104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0758 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0758  YhgE/Pip N-terminal domain protein  100 
 
 		 718 aa  1398    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0761  YhgE/Pip N-terminal domain protein  49.03 
 
 		 711 aa  621  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0432  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.83 
 
 		 666 aa  246  9e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347032  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4995  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 		 669 aa  231  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0951558  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1752  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 669 aa  220  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0282  YhgE/Pip C-terminal domain protein  27.58 
 
 		 702 aa  219  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  27.96 
 
 		 695 aa  205  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6104  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  39.81 
 
 		 597 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  24.43 
 
 		 769 aa  197  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5526  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.76 
 
 		 631 aa  196  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0560  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.44 
 
 		 692 aa  192  2e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000430326 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  36.51 
 
 		 819 aa  181  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  25.45 
 
 		 663 aa  180  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  24.69 
 
 		 666 aa  180  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  24.55 
 
 		 666 aa  179  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  24.55 
 
 		 666 aa  179  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  25.64 
 
 		 666 aa  179  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  25.18 
 
 		 666 aa  178  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  25.07 
 
 		 666 aa  178  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0952  YhgE/Pip C-terminal domain protein  30.42 
 
 		 646 aa  178  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0289849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  25.03 
 
 		 666 aa  178  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2916  putative phage infection protein  24.04 
 
 		 721 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  23.48 
 
 		 797 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  22.58 
 
 		 825 aa  174  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  24.17 
 
 		 666 aa  174  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2594  phage infection protein, putative  23.8 
 
 		 721 aa  172  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0811  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.04 
 
 		 678 aa  167  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  24.52 
 
 		 737 aa  157  8e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  32.02 
 
 		 759 aa  157  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  25.46 
 
 		 772 aa  156  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1944  hypothetical protein  25.2 
 
 		 721 aa  150  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2915  putative phage infection protein  23.89 
 
 		 718 aa  148  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11020  YhgE/Pip-like protein  24.68 
 
 		 958 aa  146  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.458925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2593  phage infection protein, putative  22.82 
 
 		 718 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  29.45 
 
 		 857 aa  142  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0499  YhgE/Pip N-terminal domain protein  24.3 
 
 		 876 aa  140  7.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0082  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.37 
 
 		 785 aa  134  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0395  hypothetical protein  36.73 
 
 		 728 aa  132  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.564778  normal  0.0901394 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0180  hypothetical protein  24.64 
 
 		 754 aa  124  8e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  24.49 
 
 		 911 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1501  hypothetical protein  23.32 
 
 		 887 aa  123  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1500  hypothetical protein  24.56 
 
 		 779 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  33.16 
 
 		 1114 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  28.57 
 
 		 869 aa  122  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  28.57 
 
 		 869 aa  122  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  28.57 
 
 		 869 aa  122  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1246  hypothetical protein  23.64 
 
 		 876 aa  122  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  28.57 
 
 		 869 aa  122  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  32.64 
 
 		 924 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  28.08 
 
 		 1111 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0498  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.87 
 
 		 726 aa  120  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.325694  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  34.1 
 
 		 923 aa  119  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1632  membrane protein-like protein  25.84 
 
 		 955 aa  116  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000847897  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02050  YhgE/Pip-like protein  27.08 
 
 		 988 aa  115  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2510  YhgE/Pip N-terminal domain protein  22.63 
 
 		 705 aa  115  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  24.13 
 
 		 915 aa  115  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5391  phage infection protein  40.77 
 
 		 142 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2134  hypothetical protein  32.02 
 
 		 772 aa  114  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00916626  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11010  YhgE/Pip-like protein  26.13 
 
 		 724 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.659482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06020  YhgE/Pip-like protein  23.84 
 
 		 717 aa  111  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.333428  normal  0.219375 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1969  hypothetical protein  25.95 
 
 		 789 aa  111  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06030  YhgE/Pip-like protein  23.26 
 
 		 967 aa  111  5e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.646381  normal  0.719714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5739  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  24.52 
 
 		 683 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.979212 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0663  ABC-2 type transporter  30.55 
 
 		 678 aa  106  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1462  YhgE/Pip C-terminal domain protein  22.97 
 
 		 728 aa  105  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  25.17 
 
 		 782 aa  103  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1762  YhgE/Pip N-terminal domain protein  22.24 
 
 		 723 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3321  transcriptional regulator, MarR family  24.1 
 
 		 733 aa  100  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156979  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2262  phage infection protein  26.48 
 
 		 954 aa  97.1  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26740  YhgE/Pip-like protein  31.12 
 
 		 823 aa  92.8  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1247  hypothetical protein  21.74 
 
 		 720 aa  92  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0357  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 940 aa  90.1  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1461  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.18 
 
 		 881 aa  89  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  0.893103 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2667  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 993 aa  88.2  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2723  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 993 aa  88.2  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0484  hypothetical protein  31.93 
 
 		 953 aa  84  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0350  hypothetical protein  31.93 
 
 		 953 aa  84  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0417  phage infection protein  25.47 
 
 		 991 aa  84  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466576 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0473  phage infection protein  25.47 
 
 		 981 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0360  hypothetical protein  31.09 
 
 		 941 aa  82  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0346  hypothetical protein  31.09 
 
 		 941 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0374  hypothetical protein  31.09 
 
 		 941 aa  82  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0430  hypothetical protein  30 
 
 		 953 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0882227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4888  phage infection protein  30 
 
 		 953 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108734  normal  0.760577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3327  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  25.59 
 
 		 649 aa  80.1  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0644816  normal  0.846988 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1037 aa  75.5  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0355  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 		 981 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0687  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.17 
 
 		 946 aa  74.7  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1469  membrane protein-like protein  42.47 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15730  YhgE/Pip-like protein  32.2 
 
 		 882 aa  68.2  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  25.55 
 
 		 623 aa  67  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3217  YhgE/Pip N-terminal domain protein  30.98 
 
 		 740 aa  66.2  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0017826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3220  hypothetical protein  30 
 
 		 1275 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1913  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1198 aa  58.9  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0476202  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5390  hypothetical protein  21.68 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2085  hypothetical protein  32.18 
 
 		 1263 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1038  phage infection protein, putative  23.01 
 
 		 1003 aa  55.1  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.687309  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1573  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1197 aa  55.1  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.275879  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6227  hypothetical protein  32.63 
 
 		 465 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1962  hypothetical protein  22.08 
 
 		 936 aa  48.1  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>