 743 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  32.5 
 
 		 743 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  32.64 
 
 		 743 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  32.64 
 
 		 743 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  38.23 
 
 		 673 aa  284  5.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  32.5 
 
 		 743 aa  283  9e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  31.94 
 
 		 743 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  31.42 
 
 		 743 aa  281  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  32.08 
 
 		 743 aa  281  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  50.14 
 
 		 339 aa  280  7e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  32.73 
 
 		 743 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  30.79 
 
 		 882 aa  225  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  30.04 
 
 		 723 aa  220  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  30.45 
 
 		 726 aa  211  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  32.03 
 
 		 747 aa  207  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  32.28 
 
 		 778 aa  196  9e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  29.33 
 
 		 719 aa  192  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  27.81 
 
 		 740 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  29.51 
 
 		 836 aa  166  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  37.44 
 
 		 974 aa  161  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  27.57 
 
 		 717 aa  160  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  28.1 
 
 		 781 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  25.65 
 
 		 758 aa  155  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  27.13 
 
 		 737 aa  154  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  37.1 
 
 		 974 aa  151  4e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  34.58 
 
 		 981 aa  150  9e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.54 
 
 		 736 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.21 
 
 		 738 aa  146  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  29.35 
 
 		 729 aa  145  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  29.49 
 
 		 842 aa  144  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  29.56 
 
 		 718 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  26.21 
 
 		 743 aa  142  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  30.17 
 
 		 724 aa  141  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  27.9 
 
 		 735 aa  140  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  24.72 
 
 		 997 aa  140  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  26.61 
 
 		 704 aa  140  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  26.47 
 
 		 920 aa  138  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  41.45 
 
 		 1077 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  30.06 
 
 		 726 aa  138  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  29.84 
 
 		 966 aa  137  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  40.19 
 
 		 1146 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  31.36 
 
 		 714 aa  134  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  26.81 
 
 		 746 aa  134  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  30.19 
 
 		 741 aa  133  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  27.51 
 
 		 749 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  26.47 
 
 		 752 aa  131  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  42.21 
 
 		 1001 aa  131  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  26.94 
 
 		 832 aa  130  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0027  MMPL domain protein  34.8 
 
 		 352 aa  130  9.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.232375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  44.55 
 
 		 998 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  26.32 
 
 		 710 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  44.55 
 
 		 998 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  26.39 
 
 		 734 aa  130  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  44.55 
 
 		 998 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  26.02 
 
 		 740 aa  128  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>