More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11589 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11589  transmembrane transport protein mmpL6  100 
 
 
397 aa  789    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.9101799999999998e-86  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10518  transmembrane transport protein mmpL2  69.44 
 
 
968 aa  509  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.930398 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  64.31 
 
 
967 aa  483  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  64.09 
 
 
948 aa  481  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10690  transmembrane transport protein mmpL5  65.14 
 
 
964 aa  476  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  65.16 
 
 
941 aa  477  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3189  transport protein  64.36 
 
 
968 aa  473  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3401  transport protein  64 
 
 
955 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.057109  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5174  transport protein  60.76 
 
 
968 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3464  transport protein  64 
 
 
955 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0593599 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5263  transport protein  60.76 
 
 
968 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3412  transport protein  64 
 
 
955 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0674616  normal  0.562796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5555  transport protein  60.76 
 
 
968 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188099  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  63.11 
 
 
962 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3435  transport protein  65.71 
 
 
968 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541306  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  60.82 
 
 
959 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10407  transmembrane transport protein mmpL1  62.05 
 
 
958 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.665513  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1614  transport protein  61.38 
 
 
968 aa  449  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  60.86 
 
 
944 aa  450  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4825  transport protein  60.06 
 
 
1001 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2705  transport protein  59.94 
 
 
957 aa  435  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1057  transport protein  56.01 
 
 
963 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  50.86 
 
 
945 aa  364  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  50.86 
 
 
945 aa  364  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  35.07 
 
 
1146 aa  208  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  38.05 
 
 
1077 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  40.3 
 
 
1000 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  39.73 
 
 
1003 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  39.39 
 
 
998 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  39.39 
 
 
998 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  39.39 
 
 
998 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11778  MmpL family membrane protein  40.16 
 
 
945 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000786949  decreased coverage  0.0000000000113435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  38.54 
 
 
1001 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  33.87 
 
 
1002 aa  190  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  38.19 
 
 
1011 aa  188  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  37.62 
 
 
1062 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  37.62 
 
 
1062 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  38.44 
 
 
1022 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  38.44 
 
 
1022 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  39.74 
 
 
1040 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4635  MMPL domain-containing protein  39.53 
 
 
470 aa  182  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  39.53 
 
 
1028 aa  182  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  40.55 
 
 
1013 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  37.23 
 
 
1089 aa  168  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  39.54 
 
 
1013 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  27.8 
 
 
1041 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  26.52 
 
 
974 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  26.59 
 
 
1038 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  30.16 
 
 
713 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  34.89 
 
 
702 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  28.16 
 
 
974 aa  127  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  27.82 
 
 
1054 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2949  putative membrane protein, MmpL family  27.89 
 
 
888 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4025e-34 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  27.49 
 
 
1038 aa  126  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  27.46 
 
 
1038 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  26.3 
 
 
1041 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  29.06 
 
 
1038 aa  123  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  35.45 
 
 
780 aa  122  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  27.84 
 
 
1038 aa  122  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  26.6 
 
 
981 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  38.34 
 
 
750 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  25.28 
 
 
1040 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  34.62 
 
 
745 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  39.53 
 
 
576 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  26.69 
 
 
1109 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  33.61 
 
 
712 aa  116  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  33.33 
 
 
747 aa  116  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  26.29 
 
 
1109 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  34.23 
 
 
713 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  38.83 
 
 
700 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  34.93 
 
 
702 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  36.62 
 
 
714 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  26.06 
 
 
1049 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  38.28 
 
 
697 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1580  hypothetical protein  34.21 
 
 
869 aa  109  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000620673 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  33.68 
 
 
764 aa  109  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  35.47 
 
 
699 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  36.89 
 
 
701 aa  109  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  34.23 
 
 
682 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  36.36 
 
 
699 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  29.9 
 
 
339 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  35.19 
 
 
714 aa  106  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  31.27 
 
 
737 aa  106  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  36.13 
 
 
753 aa  106  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0161  hypothetical protein  36.73 
 
 
934 aa  106  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.703618 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  34.21 
 
 
775 aa  106  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  27.53 
 
 
882 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  34.07 
 
 
778 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  31.05 
 
 
740 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1013  hypothetical protein  31.25 
 
 
860 aa  105  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000218575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  32.34 
 
 
709 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  38.62 
 
 
673 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  34.78 
 
 
733 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  39.31 
 
 
706 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  33.93 
 
 
674 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  33.93 
 
 
674 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  33.93 
 
 
674 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1450  hypothetical protein  37.42 
 
 
863 aa  101  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  35.34 
 
 
678 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  35.18 
 
 
777 aa  100  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>