More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3656 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 719 aa  1412    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  46.4 
 
 		 723 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  45.15 
 
 		 740 aa  523  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  45.31 
 
 		 726 aa  462  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  41.31 
 
 		 747 aa  441  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  38.07 
 
 		 736 aa  350  5e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  30.1 
 
 		 730 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  33.72 
 
 		 709 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  31.23 
 
 		 699 aa  252  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  31.02 
 
 		 745 aa  246  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  25.89 
 
 		 713 aa  234  5e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  31.73 
 
 		 713 aa  233  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  30.65 
 
 		 712 aa  231  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  32.03 
 
 		 576 aa  228  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  27.87 
 
 		 743 aa  225  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  27.93 
 
 		 743 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  27.93 
 
 		 743 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  33.02 
 
 		 674 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  33.02 
 
 		 674 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  27.96 
 
 		 743 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  27.96 
 
 		 743 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  28.1 
 
 		 743 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  31.59 
 
 		 699 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  32.26 
 
 		 674 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  26.88 
 
 		 743 aa  218  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  27.6 
 
 		 743 aa  217  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  27.83 
 
 		 743 aa  217  7e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  26.87 
 
 		 882 aa  217  8e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  31.92 
 
 		 701 aa  214  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  29.54 
 
 		 712 aa  214  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  34.06 
 
 		 682 aa  206  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  27.96 
 
 		 743 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  30.24 
 
 		 678 aa  204  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  30.51 
 
 		 699 aa  203  9e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  30.33 
 
 		 723 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  28.22 
 
 		 778 aa  201  3.9999999999999996e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  28.14 
 
 		 743 aa  194  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  31.02 
 
 		 679 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  28.75 
 
 		 737 aa  192  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  29.72 
 
 		 706 aa  191  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  28.81 
 
 		 711 aa  189  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.59 
 
 		 697 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  24.72 
 
 		 829 aa  187  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.54 
 
 		 812 aa  187  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  24.72 
 
 		 829 aa  187  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  27.42 
 
 		 753 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  28.67 
 
 		 737 aa  184  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  27.88 
 
 		 702 aa  180  5.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  29.93 
 
 		 780 aa  179  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  24.72 
 
 		 893 aa  178  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  29.26 
 
 		 750 aa  178  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  32.63 
 
 		 686 aa  176  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  29.12 
 
 		 707 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  28.42 
 
 		 734 aa  174  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  29.38 
 
 		 714 aa  174  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  31.23 
 
 		 775 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  27.96 
 
 		 920 aa  170  8e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  27 
 
 		 836 aa  167  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  27.65 
 
 		 832 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  28.93 
 
 		 702 aa  165  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  25.33 
 
 		 974 aa  163  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  29.91 
 
 		 728 aa  163  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  28.26 
 
 		 673 aa  162  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  29.06 
 
 		 700 aa  161  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  30.06 
 
 		 727 aa  162  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  28.95 
 
 		 729 aa  161  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  28.12 
 
 		 755 aa  161  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  26.35 
 
 		 974 aa  161  4e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  27.37 
 
 		 761 aa  159  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  29.79 
 
 		 854 aa  159  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  26.63 
 
 		 981 aa  157  6e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  23.01 
 
 		 704 aa  157  8e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  25.33 
 
 		 772 aa  157  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  25.33 
 
 		 772 aa  157  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  27.63 
 
 		 717 aa  156  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  25.89 
 
 		 772 aa  157  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  26.54 
 
 		 758 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  25.1 
 
 		 760 aa  151  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.09 
 
 		 746 aa  151  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  26.1 
 
 		 752 aa  150  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  28.81 
 
 		 764 aa  150  6e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  24.93 
 
 		 737 aa  150  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  33.33 
 
 		 714 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  26.16 
 
 		 737 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  28.51 
 
 		 1002 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  27.42 
 
 		 1146 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  26.58 
 
 		 983 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  26.58 
 
 		 983 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  26.75 
 
 		 735 aa  149  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  30.27 
 
 		 708 aa  148  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  31.88 
 
 		 732 aa  148  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  25.9 
 
 		 749 aa  148  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  26.58 
 
 		 979 aa  148  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  28.81 
 
 		 704 aa  148  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  27.46 
 
 		 731 aa  147  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  26.74 
 
 		 735 aa  147  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  27.13 
 
 		 734 aa  147  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  27.58 
 
 		 1013 aa  146  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  28.65 
 
 		 733 aa  146  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  29.41 
 
 		 778 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>