134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2594 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2916  putative phage infection protein  94.31 
 
 
721 aa  1337    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2594  phage infection protein, putative  100 
 
 
721 aa  1428    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2915  putative phage infection protein  40.14 
 
 
718 aa  524  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2593  phage infection protein, putative  40.06 
 
 
718 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1762  YhgE/Pip N-terminal domain protein  31.62 
 
 
723 aa  352  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2510  YhgE/Pip N-terminal domain protein  28.45 
 
 
705 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0499  YhgE/Pip N-terminal domain protein  29.09 
 
 
876 aa  332  2e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1501  hypothetical protein  29.81 
 
 
887 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11010  YhgE/Pip-like protein  29 
 
 
724 aa  298  2e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.659482  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1246  hypothetical protein  27.9 
 
 
876 aa  298  2e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1500  hypothetical protein  27.34 
 
 
779 aa  298  2e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11020  YhgE/Pip-like protein  26.52 
 
 
958 aa  289  2e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.458925  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0357  ABC-2 type transporter  34.5 
 
 
940 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0417  phage infection protein  31.75 
 
 
991 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466576 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06030  YhgE/Pip-like protein  24.84 
 
 
967 aa  269  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.646381  normal  0.719714 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0484  hypothetical protein  33.84 
 
 
953 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0360  hypothetical protein  31.47 
 
 
941 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0374  hypothetical protein  31.47 
 
 
941 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0346  hypothetical protein  31.47 
 
 
941 aa  267  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0350  hypothetical protein  31.5 
 
 
953 aa  266  8e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0430  hypothetical protein  31.5 
 
 
953 aa  266  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0882227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0355  ABC-2 type transporter  32.5 
 
 
981 aa  265  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0473  phage infection protein  32.7 
 
 
981 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0498  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.01 
 
 
726 aa  265  2e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.325694  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06020  YhgE/Pip-like protein  25.7 
 
 
717 aa  265  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.333428  normal  0.219375 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1247  hypothetical protein  26.17 
 
 
720 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4888  phage infection protein  33.84 
 
 
953 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108734  normal  0.760577 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1462  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.68 
 
 
728 aa  241  2.9999999999999997e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  24.35 
 
 
769 aa  231  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  25.41 
 
 
825 aa  214  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0560  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.02 
 
 
692 aa  211  3e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000430326 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2262  phage infection protein  29.76 
 
 
954 aa  207  4e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  25.58 
 
 
666 aa  206  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  25 
 
 
666 aa  204  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  24 
 
 
869 aa  204  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  24.78 
 
 
666 aa  204  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  25.72 
 
 
666 aa  203  7e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  24 
 
 
869 aa  203  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  24 
 
 
869 aa  203  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  24.64 
 
 
666 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  25.18 
 
 
666 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  24.64 
 
 
666 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  23.86 
 
 
869 aa  201  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0180  hypothetical protein  25.57 
 
 
754 aa  202  3e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  24.86 
 
 
663 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  25.72 
 
 
666 aa  200  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2667  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 
993 aa  196  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2723  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 
993 aa  196  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  22.6 
 
 
797 aa  191  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2134  hypothetical protein  25.09 
 
 
772 aa  189  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00916626  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6104  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  23.01 
 
 
597 aa  189  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.18 
 
 
737 aa  187  6e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  27.24 
 
 
772 aa  187  8e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0082  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.58 
 
 
785 aa  182  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1944  hypothetical protein  23.43 
 
 
721 aa  176  9e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0761  YhgE/Pip N-terminal domain protein  23.86 
 
 
711 aa  170  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  21.58 
 
 
759 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5526  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.55 
 
 
631 aa  165  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0432  YhgE/Pip C-terminal domain protein  21.99 
 
 
666 aa  164  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347032  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0952  YhgE/Pip C-terminal domain protein  21.17 
 
 
646 aa  160  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0289849  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0282  YhgE/Pip C-terminal domain protein  22.78 
 
 
702 aa  157  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459983  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4995  ABC-2 type transporter  22.51 
 
 
669 aa  153  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0951558  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  27.06 
 
 
923 aa  151  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  27.06 
 
 
924 aa  150  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0663  ABC-2 type transporter  23.01 
 
 
678 aa  149  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1632  membrane protein-like protein  25.05 
 
 
955 aa  149  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000847897  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1752  ABC-2 type transporter  21.59 
 
 
669 aa  147  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  24.41 
 
 
1114 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  26.18 
 
 
911 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1461  YhgE/Pip C-terminal domain protein  34.51 
 
 
881 aa  141  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  0.893103 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  24.16 
 
 
1111 aa  142  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  21.02 
 
 
695 aa  136  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1969  hypothetical protein  28.97 
 
 
789 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  25.57 
 
 
915 aa  129  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3321  transcriptional regulator, MarR family  21.48 
 
 
733 aa  124  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156979  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0395  hypothetical protein  21 
 
 
728 aa  122  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.564778  normal  0.0901394 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  24.22 
 
 
857 aa  120  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0811  YhgE/Pip C-terminal domain protein  22.41 
 
 
678 aa  119  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02050  YhgE/Pip-like protein  20.71 
 
 
988 aa  107  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5390  hypothetical protein  22.57 
 
 
512 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0758  YhgE/Pip N-terminal domain protein  29.41 
 
 
718 aa  97.8  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  25.59 
 
 
623 aa  97.1  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5391  phage infection protein  32.09 
 
 
142 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  20.41 
 
 
819 aa  95.5  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  20.42 
 
 
782 aa  92  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  22.31 
 
 
1037 aa  88.2  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5739  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  21.93 
 
 
683 aa  85.9  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.979212 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0687  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.57 
 
 
946 aa  82.8  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26740  YhgE/Pip-like protein  24.26 
 
 
823 aa  82  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1469  membrane protein-like protein  36.14 
 
 
238 aa  73.9  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3217  YhgE/Pip N-terminal domain protein  19.01 
 
 
740 aa  72.8  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0017826  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3037  YhgE/Pip N-terminal domain protein  20 
 
 
732 aa  71.2  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0267  hypothetical protein  25.85 
 
 
1009 aa  68.2  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0274  hypothetical protein  25.85 
 
 
1009 aa  68.2  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2892  hypothetical protein  28.98 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0559889  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1573  hypothetical protein  29.83 
 
 
1197 aa  67  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.275879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2132  phage infection protein  31.25 
 
 
393 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3117  hypothetical protein  29.03 
 
 
393 aa  64.7  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3138  hypothetical protein  28.98 
 
 
393 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.393136  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3135  hypothetical protein  27.78 
 
 
393 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>