124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2262 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2262  phage infection protein  100 
 
 
954 aa  1930    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2667  ABC-2 type transporter  66.8 
 
 
993 aa  1352    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2723  ABC-2 type transporter  66.8 
 
 
993 aa  1352    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0360  hypothetical protein  30.56 
 
 
941 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0346  hypothetical protein  30.56 
 
 
941 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0374  hypothetical protein  30.56 
 
 
941 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0484  hypothetical protein  30.92 
 
 
953 aa  396  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0430  hypothetical protein  30.78 
 
 
953 aa  399  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0882227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0350  hypothetical protein  29.84 
 
 
953 aa  392  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0473  phage infection protein  32.49 
 
 
981 aa  238  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0355  ABC-2 type transporter  33.72 
 
 
981 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0417  phage infection protein  34 
 
 
991 aa  232  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466576 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2594  phage infection protein, putative  31.45 
 
 
721 aa  204  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2916  putative phage infection protein  31.71 
 
 
721 aa  203  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2510  YhgE/Pip N-terminal domain protein  41.88 
 
 
705 aa  202  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1762  YhgE/Pip N-terminal domain protein  42.17 
 
 
723 aa  202  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0357  ABC-2 type transporter  38.55 
 
 
940 aa  197  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4888  phage infection protein  40.18 
 
 
953 aa  194  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108734  normal  0.760577 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  22.53 
 
 
924 aa  189  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  22.35 
 
 
923 aa  188  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  22.1 
 
 
911 aa  182  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2915  putative phage infection protein  42.72 
 
 
718 aa  181  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1501  hypothetical protein  29.57 
 
 
887 aa  180  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0498  YhgE/Pip C-terminal domain protein  30.46 
 
 
726 aa  178  5e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.325694  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1632  membrane protein-like protein  24.14 
 
 
955 aa  177  8e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000847897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2593  phage infection protein, putative  41.31 
 
 
718 aa  177  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06020  YhgE/Pip-like protein  27.31 
 
 
717 aa  170  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.333428  normal  0.219375 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06030  YhgE/Pip-like protein  32.32 
 
 
967 aa  170  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.646381  normal  0.719714 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11010  YhgE/Pip-like protein  35.77 
 
 
724 aa  170  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.659482  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11020  YhgE/Pip-like protein  25.09 
 
 
958 aa  163  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.458925  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0499  YhgE/Pip N-terminal domain protein  26.35 
 
 
876 aa  162  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  23.94 
 
 
915 aa  160  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1500  hypothetical protein  25.59 
 
 
779 aa  155  5e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1462  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.52 
 
 
728 aa  153  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1246  hypothetical protein  28.38 
 
 
876 aa  150  9e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1247  hypothetical protein  27.48 
 
 
720 aa  145  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1461  YhgE/Pip C-terminal domain protein  29.67 
 
 
881 aa  144  9e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  0.893103 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2134  hypothetical protein  34.38 
 
 
772 aa  126  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00916626  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0560  YhgE/Pip C-terminal domain protein  31.05 
 
 
692 aa  126  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000430326 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0180  hypothetical protein  36.9 
 
 
754 aa  119  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267919  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  33.33 
 
 
857 aa  116  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  22.95 
 
 
769 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  24.42 
 
 
772 aa  114  8.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  29.31 
 
 
797 aa  112  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  21.7 
 
 
869 aa  111  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  21.86 
 
 
869 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.63 
 
 
737 aa  110  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  21.7 
 
 
869 aa  110  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  21.7 
 
 
869 aa  110  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1969  hypothetical protein  29.52 
 
 
789 aa  110  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  22.39 
 
 
825 aa  110  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0082  YhgE/Pip C-terminal domain protein  29.7 
 
 
785 aa  107  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02050  YhgE/Pip-like protein  28.57 
 
 
988 aa  107  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6104  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  27.86 
 
 
597 aa  107  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  22.48 
 
 
1111 aa  107  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0432  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.46 
 
 
666 aa  105  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  30.68 
 
 
1114 aa  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0395  hypothetical protein  31.98 
 
 
728 aa  103  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.564778  normal  0.0901394 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  23.72 
 
 
666 aa  103  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  30.7 
 
 
666 aa  101  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  29.3 
 
 
666 aa  100  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  29.3 
 
 
666 aa  100  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  29.77 
 
 
663 aa  100  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  33.33 
 
 
623 aa  100  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  24.39 
 
 
759 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  29.77 
 
 
666 aa  100  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  29.3 
 
 
666 aa  99  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0952  YhgE/Pip C-terminal domain protein  31.62 
 
 
646 aa  99  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0289849  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  29.77 
 
 
666 aa  98.2  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  29.3 
 
 
666 aa  96.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1944  hypothetical protein  34.12 
 
 
721 aa  96.7  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0282  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.89 
 
 
702 aa  94.7  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459983  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3321  transcriptional regulator, MarR family  21.38 
 
 
733 aa  92.4  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156979  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0758  YhgE/Pip N-terminal domain protein  33.06 
 
 
718 aa  92  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5526  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.43 
 
 
631 aa  91.7  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4995  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 
669 aa  91.3  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0951558  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5390  hypothetical protein  23.9 
 
 
512 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26740  YhgE/Pip-like protein  23.92 
 
 
823 aa  90.5  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1752  ABC-2 type transporter  22.58 
 
 
669 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0663  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 
678 aa  86.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0761  YhgE/Pip N-terminal domain protein  25.27 
 
 
711 aa  84  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0687  YhgE/Pip C-terminal domain protein  31.29 
 
 
946 aa  84  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0811  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.72 
 
 
678 aa  83.2  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  25.22 
 
 
695 aa  82  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5391  phage infection protein  33.33 
 
 
142 aa  82  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1469  membrane protein-like protein  40.96 
 
 
238 aa  77  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  28.11 
 
 
819 aa  74.7  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  28.01 
 
 
1037 aa  74.7  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5739  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  20.78 
 
 
683 aa  67  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.979212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3327  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  30.71 
 
 
649 aa  65.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0644816  normal  0.846988 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2085  hypothetical protein  25.39 
 
 
1263 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3220  hypothetical protein  25.39 
 
 
1275 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  20.53 
 
 
782 aa  62.4  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1913  hypothetical protein  25.77 
 
 
1198 aa  61.2  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0476202  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1573  hypothetical protein  26 
 
 
1197 aa  59.3  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.275879  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5806  hypothetical protein  30.08 
 
 
442 aa  57.4  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15730  YhgE/Pip-like protein  21.71 
 
 
882 aa  55.8  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2132  phage infection protein  25.32 
 
 
393 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1038  phage infection protein, putative  28.42 
 
 
1003 aa  53.1  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.687309  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1962  hypothetical protein  32.53 
 
 
936 aa  53.1  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>