More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3796 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  57.74 
 
 		 699 aa  722    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  57.55 
 
 		 706 aa  721    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  86.96 
 
 		 714 aa  1073    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 714 aa  1377    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  50.65 
 
 		 699 aa  603  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  51.59 
 
 		 682 aa  598  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  50.35 
 
 		 713 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  51.57 
 
 		 702 aa  578  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  48.03 
 
 		 753 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  47.98 
 
 		 737 aa  560  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  48.49 
 
 		 778 aa  545  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  47.39 
 
 		 775 aa  530  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  46.61 
 
 		 745 aa  527  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  44.33 
 
 		 730 aa  524  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  48.89 
 
 		 701 aa  519  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  47.98 
 
 		 733 aa  522  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  44.32 
 
 		 699 aa  508  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  46.97 
 
 		 780 aa  505  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  45.04 
 
 		 702 aa  501  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  47.23 
 
 		 697 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  47.91 
 
 		 750 aa  488  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  45.37 
 
 		 777 aa  484  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  45.3 
 
 		 709 aa  483  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  43.55 
 
 		 712 aa  479  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  42.03 
 
 		 812 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  46.22 
 
 		 727 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  45.51 
 
 		 713 aa  463  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  44.7 
 
 		 764 aa  461  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  46.57 
 
 		 762 aa  450  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  47.04 
 
 		 700 aa  437  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  43.39 
 
 		 576 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  40.36 
 
 		 707 aa  363  7.0000000000000005e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  40.85 
 
 		 674 aa  362  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  40.85 
 
 		 674 aa  362  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  40.85 
 
 		 674 aa  362  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  42.35 
 
 		 679 aa  341  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  41.14 
 
 		 704 aa  333  5e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  40.12 
 
 		 678 aa  326  8.000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  40.3 
 
 		 686 aa  322  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  40.18 
 
 		 708 aa  310  4e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  41.19 
 
 		 711 aa  310  9e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  38.11 
 
 		 673 aa  293  7e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  50.46 
 
 		 358 aa  290  7e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  28.53 
 
 		 713 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  34.49 
 
 		 712 aa  284  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  32.68 
 
 		 743 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  32.68 
 
 		 743 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  32.68 
 
 		 743 aa  282  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  32.54 
 
 		 743 aa  280  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  32.45 
 
 		 743 aa  280  8e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  31.89 
 
 		 743 aa  280  8e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  31.98 
 
 		 743 aa  280  9e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  32.31 
 
 		 743 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  48.71 
 
 		 339 aa  277  4e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  31.98 
 
 		 743 aa  277  6e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  33.15 
 
 		 743 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  30.35 
 
 		 882 aa  226  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  32.65 
 
 		 726 aa  223  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  29.21 
 
 		 723 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  33.74 
 
 		 747 aa  215  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  31.49 
 
 		 719 aa  203  7e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  32.4 
 
 		 778 aa  201  5e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  29.21 
 
 		 740 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  29.01 
 
 		 717 aa  171  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  30.53 
 
 		 974 aa  167  8e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  30.24 
 
 		 981 aa  159  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  36.28 
 
 		 974 aa  155  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.24 
 
 		 736 aa  153  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  28.14 
 
 		 737 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  30.7 
 
 		 729 aa  151  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  27.9 
 
 		 836 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  28.37 
 
 		 781 aa  148  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  30.25 
 
 		 718 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  30.12 
 
 		 726 aa  147  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  30.34 
 
 		 724 aa  145  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  26.99 
 
 		 997 aa  144  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.09 
 
 		 738 aa  142  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  40.18 
 
 		 1146 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  29.34 
 
 		 842 aa  141  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  27.89 
 
 		 710 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  25.39 
 
 		 758 aa  139  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  26.4 
 
 		 743 aa  138  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  26.96 
 
 		 746 aa  137  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  24.61 
 
 		 704 aa  137  6.0000000000000005e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  26.58 
 
 		 740 aa  137  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  39.58 
 
 		 1077 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  29.73 
 
 		 732 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  25.93 
 
 		 920 aa  133  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  29.69 
 
 		 1040 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  28.96 
 
 		 832 aa  131  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  29.6 
 
 		 966 aa  130  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  29.76 
 
 		 723 aa  130  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  30.24 
 
 		 854 aa  130  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  43.08 
 
 		 1001 aa  130  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  28.47 
 
 		 732 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  28.34 
 
 		 742 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  29.28 
 
 		 740 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  44.17 
 
 		 998 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  29.83 
 
 		 741 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  44.17 
 
 		 998 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>