128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1969 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG2134  hypothetical protein  47.67 
 
 
772 aa  697    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00916626  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1969  hypothetical protein  100 
 
 
789 aa  1556    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  31.42 
 
 
915 aa  393  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 
825 aa  319  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0180  hypothetical protein  31.68 
 
 
754 aa  309  2.0000000000000002e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267919  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1944  hypothetical protein  30.23 
 
 
721 aa  305  2.0000000000000002e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  27.73 
 
 
869 aa  298  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  27.92 
 
 
869 aa  296  8e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  27.48 
 
 
869 aa  296  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  27.48 
 
 
869 aa  296  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1632  membrane protein-like protein  27.62 
 
 
955 aa  295  2e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000847897  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  29.22 
 
 
797 aa  295  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  28.05 
 
 
911 aa  293  6e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  28.17 
 
 
923 aa  290  9e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  31.98 
 
 
623 aa  289  1e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  28.86 
 
 
924 aa  289  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  27.2 
 
 
769 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  26.79 
 
 
819 aa  236  1.0000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0082  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.73 
 
 
785 aa  234  4.0000000000000004e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  28.03 
 
 
772 aa  230  6e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.68 
 
 
857 aa  228  3e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.65 
 
 
737 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  25.33 
 
 
759 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0761  YhgE/Pip N-terminal domain protein  24.84 
 
 
711 aa  206  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  35 
 
 
1111 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  35.77 
 
 
1114 aa  188  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0560  YhgE/Pip C-terminal domain protein  24.59 
 
 
692 aa  185  3e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000430326 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  32.73 
 
 
666 aa  180  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  33.09 
 
 
666 aa  180  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  30.95 
 
 
666 aa  178  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  32.01 
 
 
666 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  32.73 
 
 
666 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  32.01 
 
 
666 aa  174  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  31.29 
 
 
666 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  31.29 
 
 
666 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  31.29 
 
 
663 aa  171  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  26.01 
 
 
782 aa  168  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  25.81 
 
 
1037 aa  163  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2593  phage infection protein, putative  23.2 
 
 
718 aa  162  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2915  putative phage infection protein  24.74 
 
 
718 aa  161  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26740  YhgE/Pip-like protein  21.7 
 
 
823 aa  160  7e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02050  YhgE/Pip-like protein  23.05 
 
 
988 aa  155  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0687  YhgE/Pip C-terminal domain protein  24.32 
 
 
946 aa  152  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6104  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  28.07 
 
 
597 aa  151  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0432  YhgE/Pip C-terminal domain protein  29.55 
 
 
666 aa  145  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347032  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3321  transcriptional regulator, MarR family  23.16 
 
 
733 aa  140  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156979  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  23.41 
 
 
695 aa  140  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0473  phage infection protein  27.4 
 
 
981 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4888  phage infection protein  37.42 
 
 
953 aa  132  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108734  normal  0.760577 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0282  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.06 
 
 
702 aa  132  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459983  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0360  hypothetical protein  36.81 
 
 
941 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0346  hypothetical protein  36.81 
 
 
941 aa  131  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0374  hypothetical protein  36.81 
 
 
941 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0350  hypothetical protein  36.81 
 
 
953 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0484  hypothetical protein  36.81 
 
 
953 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0417  phage infection protein  28.51 
 
 
991 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466576 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0430  hypothetical protein  36.81 
 
 
953 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0882227  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0357  ABC-2 type transporter  23.81 
 
 
940 aa  128  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0952  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.12 
 
 
646 aa  128  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0289849  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2594  phage infection protein, putative  35.5 
 
 
721 aa  128  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2916  putative phage infection protein  34.91 
 
 
721 aa  125  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1500  hypothetical protein  22.86 
 
 
779 aa  122  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4995  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 
669 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0951558  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15730  YhgE/Pip-like protein  22.92 
 
 
882 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0355  ABC-2 type transporter  35.58 
 
 
981 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2667  ABC-2 type transporter  30.95 
 
 
993 aa  115  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2723  ABC-2 type transporter  30.95 
 
 
993 aa  115  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1752  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 
669 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2262  phage infection protein  29.52 
 
 
954 aa  110  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0758  YhgE/Pip N-terminal domain protein  28.42 
 
 
718 aa  110  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5391  phage infection protein  38.6 
 
 
142 aa  109  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1462  YhgE/Pip C-terminal domain protein  20.57 
 
 
728 aa  107  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1246  hypothetical protein  27.16 
 
 
876 aa  107  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5526  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.49 
 
 
631 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3037  YhgE/Pip N-terminal domain protein  25.56 
 
 
732 aa  105  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5390  hypothetical protein  28.21 
 
 
512 aa  102  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5739  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  25.29 
 
 
683 aa  101  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.979212 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  28.75 
 
 
1246 aa  102  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0499  YhgE/Pip N-terminal domain protein  27.73 
 
 
876 aa  99.8  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11020  YhgE/Pip-like protein  23.53 
 
 
958 aa  98.2  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.458925  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0663  ABC-2 type transporter  26.69 
 
 
678 aa  94  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3327  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  28.9 
 
 
649 aa  93.2  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0644816  normal  0.846988 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2510  YhgE/Pip N-terminal domain protein  22.54 
 
 
705 aa  90.1  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06020  YhgE/Pip-like protein  26.53 
 
 
717 aa  89.4  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.333428  normal  0.219375 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0811  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.39 
 
 
678 aa  86.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1762  YhgE/Pip N-terminal domain protein  20.88 
 
 
723 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06030  YhgE/Pip-like protein  25.82 
 
 
967 aa  86.3  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.646381  normal  0.719714 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11010  YhgE/Pip-like protein  27.67 
 
 
724 aa  85.5  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.659482  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0395  hypothetical protein  27.31 
 
 
728 aa  84.3  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.564778  normal  0.0901394 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1461  YhgE/Pip C-terminal domain protein  29.59 
 
 
881 aa  82.8  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  0.893103 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0498  YhgE/Pip C-terminal domain protein  24.17 
 
 
726 aa  82.4  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.325694  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1247  hypothetical protein  23.39 
 
 
720 aa  80.9  0.00000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1501  hypothetical protein  23.88 
 
 
887 aa  80.1  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1469  membrane protein-like protein  38.55 
 
 
238 aa  75.1  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0814  hypothetical protein  26.17 
 
 
1002 aa  73.6  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0549  hypothetical protein  22.65 
 
 
767 aa  70.9  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3217  YhgE/Pip N-terminal domain protein  24.9 
 
 
740 aa  70.5  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0017826  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0250  hypothetical protein  23.51 
 
 
512 aa  64.7  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.460461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3220  hypothetical protein  21.49 
 
 
1275 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5806  hypothetical protein  26.89 
 
 
442 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>