111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0499 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0499  YhgE/Pip N-terminal domain protein  100 
 
 		 876 aa  1773    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1501  hypothetical protein  37.74 
 
 		 887 aa  571  1e-161  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06030  YhgE/Pip-like protein  33.15 
 
 		 967 aa  542  9.999999999999999e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.646381  normal  0.719714 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11020  YhgE/Pip-like protein  35.55 
 
 		 958 aa  540  9.999999999999999e-153  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.458925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1246  hypothetical protein  33.41 
 
 		 876 aa  506  9.999999999999999e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1461  YhgE/Pip C-terminal domain protein  30.1 
 
 		 881 aa  405  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  0.893103 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0498  YhgE/Pip C-terminal domain protein  32.71 
 
 		 726 aa  365  3e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.325694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1500  hypothetical protein  28.63 
 
 		 779 aa  357  5.999999999999999e-97  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11010  YhgE/Pip-like protein  30 
 
 		 724 aa  345  2e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.659482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06020  YhgE/Pip-like protein  31.33 
 
 		 717 aa  343  7e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.333428  normal  0.219375 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2916  putative phage infection protein  30.11 
 
 		 721 aa  320  7e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1462  YhgE/Pip C-terminal domain protein  27.74 
 
 		 728 aa  318  2e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2594  phage infection protein, putative  29.44 
 
 		 721 aa  317  9e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1762  YhgE/Pip N-terminal domain protein  29.09 
 
 		 723 aa  303  9e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2915  putative phage infection protein  29.59 
 
 		 718 aa  297  6e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1247  hypothetical protein  26.11 
 
 		 720 aa  296  8e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2510  YhgE/Pip N-terminal domain protein  27.23 
 
 		 705 aa  280  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2593  phage infection protein, putative  28.49 
 
 		 718 aa  278  3e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  25.19 
 
 		 772 aa  189  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.63 
 
 		 737 aa  184  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0473  phage infection protein  24.73 
 
 		 981 aa  177  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0357  ABC-2 type transporter  23.9 
 
 		 940 aa  177  8e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0430  hypothetical protein  25.24 
 
 		 953 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0882227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0484  hypothetical protein  24.62 
 
 		 953 aa  175  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0560  YhgE/Pip C-terminal domain protein  24.46 
 
 		 692 aa  174  3.9999999999999995e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000430326 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2667  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 993 aa  174  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2723  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 993 aa  174  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0350  hypothetical protein  25.05 
 
 		 953 aa  173  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0360  hypothetical protein  28.53 
 
 		 941 aa  173  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0346  hypothetical protein  28.53 
 
 		 941 aa  172  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0374  hypothetical protein  28.53 
 
 		 941 aa  173  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0417  phage infection protein  29.78 
 
 		 991 aa  171  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466576 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0355  ABC-2 type transporter  30.41 
 
 		 981 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  25.72 
 
 		 695 aa  169  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1944  hypothetical protein  24.42 
 
 		 721 aa  167  8e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2262  phage infection protein  26.36 
 
 		 954 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4888  phage infection protein  25.49 
 
 		 953 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108734  normal  0.760577 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  23.82 
 
 		 666 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  21.71 
 
 		 769 aa  165  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  23.68 
 
 		 666 aa  165  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  23.86 
 
 		 666 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  22.63 
 
 		 825 aa  163  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  23.29 
 
 		 666 aa  163  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  23.29 
 
 		 666 aa  161  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  23.48 
 
 		 666 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  22.98 
 
 		 663 aa  159  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  23.48 
 
 		 666 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  23.79 
 
 		 666 aa  159  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0952  YhgE/Pip C-terminal domain protein  24.16 
 
 		 646 aa  155  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0289849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  24.09 
 
 		 797 aa  154  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0432  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.29 
 
 		 666 aa  148  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347032  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5526  YhgE/Pip C-terminal domain protein  22.57 
 
 		 631 aa  144  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0761  YhgE/Pip N-terminal domain protein  23.31 
 
 		 711 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1752  ABC-2 type transporter  22.24 
 
 		 669 aa  138  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0663  ABC-2 type transporter  23.72 
 
 		 678 aa  137  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0811  YhgE/Pip C-terminal domain protein  22.69 
 
 		 678 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4995  ABC-2 type transporter  22.14 
 
 		 669 aa  131  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0951558  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2134  hypothetical protein  23.12 
 
 		 772 aa  130  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00916626  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0282  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.11 
 
 		 702 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  24.9 
 
 		 1114 aa  122  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  25.43 
 
 		 869 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  25.43 
 
 		 869 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  25.43 
 
 		 869 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  25.34 
 
 		 911 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  26.32 
 
 		 869 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  29.54 
 
 		 1111 aa  115  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3321  transcriptional regulator, MarR family  24.63 
 
 		 733 aa  114  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1632  membrane protein-like protein  31.07 
 
 		 955 aa  112  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000847897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  24.74 
 
 		 759 aa  108  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0082  YhgE/Pip C-terminal domain protein  30.62 
 
 		 785 aa  107  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1969  hypothetical protein  27.09 
 
 		 789 aa  106  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  24.14 
 
 		 924 aa  105  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  24.81 
 
 		 923 aa  104  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  27.01 
 
 		 915 aa  102  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.12 
 
 		 857 aa  103  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0180  hypothetical protein  23.79 
 
 		 754 aa  101  5e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267919  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02050  YhgE/Pip-like protein  29.73 
 
 		 988 aa  95.5  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6104  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  27.38 
 
 		 597 aa  89.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  23.57 
 
 		 819 aa  86.3  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5391  phage infection protein  31.65 
 
 		 142 aa  85.5  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0758  YhgE/Pip N-terminal domain protein  27.85 
 
 		 718 aa  84  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0395  hypothetical protein  27.1 
 
 		 728 aa  80.1  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.564778  normal  0.0901394 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5390  hypothetical protein  22.7 
 
 		 512 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2823  hypothetical protein  30.63 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3138  hypothetical protein  27.51 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.393136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2892  hypothetical protein  27.51 
 
 		 393 aa  77  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0559889  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  23.33 
 
 		 623 aa  76.3  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2897  hypothetical protein  26.7 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3114  hypothetical protein  26.7 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3117  hypothetical protein  25.54 
 
 		 393 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3135  hypothetical protein  27.95 
 
 		 393 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0687  YhgE/Pip C-terminal domain protein  30.63 
 
 		 946 aa  73.2  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3105  phage infection protein  26.98 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1037 aa  71.6  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2132  phage infection protein  26.98 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2866  hypothetical protein  26.82 
 
 		 393 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.96349  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26740  YhgE/Pip-like protein  23.59 
 
 		 823 aa  69.3  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  23.06 
 
 		 782 aa  61.6  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3154  membrane protein-like protein  24.71 
 
 		 470 aa  59.3  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.131996  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1038  phage infection protein, putative  28 
 
 		 1003 aa  58.5  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.687309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>