More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9047 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  100 
 
 		 697 aa  1340    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  64.47 
 
 		 750 aa  697    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  52.33 
 
 		 699 aa  588  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  50.99 
 
 		 753 aa  588  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  51.29 
 
 		 682 aa  576  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  49.72 
 
 		 737 aa  569  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  49.65 
 
 		 733 aa  545  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  47.35 
 
 		 702 aa  528  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  48.7 
 
 		 780 aa  522  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  48.64 
 
 		 775 aa  506  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  49.1 
 
 		 764 aa  491  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  48.42 
 
 		 700 aa  479  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  46.56 
 
 		 702 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  47.23 
 
 		 777 aa  474  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  49.93 
 
 		 727 aa  462  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  44.43 
 
 		 699 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  46.67 
 
 		 714 aa  452  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  43.42 
 
 		 706 aa  442  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  44.99 
 
 		 713 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  45.92 
 
 		 701 aa  431  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  47.48 
 
 		 762 aa  428  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  46.87 
 
 		 714 aa  427  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  39.89 
 
 		 730 aa  428  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  44.09 
 
 		 745 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  44.3 
 
 		 778 aa  413  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  41.44 
 
 		 712 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  41.27 
 
 		 699 aa  392  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  40.44 
 
 		 709 aa  379  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  42.19 
 
 		 713 aa  362  9e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.98 
 
 		 812 aa  352  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  43.7 
 
 		 576 aa  341  2e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  41.17 
 
 		 704 aa  328  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  42.18 
 
 		 707 aa  318  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  38.39 
 
 		 674 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  38.39 
 
 		 674 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  38.39 
 
 		 674 aa  316  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  40.2 
 
 		 673 aa  303  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  51.5 
 
 		 339 aa  292  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  41.02 
 
 		 679 aa  288  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  40.31 
 
 		 686 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  41.91 
 
 		 708 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  49.09 
 
 		 358 aa  273  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  32.38 
 
 		 713 aa  267  4e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  37.48 
 
 		 678 aa  267  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  30.24 
 
 		 743 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  30.57 
 
 		 743 aa  263  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  30.1 
 
 		 743 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  29.77 
 
 		 743 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  29.97 
 
 		 743 aa  261  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  29.97 
 
 		 743 aa  260  7e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  29.93 
 
 		 743 aa  260  7e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  29.93 
 
 		 743 aa  260  7e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  29.91 
 
 		 743 aa  259  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  30.6 
 
 		 743 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  37.5 
 
 		 711 aa  238  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  31.71 
 
 		 712 aa  222  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  29.73 
 
 		 723 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  31.68 
 
 		 778 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  29.92 
 
 		 747 aa  182  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  27.08 
 
 		 882 aa  181  5.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  28.02 
 
 		 740 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  29.76 
 
 		 719 aa  177  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  32.02 
 
 		 726 aa  177  9e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  29.35 
 
 		 717 aa  166  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  39.19 
 
 		 974 aa  165  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  28.08 
 
 		 718 aa  153  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  35.9 
 
 		 981 aa  150  7e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  42.86 
 
 		 1146 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  29.96 
 
 		 731 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  27.73 
 
 		 737 aa  148  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  27.89 
 
 		 710 aa  147  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  27.76 
 
 		 740 aa  147  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  29.46 
 
 		 729 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  38.01 
 
 		 974 aa  144  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  27.98 
 
 		 733 aa  144  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  24.72 
 
 		 758 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  30.72 
 
 		 741 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  39.2 
 
 		 945 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  39.2 
 
 		 945 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  28.05 
 
 		 723 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  27.3 
 
 		 779 aa  138  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  37.04 
 
 		 1077 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  29.74 
 
 		 735 aa  137  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  27.24 
 
 		 997 aa  135  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  29.57 
 
 		 796 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  29.61 
 
 		 726 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1952  MMPL domain-containing protein  29.35 
 
 		 729 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0752797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  32.8 
 
 		 762 aa  135  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3339  MmpL domain-containing protein  30 
 
 		 732 aa  135  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0617981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  39.39 
 
 		 1001 aa  134  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  29.87 
 
 		 749 aa  134  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  32.02 
 
 		 724 aa  133  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  37.71 
 
 		 998 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  28.28 
 
 		 738 aa  133  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  37.71 
 
 		 998 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  37.71 
 
 		 998 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  29.22 
 
 		 766 aa  132  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  39.13 
 
 		 1040 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  40.21 
 
 		 1000 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  26.95 
 
 		 738 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>