More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1580 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1580  hypothetical protein  100 
 
 		 869 aa  1738    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000620673 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1013  hypothetical protein  66.15 
 
 		 860 aa  1138    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000218575 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1450  hypothetical protein  67.02 
 
 		 863 aa  1095    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1643  hypothetical protein  65.1 
 
 		 866 aa  1032    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0161  hypothetical protein  39.25 
 
 		 934 aa  374  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.703618 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  29.66 
 
 		 747 aa  159  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  28.89 
 
 		 576 aa  155  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  28.82 
 
 		 699 aa  144  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  27.57 
 
 		 758 aa  141  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  27.27 
 
 		 770 aa  136  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  24.62 
 
 		 717 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  35.29 
 
 		 836 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  29.32 
 
 		 682 aa  132  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  23.67 
 
 		 710 aa  130  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  26.67 
 
 		 724 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  25.7 
 
 		 741 aa  129  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  27.19 
 
 		 1155 aa  129  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7301  MmpL domain-containing protein  27.96 
 
 		 704 aa  127  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.573175  normal  0.0728725 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3339  MmpL domain-containing protein  28.24 
 
 		 732 aa  127  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0617981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  25.91 
 
 		 832 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  27.67 
 
 		 709 aa  125  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  24.36 
 
 		 737 aa  125  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  24.47 
 
 		 842 aa  124  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  22.72 
 
 		 829 aa  123  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  22.72 
 
 		 829 aa  123  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  25.46 
 
 		 753 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  25.71 
 
 		 738 aa  122  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  26.25 
 
 		 730 aa  121  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2167  RND superfamily drug efflux protein  37.77 
 
 		 825 aa  120  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00341827 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  36.97 
 
 		 974 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  24.52 
 
 		 733 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  23.75 
 
 		 743 aa  119  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  26.38 
 
 		 738 aa  119  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  27.18 
 
 		 731 aa  118  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  25.97 
 
 		 740 aa  118  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  38.01 
 
 		 1077 aa  118  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6982  MMPL domain protein  24.78 
 
 		 794 aa  117  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  26.17 
 
 		 743 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  42.55 
 
 		 1013 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  26.61 
 
 		 743 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  26.61 
 
 		 743 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  26.61 
 
 		 743 aa  115  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  36.2 
 
 		 1146 aa  115  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  30.36 
 
 		 674 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  25.49 
 
 		 724 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  25.85 
 
 		 745 aa  115  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  30.36 
 
 		 674 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  30.36 
 
 		 674 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  21.95 
 
 		 730 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  24.87 
 
 		 740 aa  114  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  26.22 
 
 		 743 aa  114  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  27.03 
 
 		 713 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  27.24 
 
 		 751 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  38.41 
 
 		 1002 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  37.72 
 
 		 974 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  34.05 
 
 		 981 aa  112  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  26.18 
 
 		 702 aa  112  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  26.37 
 
 		 743 aa  111  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  25.88 
 
 		 719 aa  111  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  25.68 
 
 		 766 aa  111  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  24.95 
 
 		 729 aa  111  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  28.04 
 
 		 702 aa  110  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  35.64 
 
 		 948 aa  110  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  26.97 
 
 		 743 aa  110  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  25.68 
 
 		 743 aa  110  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  34.01 
 
 		 953 aa  110  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  22.67 
 
 		 920 aa  110  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  22.32 
 
 		 737 aa  110  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  26.53 
 
 		 743 aa  110  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2658  MMPL domain protein  33.99 
 
 		 841 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  21.83 
 
 		 893 aa  109  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  24.64 
 
 		 882 aa  109  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  27.63 
 
 		 743 aa  109  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  27.91 
 
 		 778 aa  109  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  36.25 
 
 		 740 aa  109  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  26.28 
 
 		 761 aa  108  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  24.37 
 
 		 736 aa  108  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  22.78 
 
 		 723 aa  108  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  23.97 
 
 		 731 aa  107  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  27.23 
 
 		 712 aa  107  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  35.26 
 
 		 941 aa  107  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  26.51 
 
 		 743 aa  107  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  39.31 
 
 		 1062 aa  107  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  24.05 
 
 		 805 aa  107  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  39.31 
 
 		 1062 aa  107  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  26.37 
 
 		 769 aa  107  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  26.37 
 
 		 769 aa  107  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  33.68 
 
 		 718 aa  106  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8716  MMPL domain protein  24.81 
 
 		 745 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14053  decreased coverage  0.00441671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  35.48 
 
 		 959 aa  105  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5174  transport protein  33.68 
 
 		 968 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  24.53 
 
 		 735 aa  105  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  41.1 
 
 		 339 aa  105  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5263  transport protein  33.68 
 
 		 968 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5555  transport protein  33.68 
 
 		 968 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  27.17 
 
 		 678 aa  105  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  34.54 
 
 		 726 aa  105  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  36.55 
 
 		 1001 aa  104  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  32.17 
 
 		 764 aa  104  8e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  34.22 
 
 		 944 aa  103  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>