More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3618 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 712 aa  1413    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  47.27 
 
 		 730 aa  595  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  50.86 
 
 		 701 aa  579  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  45.58 
 
 		 713 aa  528  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  44.8 
 
 		 709 aa  498  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  44.44 
 
 		 745 aa  491  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  40.67 
 
 		 812 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  43.68 
 
 		 699 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  44.21 
 
 		 702 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  44.84 
 
 		 682 aa  467  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  40.32 
 
 		 737 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  38.7 
 
 		 753 aa  443  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  41.63 
 
 		 699 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  43.3 
 
 		 778 aa  438  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  42.96 
 
 		 714 aa  437  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  40.87 
 
 		 699 aa  433  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  40.2 
 
 		 706 aa  422  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  40.03 
 
 		 780 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  41.32 
 
 		 713 aa  394  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  38.69 
 
 		 702 aa  393  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  37.99 
 
 		 733 aa  388  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  40.5 
 
 		 700 aa  384  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  41.44 
 
 		 697 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  42.44 
 
 		 714 aa  385  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  39.02 
 
 		 764 aa  376  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  40.11 
 
 		 775 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  42.04 
 
 		 576 aa  365  1e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  39.61 
 
 		 750 aa  361  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  40.36 
 
 		 727 aa  360  5e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  44.44 
 
 		 674 aa  353  7e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  44.44 
 
 		 674 aa  353  7e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  44.25 
 
 		 674 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  41.41 
 
 		 704 aa  343  8e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  39.7 
 
 		 762 aa  323  5e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  39.52 
 
 		 679 aa  317  4e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  40.8 
 
 		 686 aa  313  6.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  38.48 
 
 		 673 aa  310  8e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  38.63 
 
 		 678 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  37.18 
 
 		 707 aa  299  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  35.01 
 
 		 712 aa  293  8e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  36.81 
 
 		 711 aa  288  2.9999999999999996e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  29.96 
 
 		 713 aa  277  5e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  38.09 
 
 		 708 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  30.55 
 
 		 743 aa  266  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  30.42 
 
 		 743 aa  266  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  30.55 
 
 		 743 aa  266  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  30.55 
 
 		 743 aa  266  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  29.92 
 
 		 743 aa  262  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  30.55 
 
 		 743 aa  261  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  31.31 
 
 		 743 aa  260  7e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  30.83 
 
 		 743 aa  259  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  30.42 
 
 		 743 aa  256  7e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  30.42 
 
 		 743 aa  253  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  45.13 
 
 		 339 aa  244  5e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  41.37 
 
 		 358 aa  225  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  30.72 
 
 		 723 aa  220  7.999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  30.48 
 
 		 719 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  33.59 
 
 		 747 aa  214  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  35.56 
 
 		 777 aa  207  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  31.23 
 
 		 726 aa  205  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  29.14 
 
 		 740 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  27.8 
 
 		 781 aa  165  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.9 
 
 		 736 aa  163  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  31.47 
 
 		 761 aa  152  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  28.05 
 
 		 779 aa  150  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  27.78 
 
 		 766 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  27.89 
 
 		 740 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  26.09 
 
 		 743 aa  147  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  37.56 
 
 		 974 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.18 
 
 		 1382 aa  146  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  28.52 
 
 		 718 aa  146  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  24.48 
 
 		 829 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  24.48 
 
 		 829 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  32.98 
 
 		 981 aa  144  5e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  27.34 
 
 		 717 aa  141  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  40.27 
 
 		 1146 aa  140  8.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  27.1 
 
 		 920 aa  140  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  27.73 
 
 		 917 aa  140  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  38.89 
 
 		 1077 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  27.49 
 
 		 729 aa  139  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  36.49 
 
 		 974 aa  137  5e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  27.22 
 
 		 736 aa  136  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  25.89 
 
 		 710 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  28.67 
 
 		 737 aa  136  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  25 
 
 		 704 aa  135  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  27.22 
 
 		 737 aa  135  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  28.94 
 
 		 741 aa  135  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  40.27 
 
 		 1011 aa  134  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  30.89 
 
 		 723 aa  134  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  27.67 
 
 		 734 aa  133  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  26.91 
 
 		 760 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  25.65 
 
 		 732 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  26.74 
 
 		 733 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  34.87 
 
 		 962 aa  131  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  28.1 
 
 		 983 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  28.1 
 
 		 983 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  28.1 
 
 		 979 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  27.05 
 
 		 735 aa  130  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  28.42 
 
 		 832 aa  130  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  25.9 
 
 		 909 aa  130  7.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>