157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0560 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0560  YhgE/Pip C-terminal domain protein  100 
 
 		 692 aa  1408    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000430326 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  30.01 
 
 		 769 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  28.49 
 
 		 759 aa  328  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  32.11 
 
 		 666 aa  326  9e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  27.7 
 
 		 825 aa  323  6e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  31.26 
 
 		 666 aa  323  8e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  31.47 
 
 		 666 aa  323  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  30.04 
 
 		 797 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  31.76 
 
 		 666 aa  320  7e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  31.26 
 
 		 666 aa  318  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  31.54 
 
 		 666 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  31.52 
 
 		 663 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  30.81 
 
 		 666 aa  313  9e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  30.81 
 
 		 666 aa  313  9e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  37.36 
 
 		 857 aa  307  4.0000000000000004e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  27.99 
 
 		 869 aa  303  9e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  27.87 
 
 		 869 aa  303  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  27.87 
 
 		 869 aa  303  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  27.2 
 
 		 869 aa  298  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0395  hypothetical protein  32.85 
 
 		 728 aa  293  6e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.564778  normal  0.0901394 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.43 
 
 		 737 aa  290  6e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0761  YhgE/Pip N-terminal domain protein  28.14 
 
 		 711 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0432  YhgE/Pip C-terminal domain protein  29.11 
 
 		 666 aa  280  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347032  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  29.26 
 
 		 772 aa  279  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0282  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.4 
 
 		 702 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  29.15 
 
 		 695 aa  271  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4995  ABC-2 type transporter  29.02 
 
 		 669 aa  266  8.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0951558  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5526  YhgE/Pip C-terminal domain protein  27.05 
 
 		 631 aa  263  8.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1752  ABC-2 type transporter  28.82 
 
 		 669 aa  261  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6104  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  28.11 
 
 		 597 aa  258  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0811  YhgE/Pip C-terminal domain protein  30.07 
 
 		 678 aa  256  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0952  YhgE/Pip C-terminal domain protein  29.13 
 
 		 646 aa  254  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0289849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0082  YhgE/Pip C-terminal domain protein  29.37 
 
 		 785 aa  248  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0663  ABC-2 type transporter  29.1 
 
 		 678 aa  240  6.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  30.14 
 
 		 1111 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  28.76 
 
 		 1114 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1944  hypothetical protein  26.95 
 
 		 721 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5390  hypothetical protein  30.77 
 
 		 512 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  25.4 
 
 		 819 aa  221  3.9999999999999997e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  28.94 
 
 		 911 aa  216  8e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2134  hypothetical protein  25.13 
 
 		 772 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00916626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  28.28 
 
 		 923 aa  209  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  28.1 
 
 		 924 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3321  transcriptional regulator, MarR family  25.62 
 
 		 733 aa  207  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2916  putative phage infection protein  26.63 
 
 		 721 aa  206  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2594  phage infection protein, putative  25.88 
 
 		 721 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  25.3 
 
 		 782 aa  183  8.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06030  YhgE/Pip-like protein  22.51 
 
 		 967 aa  179  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.646381  normal  0.719714 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26740  YhgE/Pip-like protein  30.29 
 
 		 823 aa  178  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  32.8 
 
 		 915 aa  177  7e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1762  YhgE/Pip N-terminal domain protein  25.07 
 
 		 723 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02050  YhgE/Pip-like protein  28.92 
 
 		 988 aa  172  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5739  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  24.19 
 
 		 683 aa  169  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.979212 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2510  YhgE/Pip N-terminal domain protein  23.74 
 
 		 705 aa  164  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1632  membrane protein-like protein  34.53 
 
 		 955 aa  160  8e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000847897  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11020  YhgE/Pip-like protein  23.08 
 
 		 958 aa  160  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.458925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1246  hypothetical protein  25.07 
 
 		 876 aa  157  6e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0687  YhgE/Pip C-terminal domain protein  27.99 
 
 		 946 aa  155  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  27.93 
 
 		 1037 aa  154  7e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2593  phage infection protein, putative  23.53 
 
 		 718 aa  151  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06020  YhgE/Pip-like protein  23.36 
 
 		 717 aa  147  8.000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.333428  normal  0.219375 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2915  putative phage infection protein  21.47 
 
 		 718 aa  146  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1462  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.58 
 
 		 728 aa  140  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11010  YhgE/Pip-like protein  21.71 
 
 		 724 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.659482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0417  phage infection protein  26 
 
 		 991 aa  135  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466576 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0473  phage infection protein  25.57 
 
 		 981 aa  134  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0180  hypothetical protein  31.45 
 
 		 754 aa  134  7.999999999999999e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267919  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3037  YhgE/Pip N-terminal domain protein  25.66 
 
 		 732 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  30.51 
 
 		 623 aa  133  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4888  phage infection protein  26.68 
 
 		 953 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108734  normal  0.760577 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0484  hypothetical protein  29.14 
 
 		 953 aa  132  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0350  hypothetical protein  29.91 
 
 		 953 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0355  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 981 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0430  hypothetical protein  29.43 
 
 		 953 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0882227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2667  ABC-2 type transporter  24.47 
 
 		 993 aa  129  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2723  ABC-2 type transporter  24.47 
 
 		 993 aa  129  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15730  YhgE/Pip-like protein  26.93 
 
 		 882 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0360  hypothetical protein  29.34 
 
 		 941 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0374  hypothetical protein  29.34 
 
 		 941 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2262  phage infection protein  31.05 
 
 		 954 aa  126  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0346  hypothetical protein  29.06 
 
 		 941 aa  126  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0357  ABC-2 type transporter  24.37 
 
 		 940 aa  125  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1247  hypothetical protein  23.36 
 
 		 720 aa  124  7e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3327  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  26.77 
 
 		 649 aa  120  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0644816  normal  0.846988 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1969  hypothetical protein  25.81 
 
 		 789 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0499  YhgE/Pip N-terminal domain protein  30.05 
 
 		 876 aa  118  3.9999999999999997e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3217  YhgE/Pip N-terminal domain protein  24.56 
 
 		 740 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0017826  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1500  hypothetical protein  22.21 
 
 		 779 aa  114  8.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0498  YhgE/Pip C-terminal domain protein  22.49 
 
 		 726 aa  112  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.325694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0758  YhgE/Pip N-terminal domain protein  27.51 
 
 		 718 aa  110  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1461  YhgE/Pip C-terminal domain protein  31.19 
 
 		 881 aa  108  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  0.893103 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1501  hypothetical protein  28.93 
 
 		 887 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0820  hypothetical protein  28.71 
 
 		 863 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  25.09 
 
 		 1040 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5391  phage infection protein  30.77 
 
 		 142 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  26.3 
 
 		 1068 aa  74.7  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1908  membrane protein-like protein  27.88 
 
 		 642 aa  75.1  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0193377  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  26.74 
 
 		 1054 aa  70.1  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  35 
 
 		 1246 aa  68.6  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0273  membrane protein-like protein  32.75 
 
 		 982 aa  68.2  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125327 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>