90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0820 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0820  hypothetical protein  100 
 
 		 863 aa  1648    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0549  hypothetical protein  28.13 
 
 		 767 aa  256  9e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11800  X-X-X-Leu-X-X-Gly heptad repeat-containing protein  26.76 
 
 		 853 aa  249  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.032406 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1481  membrane protein-like protein  27.32 
 
 		 770 aa  209  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0291099  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1908  membrane protein-like protein  25.77 
 
 		 642 aa  138  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0193377  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1037 aa  132  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  25.19 
 
 		 915 aa  121  7e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  26.63 
 
 		 1114 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  26.64 
 
 		 782 aa  115  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  26.41 
 
 		 1111 aa  112  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  26.15 
 
 		 911 aa  111  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  25.28 
 
 		 869 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  25.28 
 
 		 869 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  25.28 
 
 		 869 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  24.49 
 
 		 869 aa  108  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0687  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.54 
 
 		 946 aa  108  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  25.8 
 
 		 923 aa  107  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  25.98 
 
 		 924 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  27.18 
 
 		 1246 aa  105  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.61 
 
 		 769 aa  103  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 		 825 aa  99.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3321  transcriptional regulator, MarR family  25.55 
 
 		 733 aa  98.6  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  26.8 
 
 		 797 aa  97.4  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2395  hypothetical protein  24.28 
 
 		 625 aa  97.1  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.553674 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  22.64 
 
 		 819 aa  92.8  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15730  YhgE/Pip-like protein  24.08 
 
 		 882 aa  92.8  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  27.08 
 
 		 772 aa  90.5  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02050  YhgE/Pip-like protein  22.19 
 
 		 988 aa  84.3  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1632  membrane protein-like protein  25.14 
 
 		 955 aa  84.3  0.000000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000847897  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1708  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  22.67 
 
 		 504 aa  83.6  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0560  YhgE/Pip C-terminal domain protein  29.78 
 
 		 692 aa  84  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000430326 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  27.17 
 
 		 666 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2134  hypothetical protein  24.4 
 
 		 772 aa  79.7  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00916626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  26.45 
 
 		 666 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  27.17 
 
 		 666 aa  78.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  27.17 
 
 		 666 aa  78.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  26.45 
 
 		 663 aa  78.2  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5390  hypothetical protein  26.79 
 
 		 512 aa  77.8  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.12 
 
 		 737 aa  77  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0160  hypothetical protein  21.6 
 
 		 630 aa  76.6  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  26.81 
 
 		 666 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  26.42 
 
 		 666 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  24.32 
 
 		 623 aa  75.9  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3037  YhgE/Pip N-terminal domain protein  24.93 
 
 		 732 aa  74.7  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.1 
 
 		 857 aa  73.9  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  25.66 
 
 		 666 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  26.16 
 
 		 666 aa  71.2  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  24.73 
 
 		 1038 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  25.53 
 
 		 1038 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  26.85 
 
 		 695 aa  67.4  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  25.59 
 
 		 1040 aa  66.6  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5739  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  23.91 
 
 		 683 aa  67  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.979212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3327  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  25 
 
 		 649 aa  66.6  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0644816  normal  0.846988 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0273  membrane protein-like protein  20.22 
 
 		 982 aa  65.5  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125327 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0357  hypothetical protein  32.03 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0082  YhgE/Pip C-terminal domain protein  22.87 
 
 		 785 aa  63.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  26.53 
 
 		 1041 aa  62.4  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  24.19 
 
 		 1038 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2741  hypothetical protein  26.19 
 
 		 810 aa  60.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  26.53 
 
 		 1038 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  27.24 
 
 		 1041 aa  60.1  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2261  hypothetical protein  29.39 
 
 		 266 aa  59.3  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000562988 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2524  hypothetical protein  27.01 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140446  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2949  putative membrane protein, MmpL family  26.19 
 
 		 888 aa  58.9  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4025e-34 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  23.24 
 
 		 1054 aa  58.5  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  22.85 
 
 		 1038 aa  57.8  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0811  YhgE/Pip C-terminal domain protein  24.23 
 
 		 678 aa  57.4  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5526  YhgE/Pip C-terminal domain protein  21.29 
 
 		 631 aa  56.6  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3217  YhgE/Pip N-terminal domain protein  29 
 
 		 740 aa  56.2  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0017826  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0761  YhgE/Pip N-terminal domain protein  21.73 
 
 		 711 aa  55.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4995  ABC-2 type transporter  30.56 
 
 		 669 aa  55.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0951558  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  22.09 
 
 		 759 aa  54.7  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  25.21 
 
 		 1049 aa  54.7  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0814  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1002 aa  53.5  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  31.15 
 
 		 1068 aa  53.5  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03260  predicted membrane protein  24.32 
 
 		 961 aa  52  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.903539  normal  0.484426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0663  ABC-2 type transporter  30.57 
 
 		 678 aa  51.6  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0180  hypothetical protein  23.11 
 
 		 754 aa  51.6  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267919  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0605  hypothetical protein  28.57 
 
 		 353 aa  49.7  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3277  hypothetical protein  22.29 
 
 		 217 aa  48.5  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000129016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3381  hypothetical protein  23.33 
 
 		 233 aa  47.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1752  ABC-2 type transporter  24.46 
 
 		 669 aa  47.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1969  hypothetical protein  23.46 
 
 		 789 aa  47.8  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  26.39 
 
 		 958 aa  46.6  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1944  hypothetical protein  22.97 
 
 		 721 aa  45.8  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0282  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25 
 
 		 702 aa  46.2  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  22.65 
 
 		 659 aa  45.4  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.738999  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  19.01 
 
 		 661 aa  45.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0395  hypothetical protein  25.74 
 
 		 728 aa  44.7  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.564778  normal  0.0901394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4157  hypothetical protein  30 
 
 		 201 aa  44.7  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0018779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>