121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2915 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2915  putative phage infection protein  100 
 
 
718 aa  1440    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2593  phage infection protein, putative  93.04 
 
 
718 aa  1281    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2916  putative phage infection protein  40.5 
 
 
721 aa  565  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2594  phage infection protein, putative  40.28 
 
 
721 aa  554  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1762  YhgE/Pip N-terminal domain protein  31.04 
 
 
723 aa  345  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2510  YhgE/Pip N-terminal domain protein  30.4 
 
 
705 aa  337  5e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0499  YhgE/Pip N-terminal domain protein  28.38 
 
 
876 aa  305  1.0000000000000001e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1246  hypothetical protein  29.65 
 
 
876 aa  303  6.000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1500  hypothetical protein  28.35 
 
 
779 aa  293  8e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06030  YhgE/Pip-like protein  27.59 
 
 
967 aa  291  4e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.646381  normal  0.719714 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11020  YhgE/Pip-like protein  27.06 
 
 
958 aa  288  2e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.458925  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1501  hypothetical protein  28.89 
 
 
887 aa  286  7e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11010  YhgE/Pip-like protein  26.9 
 
 
724 aa  265  2e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.659482  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06020  YhgE/Pip-like protein  26.77 
 
 
717 aa  259  1e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.333428  normal  0.219375 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0498  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.95 
 
 
726 aa  259  1e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.325694  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0473  phage infection protein  43.84 
 
 
981 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0430  hypothetical protein  44.57 
 
 
953 aa  244  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0882227  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1247  hypothetical protein  26.44 
 
 
720 aa  242  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0350  hypothetical protein  44.2 
 
 
953 aa  242  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0417  phage infection protein  44.2 
 
 
991 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466576 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4888  phage infection protein  44 
 
 
953 aa  240  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108734  normal  0.760577 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1462  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.06 
 
 
728 aa  239  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0484  hypothetical protein  43.64 
 
 
953 aa  238  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0357  ABC-2 type transporter  32.69 
 
 
940 aa  238  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0360  hypothetical protein  42.23 
 
 
941 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0346  hypothetical protein  42.23 
 
 
941 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0374  hypothetical protein  42.23 
 
 
941 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0355  ABC-2 type transporter  42.18 
 
 
981 aa  229  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.52 
 
 
769 aa  218  5e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  26.88 
 
 
772 aa  201  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  23.63 
 
 
797 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2134  hypothetical protein  25.64 
 
 
772 aa  198  4.0000000000000005e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00916626  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.66 
 
 
737 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0180  hypothetical protein  26.95 
 
 
754 aa  189  1e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267919  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2667  ABC-2 type transporter  40.52 
 
 
993 aa  189  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2723  ABC-2 type transporter  40.52 
 
 
993 aa  189  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2262  phage infection protein  40.95 
 
 
954 aa  182  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  23.82 
 
 
666 aa  180  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  23.4 
 
 
666 aa  180  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  23.4 
 
 
666 aa  180  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  23.82 
 
 
666 aa  180  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  23.55 
 
 
663 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  23.86 
 
 
666 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1969  hypothetical protein  24.5 
 
 
789 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  22.99 
 
 
666 aa  172  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0432  YhgE/Pip C-terminal domain protein  22.84 
 
 
666 aa  170  7e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  24.01 
 
 
666 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  22.96 
 
 
666 aa  168  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5526  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.45 
 
 
631 aa  167  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1944  hypothetical protein  24.77 
 
 
721 aa  163  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0952  YhgE/Pip C-terminal domain protein  22.03 
 
 
646 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0289849  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0560  YhgE/Pip C-terminal domain protein  22.49 
 
 
692 aa  161  5e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000430326 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0761  YhgE/Pip N-terminal domain protein  23.59 
 
 
711 aa  160  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4995  ABC-2 type transporter  23.66 
 
 
669 aa  158  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0951558  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  23.61 
 
 
695 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1752  ABC-2 type transporter  22.58 
 
 
669 aa  154  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1632  membrane protein-like protein  24.44 
 
 
955 aa  140  6e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000847897  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0282  YhgE/Pip C-terminal domain protein  22.55 
 
 
702 aa  139  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459983  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  25.59 
 
 
869 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  21.46 
 
 
819 aa  139  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  25.39 
 
 
869 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  25.39 
 
 
869 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1461  YhgE/Pip C-terminal domain protein  41.67 
 
 
881 aa  137  6.0000000000000005e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  0.893103 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  26.95 
 
 
911 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  24.75 
 
 
869 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 
825 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  27.88 
 
 
1111 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  27.29 
 
 
924 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  27.16 
 
 
923 aa  134  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  26.83 
 
 
1114 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0811  YhgE/Pip C-terminal domain protein  21.66 
 
 
678 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  24.95 
 
 
915 aa  122  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6104  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  26.27 
 
 
597 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02050  YhgE/Pip-like protein  22.62 
 
 
988 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0082  YhgE/Pip C-terminal domain protein  22.82 
 
 
785 aa  107  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  30.77 
 
 
857 aa  105  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  24.53 
 
 
759 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3321  transcriptional regulator, MarR family  21.14 
 
 
733 aa  102  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156979  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26740  YhgE/Pip-like protein  27.8 
 
 
823 aa  99  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0758  YhgE/Pip N-terminal domain protein  28.02 
 
 
718 aa  94.7  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5391  phage infection protein  35.51 
 
 
142 aa  94.4  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5390  hypothetical protein  21.86 
 
 
512 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0663  ABC-2 type transporter  28.49 
 
 
678 aa  90.9  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0395  hypothetical protein  26.46 
 
 
728 aa  87.4  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.564778  normal  0.0901394 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  24.09 
 
 
623 aa  81.6  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15730  YhgE/Pip-like protein  23.82 
 
 
882 aa  82  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5739  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  26.2 
 
 
683 aa  81.6  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.979212 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0687  YhgE/Pip C-terminal domain protein  24.47 
 
 
946 aa  80.1  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  20.94 
 
 
782 aa  79.3  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3327  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  23.94 
 
 
649 aa  71.6  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0644816  normal  0.846988 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3117  hypothetical protein  32.65 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  22.83 
 
 
1037 aa  70.9  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2897  hypothetical protein  32.65 
 
 
393 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2823  hypothetical protein  31.94 
 
 
393 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3114  hypothetical protein  32.65 
 
 
393 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394395  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2892  hypothetical protein  31.94 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0559889  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2866  hypothetical protein  31.94 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.96349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3135  hypothetical protein  31.94 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1469  membrane protein-like protein  35.29 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3138  hypothetical protein  34.19 
 
 
393 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.393136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>