157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0761 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0761  YhgE/Pip N-terminal domain protein  100 
 
 		 711 aa  1390    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0758  YhgE/Pip N-terminal domain protein  49.03 
 
 		 718 aa  591  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  41.25 
 
 		 819 aa  488  1e-136  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6104  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  37.83 
 
 		 597 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0952  YhgE/Pip C-terminal domain protein  37.83 
 
 		 646 aa  399  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0289849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  35.16 
 
 		 759 aa  389  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0282  YhgE/Pip C-terminal domain protein  32.21 
 
 		 702 aa  313  5.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0811  YhgE/Pip C-terminal domain protein  33.05 
 
 		 678 aa  303  8.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5526  YhgE/Pip C-terminal domain protein  30.34 
 
 		 631 aa  302  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0663  ABC-2 type transporter  33.29 
 
 		 678 aa  301  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  32.39 
 
 		 695 aa  298  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0432  YhgE/Pip C-terminal domain protein  30.03 
 
 		 666 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347032  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4995  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 		 669 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0951558  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0560  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.28 
 
 		 692 aa  279  1e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000430326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1752  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 		 669 aa  278  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  27.94 
 
 		 769 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  27.18 
 
 		 797 aa  267  5e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0395  hypothetical protein  34.85 
 
 		 728 aa  267  5e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.564778  normal  0.0901394 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  25.99 
 
 		 825 aa  260  6e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  28.01 
 
 		 663 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  28.18 
 
 		 666 aa  244  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  27.58 
 
 		 666 aa  242  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  27.72 
 
 		 666 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  27.72 
 
 		 666 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  27.44 
 
 		 666 aa  241  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  28.18 
 
 		 666 aa  241  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  28.32 
 
 		 666 aa  239  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  27.05 
 
 		 772 aa  238  4e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2134  hypothetical protein  26.91 
 
 		 772 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00916626  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  26.77 
 
 		 666 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  24.97 
 
 		 869 aa  231  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  24.74 
 
 		 869 aa  231  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  24.62 
 
 		 869 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  24.62 
 
 		 869 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5739  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  30.87 
 
 		 683 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.979212 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  29.91 
 
 		 782 aa  212  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1944  hypothetical protein  27.96 
 
 		 721 aa  207  4e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1969  hypothetical protein  25.31 
 
 		 789 aa  204  6e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.25 
 
 		 737 aa  198  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0082  YhgE/Pip C-terminal domain protein  29.52 
 
 		 785 aa  195  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.64 
 
 		 857 aa  187  6e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3327  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  31.76 
 
 		 649 aa  182  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0644816  normal  0.846988 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3321  transcriptional regulator, MarR family  27.31 
 
 		 733 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2916  putative phage infection protein  24.93 
 
 		 721 aa  173  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  26.65 
 
 		 1114 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  26.01 
 
 		 1111 aa  164  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11020  YhgE/Pip-like protein  23.64 
 
 		 958 aa  163  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.458925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  30.19 
 
 		 1037 aa  162  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2594  phage infection protein, putative  23.28 
 
 		 721 aa  162  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  26.76 
 
 		 911 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02050  YhgE/Pip-like protein  31.33 
 
 		 988 aa  158  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3217  YhgE/Pip N-terminal domain protein  30.43 
 
 		 740 aa  157  9e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0017826  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2915  putative phage infection protein  23.81 
 
 		 718 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  25.73 
 
 		 923 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  24.56 
 
 		 924 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0180  hypothetical protein  22.93 
 
 		 754 aa  152  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267919  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1632  membrane protein-like protein  27.84 
 
 		 955 aa  151  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000847897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2593  phage infection protein, putative  23.16 
 
 		 718 aa  150  6e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  24.75 
 
 		 915 aa  150  9e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0687  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.83 
 
 		 946 aa  146  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5390  hypothetical protein  26.31 
 
 		 512 aa  146  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1246  hypothetical protein  25.35 
 
 		 876 aa  144  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0499  YhgE/Pip N-terminal domain protein  23.42 
 
 		 876 aa  142  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1501  hypothetical protein  25.07 
 
 		 887 aa  140  6e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2510  YhgE/Pip N-terminal domain protein  24.96 
 
 		 705 aa  140  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3037  YhgE/Pip N-terminal domain protein  30.38 
 
 		 732 aa  139  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06030  YhgE/Pip-like protein  23.86 
 
 		 967 aa  137  6.0000000000000005e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.646381  normal  0.719714 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06020  YhgE/Pip-like protein  25.18 
 
 		 717 aa  137  9e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.333428  normal  0.219375 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1500  hypothetical protein  23.7 
 
 		 779 aa  136  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11010  YhgE/Pip-like protein  23.17 
 
 		 724 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.659482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1762  YhgE/Pip N-terminal domain protein  23.08 
 
 		 723 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26740  YhgE/Pip-like protein  31.07 
 
 		 823 aa  125  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15730  YhgE/Pip-like protein  27.59 
 
 		 882 aa  120  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1461  YhgE/Pip C-terminal domain protein  24.82 
 
 		 881 aa  119  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  0.893103 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1462  YhgE/Pip C-terminal domain protein  22.05 
 
 		 728 aa  117  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1247  hypothetical protein  23.63 
 
 		 720 aa  115  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0498  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.95 
 
 		 726 aa  113  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.325694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  26.16 
 
 		 623 aa  110  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0350  hypothetical protein  23.53 
 
 		 953 aa  101  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0430  hypothetical protein  23.53 
 
 		 953 aa  97.1  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0882227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5391  phage infection protein  41.82 
 
 		 142 aa  96.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0360  hypothetical protein  23.02 
 
 		 941 aa  95.5  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0374  hypothetical protein  23.02 
 
 		 941 aa  95.5  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2667  ABC-2 type transporter  26.95 
 
 		 993 aa  95.9  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2723  ABC-2 type transporter  26.95 
 
 		 993 aa  95.9  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0346  hypothetical protein  22.84 
 
 		 941 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0357  ABC-2 type transporter  37.27 
 
 		 940 aa  92.8  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0417  phage infection protein  20.55 
 
 		 991 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466576 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0484  hypothetical protein  22.85 
 
 		 953 aa  90.5  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0473  phage infection protein  21.52 
 
 		 981 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4888  phage infection protein  22.16 
 
 		 953 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108734  normal  0.760577 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0355  ABC-2 type transporter  20.19 
 
 		 981 aa  87.8  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2262  phage infection protein  35.07 
 
 		 954 aa  85.5  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  32.59 
 
 		 1068 aa  79.7  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  25.71 
 
 		 1211 aa  75.5  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  27.24 
 
 		 1038 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  25.09 
 
 		 1040 aa  73.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  29.83 
 
 		 1246 aa  72  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  25.68 
 
 		 1041 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  25.34 
 
 		 1038 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>