More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13857 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  39.45 
 
 
1013 aa  645    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  58.23 
 
 
1002 aa  1172    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  52.74 
 
 
998 aa  1001    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  49.33 
 
 
1062 aa  984    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  39.19 
 
 
1022 aa  671    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  51.04 
 
 
1146 aa  1016    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  100 
 
 
1089 aa  2168    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  52.74 
 
 
998 aa  1001    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  49.33 
 
 
1062 aa  984    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  39.19 
 
 
1022 aa  671    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  52.17 
 
 
1000 aa  1024    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  39.51 
 
 
1028 aa  645    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  40.14 
 
 
1003 aa  688    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  52.74 
 
 
998 aa  1001    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  50.1 
 
 
1077 aa  1003    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  39.41 
 
 
1040 aa  647    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  51.64 
 
 
1001 aa  999    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  34.1 
 
 
1013 aa  458  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  31.44 
 
 
1011 aa  457  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  28 
 
 
967 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4825  transport protein  28.17 
 
 
1001 aa  395  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  28.77 
 
 
941 aa  396  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  28.47 
 
 
948 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3189  transport protein  28.47 
 
 
968 aa  391  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3435  transport protein  29.09 
 
 
968 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541306  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5174  transport protein  27.41 
 
 
968 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5263  transport protein  27.41 
 
 
968 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5555  transport protein  27.41 
 
 
968 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188099  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  27.94 
 
 
962 aa  381  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  28.1 
 
 
944 aa  382  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  28.56 
 
 
959 aa  375  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10690  transmembrane transport protein mmpL5  27.51 
 
 
964 aa  374  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1614  transport protein  27.11 
 
 
968 aa  375  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0481 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3401  transport protein  28.95 
 
 
955 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.057109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3464  transport protein  28.95 
 
 
955 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0593599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3412  transport protein  28.95 
 
 
955 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0674616  normal  0.562796 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1057  transport protein  28.54 
 
 
963 aa  361  4e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  38.94 
 
 
681 aa  360  7e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2705  transport protein  27.79 
 
 
957 aa  360  8e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10407  transmembrane transport protein mmpL1  26.93 
 
 
958 aa  351  4e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.665513  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  26.04 
 
 
945 aa  342  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  26.04 
 
 
945 aa  342  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11778  MmpL family membrane protein  28.41 
 
 
945 aa  337  7e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000786949  decreased coverage  0.0000000000113435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4635  MMPL domain-containing protein  43.36 
 
 
470 aa  303  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  24.77 
 
 
1054 aa  252  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  20.69 
 
 
1109 aa  246  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  20.6 
 
 
1109 aa  244  6e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  22.36 
 
 
1049 aa  234  6e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  25.09 
 
 
1068 aa  229  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  23.89 
 
 
1040 aa  227  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  22.85 
 
 
1038 aa  214  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  22.85 
 
 
1041 aa  201  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  22.61 
 
 
1038 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  22.06 
 
 
1041 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  22.62 
 
 
1038 aa  199  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10518  transmembrane transport protein mmpL2  28.69 
 
 
968 aa  197  9e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.930398 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  22.4 
 
 
1038 aa  194  9e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  22.59 
 
 
1038 aa  193  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2949  putative membrane protein, MmpL family  23.52 
 
 
888 aa  183  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4025e-34 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11589  transmembrane transport protein mmpL6  37.23 
 
 
397 aa  171  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.9101799999999998e-86  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  25.61 
 
 
974 aa  164  9e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  25.45 
 
 
981 aa  154  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  24.7 
 
 
974 aa  153  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0890  MMPL domain protein  19.96 
 
 
1026 aa  151  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000250771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  43.41 
 
 
750 aa  147  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  37.5 
 
 
780 aa  135  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  41.14 
 
 
764 aa  134  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  29.07 
 
 
745 aa  133  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  37.72 
 
 
743 aa  132  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  44.25 
 
 
576 aa  131  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  33.33 
 
 
882 aa  129  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  36.4 
 
 
743 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  36.17 
 
 
743 aa  129  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  36.6 
 
 
743 aa  129  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  36.4 
 
 
743 aa  128  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  35.74 
 
 
743 aa  128  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  36.4 
 
 
743 aa  128  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  36.4 
 
 
743 aa  128  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  32.22 
 
 
747 aa  128  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  37.45 
 
 
737 aa  128  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  27.43 
 
 
730 aa  127  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  23.11 
 
 
1246 aa  127  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  37.93 
 
 
753 aa  127  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  32.65 
 
 
713 aa  127  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  27.88 
 
 
709 aa  126  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  38.7 
 
 
712 aa  126  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  38.46 
 
 
712 aa  125  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  42.93 
 
 
733 aa  125  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  34.89 
 
 
743 aa  125  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  27.18 
 
 
723 aa  124  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  40.67 
 
 
673 aa  122  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  37.85 
 
 
699 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  42.31 
 
 
713 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  39.65 
 
 
697 aa  119  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  35.74 
 
 
743 aa  118  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  39.08 
 
 
339 aa  118  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  33.91 
 
 
740 aa  118  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  41.36 
 
 
702 aa  117  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  40.44 
 
 
699 aa  117  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  43.31 
 
 
702 aa  116  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>