More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4975 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  100 
 
 		 682 aa  1317    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  54.01 
 
 		 753 aa  654    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  69.48 
 
 		 699 aa  840    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  54.22 
 
 		 737 aa  633  1e-180  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  51.51 
 
 		 702 aa  596  1e-169  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  51.42 
 
 		 780 aa  591  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  52.13 
 
 		 775 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  52.54 
 
 		 733 aa  574  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  51.52 
 
 		 713 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  51.29 
 
 		 697 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  50.63 
 
 		 714 aa  548  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  49.43 
 
 		 702 aa  548  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  51.21 
 
 		 700 aa  531  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  51.52 
 
 		 750 aa  527  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  50.94 
 
 		 714 aa  515  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  44.19 
 
 		 730 aa  504  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  48.74 
 
 		 777 aa  501  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  50.15 
 
 		 701 aa  500  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  46.87 
 
 		 745 aa  496  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  44.81 
 
 		 699 aa  486  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  49.17 
 
 		 764 aa  485  1e-136  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  50 
 
 		 762 aa  479  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  44.87 
 
 		 699 aa  477  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  50.14 
 
 		 727 aa  477  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  43.23 
 
 		 706 aa  474  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  46.97 
 
 		 778 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  44.91 
 
 		 712 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  43.89 
 
 		 709 aa  447  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  39.69 
 
 		 812 aa  412  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  42.19 
 
 		 713 aa  386  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  63.61 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  64.63 
 
 		 339 aa  373  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  41.5 
 
 		 674 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  41.5 
 
 		 674 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  41.34 
 
 		 674 aa  359  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  42.42 
 
 		 576 aa  356  5.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  42.09 
 
 		 707 aa  350  4e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  42.34 
 
 		 704 aa  328  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  45.01 
 
 		 686 aa  325  1e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  43.17 
 
 		 673 aa  323  7e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  40.69 
 
 		 678 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  43.1 
 
 		 708 aa  310  6.999999999999999e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  41.98 
 
 		 679 aa  301  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  30.22 
 
 		 713 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  32.66 
 
 		 743 aa  274  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  32.66 
 
 		 743 aa  274  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  32.85 
 
 		 743 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  32.99 
 
 		 743 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  38.81 
 
 		 711 aa  273  9e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  32.99 
 
 		 743 aa  272  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  32.7 
 
 		 743 aa  271  4e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  32.12 
 
 		 743 aa  270  8.999999999999999e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  32.7 
 
 		 743 aa  269  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  32.85 
 
 		 743 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  32.7 
 
 		 743 aa  259  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  36.2 
 
 		 712 aa  252  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  28.07 
 
 		 723 aa  211  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  31 
 
 		 882 aa  202  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  33.82 
 
 		 719 aa  197  8.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  31.3 
 
 		 726 aa  194  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  29.36 
 
 		 740 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  31.05 
 
 		 747 aa  179  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  42.37 
 
 		 974 aa  171  6e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  34.75 
 
 		 981 aa  160  7e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  28.55 
 
 		 740 aa  159  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.33 
 
 		 736 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  38.7 
 
 		 974 aa  153  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  30.08 
 
 		 717 aa  151  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  47.93 
 
 		 1077 aa  144  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  27.64 
 
 		 997 aa  144  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  37.95 
 
 		 1146 aa  140  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1013  hypothetical protein  28.48 
 
 		 860 aa  140  7e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000218575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  29.66 
 
 		 718 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1580  hypothetical protein  29.32 
 
 		 869 aa  140  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000620673 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0161  hypothetical protein  27.43 
 
 		 934 aa  139  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.703618 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  35.71 
 
 		 959 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.49 
 
 		 746 aa  134  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  27.99 
 
 		 758 aa  134  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  27.1 
 
 		 836 aa  134  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  28.66 
 
 		 736 aa  134  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  28.23 
 
 		 723 aa  133  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  30.29 
 
 		 983 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  30.29 
 
 		 983 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  33.22 
 
 		 1054 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1643  hypothetical protein  30.69 
 
 		 866 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  29.71 
 
 		 979 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  31.1 
 
 		 962 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  30.12 
 
 		 741 aa  130  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  35.1 
 
 		 941 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  42.64 
 
 		 1001 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  38.22 
 
 		 945 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  38.22 
 
 		 945 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  44.3 
 
 		 1003 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  30.27 
 
 		 714 aa  128  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  36.36 
 
 		 1011 aa  128  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  34.19 
 
 		 948 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3339  MmpL domain-containing protein  31.13 
 
 		 732 aa  127  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0617981 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  42.64 
 
 		 998 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  42.64 
 
 		 998 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  42.64 
 
 		 998 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>