89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0549 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0549  hypothetical protein  100 
 
 
767 aa  1513    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0820  hypothetical protein  28.59 
 
 
863 aa  263  6.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1481  membrane protein-like protein  23.95 
 
 
770 aa  169  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0291099  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11800  X-X-X-Leu-X-X-Gly heptad repeat-containing protein  26.43 
 
 
853 aa  166  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.032406 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1908  membrane protein-like protein  25.51 
 
 
642 aa  128  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0193377  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  26.98 
 
 
923 aa  111  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  26.79 
 
 
924 aa  109  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  25.26 
 
 
1114 aa  107  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  25.29 
 
 
915 aa  105  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  25.95 
 
 
1111 aa  103  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  28.63 
 
 
782 aa  102  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  25.17 
 
 
1037 aa  95.9  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  24.38 
 
 
911 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  25.27 
 
 
869 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  27.07 
 
 
797 aa  89.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  25.27 
 
 
869 aa  89.4  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  25.27 
 
 
869 aa  89.4  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0160  hypothetical protein  26.24 
 
 
630 aa  85.9  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  23.63 
 
 
1246 aa  86.3  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2134  hypothetical protein  26.76 
 
 
772 aa  85.1  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00916626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  24.73 
 
 
869 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0687  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.77 
 
 
946 aa  82.4  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1632  membrane protein-like protein  24.32 
 
 
955 aa  82  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000847897  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  23.84 
 
 
825 aa  82  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1708  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  23.86 
 
 
504 aa  80.9  0.00000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  21.38 
 
 
769 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02050  YhgE/Pip-like protein  23.34 
 
 
988 aa  77.8  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  25.11 
 
 
819 aa  76.6  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15730  YhgE/Pip-like protein  24.46 
 
 
882 aa  73.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  24.81 
 
 
666 aa  72  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0082  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.17 
 
 
785 aa  72  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  24.32 
 
 
772 aa  71.6  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2395  hypothetical protein  19.88 
 
 
625 aa  70.9  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.553674 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  27.73 
 
 
666 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  24.05 
 
 
666 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  24.43 
 
 
666 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  24.05 
 
 
666 aa  67.8  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  24.05 
 
 
666 aa  67.8  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  24.05 
 
 
666 aa  67.4  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  24.62 
 
 
666 aa  67  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3321  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 
733 aa  66.6  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156979  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5390  hypothetical protein  24.05 
 
 
512 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  23.66 
 
 
663 aa  65.1  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  22 
 
 
737 aa  63.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  25.74 
 
 
695 aa  63.5  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  25.35 
 
 
1049 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  23.12 
 
 
759 aa  61.6  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1969  hypothetical protein  22.22 
 
 
789 aa  60.5  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  30.99 
 
 
1068 aa  60.1  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0814  hypothetical protein  24.68 
 
 
1002 aa  58.5  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1752  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 
669 aa  58.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3037  YhgE/Pip N-terminal domain protein  26.29 
 
 
732 aa  58.2  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0560  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.71 
 
 
692 aa  57.4  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000430326 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2524  hypothetical protein  24.44 
 
 
464 aa  56.2  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140446  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5739  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  24.03 
 
 
683 aa  55.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.979212 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4995  ABC-2 type transporter  23.88 
 
 
669 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0951558  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5526  YhgE/Pip C-terminal domain protein  27.54 
 
 
631 aa  52.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  27.64 
 
 
1211 aa  52.4  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1944  hypothetical protein  24.15 
 
 
721 aa  52  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3217  YhgE/Pip N-terminal domain protein  34.02 
 
 
740 aa  51.6  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0017826  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  21.58 
 
 
623 aa  51.2  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  22.32 
 
 
1054 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  21.14 
 
 
1041 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  22.05 
 
 
1041 aa  49.3  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0282  YhgE/Pip C-terminal domain protein  37.84 
 
 
702 aa  48.9  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459983  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03260  predicted membrane protein  26.88 
 
 
961 aa  48.5  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.903539  normal  0.484426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3327  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  25.11 
 
 
649 aa  48.5  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0644816  normal  0.846988 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  21.13 
 
 
857 aa  48.9  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  24.85 
 
 
1038 aa  48.5  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0890  MMPL domain protein  22.08 
 
 
1026 aa  48.5  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000250771  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  25.71 
 
 
1040 aa  47.8  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2809  chromosome segregation ATPase-like protein  14.51 
 
 
2228 aa  47.8  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1768  hypothetical protein  18.72 
 
 
385 aa  47.8  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2741  hypothetical protein  20.5 
 
 
810 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  20.82 
 
 
1038 aa  47  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  24.79 
 
 
1001 aa  47  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0663  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 
678 aa  46.6  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  23.28 
 
 
1038 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0952  YhgE/Pip C-terminal domain protein  22.1 
 
 
646 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0289849  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2261  hypothetical protein  28.8 
 
 
266 aa  46.2  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000562988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0761  YhgE/Pip N-terminal domain protein  25.96 
 
 
711 aa  46.6  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0180  hypothetical protein  28.66 
 
 
754 aa  46.6  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  22.85 
 
 
1038 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1071  hypothetical protein  22.67 
 
 
657 aa  45.4  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.9 
 
 
631 aa  45.4  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2270  methyl-accepting chemotaxis protein  23.83 
 
 
699 aa  45.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000173504  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  20.51 
 
 
1038 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2949  putative membrane protein, MmpL family  20.5 
 
 
888 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4025e-34 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0345  methyl-accepting chemotaxis protein DmcB  20.87 
 
 
410 aa  44.3  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>