104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1462 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1462  YhgE/Pip C-terminal domain protein  100 
 
 
728 aa  1438    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1247  hypothetical protein  42.34 
 
 
720 aa  567  1e-160  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06020  YhgE/Pip-like protein  37.23 
 
 
717 aa  471  1.0000000000000001e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.333428  normal  0.219375 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1500  hypothetical protein  32.69 
 
 
779 aa  467  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11010  YhgE/Pip-like protein  33.29 
 
 
724 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.659482  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0498  YhgE/Pip C-terminal domain protein  33.11 
 
 
726 aa  436  1e-121  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.325694  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1246  hypothetical protein  29.84 
 
 
876 aa  323  9.000000000000001e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0499  YhgE/Pip N-terminal domain protein  28.16 
 
 
876 aa  310  5.9999999999999995e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06030  YhgE/Pip-like protein  29.63 
 
 
967 aa  306  6e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.646381  normal  0.719714 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1501  hypothetical protein  29.2 
 
 
887 aa  292  2e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11020  YhgE/Pip-like protein  28.76 
 
 
958 aa  291  2e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.458925  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2510  YhgE/Pip N-terminal domain protein  27.53 
 
 
705 aa  248  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2916  putative phage infection protein  24.11 
 
 
721 aa  239  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2594  phage infection protein, putative  22.81 
 
 
721 aa  234  6e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2915  putative phage infection protein  25.18 
 
 
718 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2593  phage infection protein, putative  24.96 
 
 
718 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1762  YhgE/Pip N-terminal domain protein  23.93 
 
 
723 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  23.67 
 
 
825 aa  183  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.16 
 
 
769 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  24.6 
 
 
797 aa  178  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  24.14 
 
 
737 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0357  ABC-2 type transporter  22.98 
 
 
940 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4888  phage infection protein  24.41 
 
 
953 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108734  normal  0.760577 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0360  hypothetical protein  26.29 
 
 
941 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0374  hypothetical protein  26.29 
 
 
941 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0346  hypothetical protein  26.29 
 
 
941 aa  167  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0430  hypothetical protein  24.29 
 
 
953 aa  167  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0882227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0484  hypothetical protein  25.26 
 
 
953 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  24.63 
 
 
772 aa  166  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0473  phage infection protein  26.8 
 
 
981 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0355  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 
981 aa  164  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0417  phage infection protein  24.03 
 
 
991 aa  163  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466576 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0350  hypothetical protein  24.34 
 
 
953 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2667  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 
993 aa  163  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2723  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 
993 aa  163  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2262  phage infection protein  25.52 
 
 
954 aa  154  7e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1461  YhgE/Pip C-terminal domain protein  40.43 
 
 
881 aa  151  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  0.893103 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  22.02 
 
 
666 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  22.21 
 
 
666 aa  146  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  22.87 
 
 
666 aa  146  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  22.82 
 
 
666 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  22.82 
 
 
666 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  24.13 
 
 
666 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  22.65 
 
 
663 aa  144  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  22.61 
 
 
666 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0560  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.6 
 
 
692 aa  142  3e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000430326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4995  ABC-2 type transporter  24.89 
 
 
669 aa  140  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0951558  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  22.63 
 
 
666 aa  137  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  25.34 
 
 
695 aa  137  9e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1752  ABC-2 type transporter  24.49 
 
 
669 aa  134  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3321  transcriptional regulator, MarR family  26.14 
 
 
733 aa  131  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156979  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0180  hypothetical protein  22.14 
 
 
754 aa  131  4.0000000000000003e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267919  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0952  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.65 
 
 
646 aa  131  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0289849  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  25.22 
 
 
911 aa  128  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1944  hypothetical protein  23.11 
 
 
721 aa  127  6e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0432  YhgE/Pip C-terminal domain protein  22.6 
 
 
666 aa  126  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  25.81 
 
 
869 aa  127  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  25.81 
 
 
869 aa  126  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  25.58 
 
 
869 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  25.81 
 
 
869 aa  126  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  24.64 
 
 
1111 aa  124  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  29.97 
 
 
1114 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  29.02 
 
 
857 aa  123  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  26.18 
 
 
923 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  29.85 
 
 
924 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5526  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.37 
 
 
631 aa  117  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0282  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.12 
 
 
702 aa  110  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459983  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02050  YhgE/Pip-like protein  28.66 
 
 
988 aa  107  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0761  YhgE/Pip N-terminal domain protein  22.53 
 
 
711 aa  107  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2134  hypothetical protein  21.3 
 
 
772 aa  105  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00916626  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  25.35 
 
 
915 aa  103  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1969  hypothetical protein  20.42 
 
 
789 aa  102  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  25.19 
 
 
759 aa  99.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  25.52 
 
 
782 aa  93.6  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1632  membrane protein-like protein  23.8 
 
 
955 aa  92  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000847897  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  29.72 
 
 
1037 aa  86.3  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6104  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  22.09 
 
 
597 aa  80.5  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0663  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 
678 aa  80.5  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5390  hypothetical protein  23.23 
 
 
512 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5391  phage infection protein  27.86 
 
 
142 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0395  hypothetical protein  27.43 
 
 
728 aa  72  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.564778  normal  0.0901394 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0687  YhgE/Pip C-terminal domain protein  30.99 
 
 
946 aa  70.9  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  23.81 
 
 
623 aa  70.1  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  27.8 
 
 
819 aa  68.9  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0082  YhgE/Pip C-terminal domain protein  27.68 
 
 
785 aa  67.8  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26740  YhgE/Pip-like protein  30.07 
 
 
823 aa  67.4  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0758  YhgE/Pip N-terminal domain protein  24.16 
 
 
718 aa  64.7  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0811  YhgE/Pip C-terminal domain protein  24.51 
 
 
678 aa  58.9  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15730  YhgE/Pip-like protein  35.29 
 
 
882 aa  55.8  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1469  membrane protein-like protein  44.26 
 
 
238 aa  53.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0184  hypothetical protein  23.81 
 
 
379 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01264  hypothetical protein  24.88 
 
 
968 aa  48.5  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.744228  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3117  hypothetical protein  23.53 
 
 
393 aa  47.8  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2897  hypothetical protein  23.53 
 
 
393 aa  47.4  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3114  hypothetical protein  23.53 
 
 
393 aa  47.4  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0181  hypothetical protein  22.81 
 
 
379 aa  47  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0556073  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0052  putative methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  25.64 
 
 
516 aa  47  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2892  hypothetical protein  23.46 
 
 
393 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0559889  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5739  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  23.85 
 
 
683 aa  47  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.979212 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2132  phage infection protein  28.87 
 
 
393 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>