More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0271 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  56.59 
 
 
1002 aa  1116    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  88.42 
 
 
998 aa  1704    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  48.34 
 
 
1062 aa  919    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  39.71 
 
 
1022 aa  656    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  81.29 
 
 
1001 aa  1576    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  88.42 
 
 
998 aa  1704    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  48.34 
 
 
1062 aa  919    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  39.71 
 
 
1022 aa  656    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  52.17 
 
 
1089 aa  1022    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  100 
 
 
1000 aa  1985    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  41.75 
 
 
1003 aa  673    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  88.32 
 
 
998 aa  1702    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  48.73 
 
 
1077 aa  933    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  49.65 
 
 
1146 aa  966    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  40.26 
 
 
1040 aa  635    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  40.24 
 
 
1028 aa  634  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  40.22 
 
 
1013 aa  632  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  32.37 
 
 
1011 aa  463  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  32.58 
 
 
1013 aa  435  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  30.1 
 
 
967 aa  425  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  30.31 
 
 
941 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  30.07 
 
 
944 aa  419  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3435  transport protein  30.92 
 
 
968 aa  416  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541306  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3189  transport protein  30.64 
 
 
968 aa  413  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5174  transport protein  30.08 
 
 
968 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5263  transport protein  30.08 
 
 
968 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5555  transport protein  30.08 
 
 
968 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188099  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  29.74 
 
 
948 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2705  transport protein  30.94 
 
 
957 aa  405  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3401  transport protein  30.1 
 
 
955 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.057109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3464  transport protein  30.1 
 
 
955 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0593599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3412  transport protein  30.1 
 
 
955 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0674616  normal  0.562796 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4825  transport protein  29.73 
 
 
1001 aa  395  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  29.18 
 
 
962 aa  392  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  28.83 
 
 
945 aa  392  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  28.83 
 
 
945 aa  392  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1614  transport protein  29.17 
 
 
968 aa  391  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0481 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10690  transmembrane transport protein mmpL5  29.39 
 
 
964 aa  387  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  30.25 
 
 
959 aa  389  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10407  transmembrane transport protein mmpL1  28.73 
 
 
958 aa  382  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.665513  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10518  transmembrane transport protein mmpL2  29.51 
 
 
968 aa  368  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.930398 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1057  transport protein  27.99 
 
 
963 aa  345  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  40.77 
 
 
681 aa  342  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11778  MmpL family membrane protein  29.23 
 
 
945 aa  336  1e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000786949  decreased coverage  0.0000000000113435 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  24.72 
 
 
1109 aa  313  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  24.46 
 
 
1109 aa  310  5.9999999999999995e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4635  MMPL domain-containing protein  44.17 
 
 
470 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  25.57 
 
 
1054 aa  273  9e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  23.84 
 
 
1049 aa  265  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  24.36 
 
 
1040 aa  262  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  23.56 
 
 
1038 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  23.78 
 
 
1038 aa  238  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  23.69 
 
 
1041 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  23.94 
 
 
1038 aa  234  5e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  23.24 
 
 
1038 aa  231  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  23.31 
 
 
1041 aa  231  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  23.84 
 
 
1038 aa  229  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2949  putative membrane protein, MmpL family  24.78 
 
 
888 aa  204  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4025e-34 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11589  transmembrane transport protein mmpL6  40.3 
 
 
397 aa  197  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.9101799999999998e-86  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0890  MMPL domain protein  20.28 
 
 
1026 aa  183  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000250771  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  27.03 
 
 
981 aa  162  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  25.17 
 
 
974 aa  158  4e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  28.79 
 
 
1068 aa  157  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  38.15 
 
 
974 aa  157  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  43.3 
 
 
764 aa  149  4.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  41.04 
 
 
753 aa  148  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  44.21 
 
 
750 aa  144  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  38.71 
 
 
743 aa  144  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  38.71 
 
 
743 aa  144  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  38.71 
 
 
743 aa  144  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  38.71 
 
 
743 aa  144  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  38.31 
 
 
743 aa  144  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  35 
 
 
743 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2741  hypothetical protein  23.13 
 
 
810 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  36.99 
 
 
743 aa  140  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  37.5 
 
 
743 aa  140  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  37.75 
 
 
743 aa  138  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  38.71 
 
 
743 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  39.32 
 
 
709 aa  135  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  22.35 
 
 
1246 aa  135  5e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  40.61 
 
 
712 aa  135  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  31.15 
 
 
713 aa  134  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  41.28 
 
 
737 aa  133  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  39.82 
 
 
576 aa  132  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  35.81 
 
 
699 aa  132  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  30.47 
 
 
730 aa  131  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  39.83 
 
 
674 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  40.08 
 
 
745 aa  130  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  39.83 
 
 
674 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  39.83 
 
 
674 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  42.42 
 
 
780 aa  128  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  40.21 
 
 
697 aa  128  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  45.91 
 
 
713 aa  127  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  32 
 
 
882 aa  126  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  36.08 
 
 
673 aa  125  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  34.56 
 
 
702 aa  123  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  32.24 
 
 
740 aa  123  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  42.56 
 
 
702 aa  123  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  42.55 
 
 
733 aa  122  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  27.69 
 
 
723 aa  122  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>