75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1481 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1481  membrane protein-like protein  100 
 
 		 770 aa  1535    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0291099  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11800  X-X-X-Leu-X-X-Gly heptad repeat-containing protein  29.57 
 
 		 853 aa  281  3e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.032406 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0820  hypothetical protein  27.32 
 
 		 863 aa  209  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1908  membrane protein-like protein  32.6 
 
 		 642 aa  181  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0193377  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0549  hypothetical protein  24.15 
 
 		 767 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1708  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  28.61 
 
 		 504 aa  118  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0160  hypothetical protein  28.06 
 
 		 630 aa  94.4  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  24.64 
 
 		 1111 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  24.4 
 
 		 869 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  23.97 
 
 		 869 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  24.12 
 
 		 869 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  24.12 
 
 		 869 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  24.7 
 
 		 911 aa  77.4  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  23.83 
 
 		 825 aa  77.4  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  25.5 
 
 		 924 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2395  hypothetical protein  23.84 
 
 		 625 aa  67  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.553674 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  22.63 
 
 		 1114 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1246 aa  65.1  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0814  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1002 aa  62.8  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  39.22 
 
 		 819 aa  61.6  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  24.47 
 
 		 923 aa  61.2  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0273  membrane protein-like protein  26.82 
 
 		 982 aa  60.8  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125327 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  23 
 
 		 915 aa  60.5  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.9 
 
 		 737 aa  60.1  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02050  YhgE/Pip-like protein  39.18 
 
 		 988 aa  59.3  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5739  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  42.17 
 
 		 683 aa  59.3  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.979212 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0357  hypothetical protein  30 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  28.12 
 
 		 666 aa  58.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  31.68 
 
 		 769 aa  57  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  27.36 
 
 		 663 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0663  ABC-2 type transporter  40.91 
 
 		 678 aa  55.8  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  31.43 
 
 		 772 aa  55.1  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  32.41 
 
 		 759 aa  55.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  44.44 
 
 		 782 aa  54.7  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  27.67 
 
 		 666 aa  54.3  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  27.67 
 
 		 666 aa  53.9  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  27.67 
 
 		 666 aa  53.9  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3037  YhgE/Pip N-terminal domain protein  32.04 
 
 		 732 aa  53.9  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  21.89 
 
 		 623 aa  52.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  43.94 
 
 		 695 aa  53.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15730  YhgE/Pip-like protein  31.48 
 
 		 882 aa  53.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1969  hypothetical protein  24.6 
 
 		 789 aa  52.8  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  36.76 
 
 		 797 aa  52  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  27.67 
 
 		 666 aa  52  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3327  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  35.51 
 
 		 649 aa  51.6  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0644816  normal  0.846988 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  34.17 
 
 		 666 aa  51.6  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  34.17 
 
 		 666 aa  51.2  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  34.17 
 
 		 666 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2134  hypothetical protein  24.38 
 
 		 772 aa  50.1  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00916626  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1037 aa  49.7  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0761  YhgE/Pip N-terminal domain protein  29.57 
 
 		 711 aa  49.7  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1632  membrane protein-like protein  33.65 
 
 		 955 aa  49.7  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000847897  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0811  YhgE/Pip C-terminal domain protein  46.03 
 
 		 678 aa  48.5  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  28.02 
 
 		 1038 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  27.54 
 
 		 1038 aa  48.5  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  34.57 
 
 		 1068 aa  48.5  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5390  hypothetical protein  33.33 
 
 		 512 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  32.48 
 
 		 1054 aa  47  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  30.84 
 
 		 1038 aa  47  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2261  hypothetical protein  37.36 
 
 		 266 aa  47  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000562988 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  30.84 
 
 		 1038 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2741  hypothetical protein  29.91 
 
 		 810 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  27.54 
 
 		 1038 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1944  hypothetical protein  30.89 
 
 		 721 aa  46.2  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6104  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  36 
 
 		 597 aa  46.6  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  30.84 
 
 		 1041 aa  46.6  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0432  YhgE/Pip C-terminal domain protein  27.72 
 
 		 666 aa  46.2  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347032  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0687  YhgE/Pip C-terminal domain protein  34.21 
 
 		 946 aa  45.4  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0560  YhgE/Pip C-terminal domain protein  30.28 
 
 		 692 aa  45.8  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000430326 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0282  YhgE/Pip C-terminal domain protein  34.67 
 
 		 702 aa  45.8  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4995  ABC-2 type transporter  28.47 
 
 		 669 aa  45.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0951558  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3321  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 733 aa  45.4  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3217  YhgE/Pip N-terminal domain protein  32.43 
 
 		 740 aa  44.7  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0017826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1041 aa  45.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2949  putative membrane protein, MmpL family  29.91 
 
 		 888 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4025e-34 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>