136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2916 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2916  putative phage infection protein  100 
 
 
721 aa  1434    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2594  phage infection protein, putative  94.31 
 
 
721 aa  1321    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2915  putative phage infection protein  40.36 
 
 
718 aa  533  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2593  phage infection protein, putative  40.39 
 
 
718 aa  526  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1762  YhgE/Pip N-terminal domain protein  31.57 
 
 
723 aa  343  5e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2510  YhgE/Pip N-terminal domain protein  28.59 
 
 
705 aa  336  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0499  YhgE/Pip N-terminal domain protein  30.87 
 
 
876 aa  330  8e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11010  YhgE/Pip-like protein  29.81 
 
 
724 aa  302  1e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.659482  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1501  hypothetical protein  29.6 
 
 
887 aa  299  2e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1246  hypothetical protein  27.09 
 
 
876 aa  296  1e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1500  hypothetical protein  26.96 
 
 
779 aa  293  9e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11020  YhgE/Pip-like protein  25.88 
 
 
958 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.458925  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0357  ABC-2 type transporter  34.48 
 
 
940 aa  278  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0498  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.95 
 
 
726 aa  272  1e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.325694  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0355  ABC-2 type transporter  32.45 
 
 
981 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0417  phage infection protein  32.08 
 
 
991 aa  270  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466576 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06030  YhgE/Pip-like protein  25.49 
 
 
967 aa  269  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.646381  normal  0.719714 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06020  YhgE/Pip-like protein  28.21 
 
 
717 aa  268  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.333428  normal  0.219375 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0473  phage infection protein  32.95 
 
 
981 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0484  hypothetical protein  31.67 
 
 
953 aa  265  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0360  hypothetical protein  33.05 
 
 
941 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0346  hypothetical protein  33.05 
 
 
941 aa  265  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0374  hypothetical protein  33.05 
 
 
941 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0430  hypothetical protein  33.48 
 
 
953 aa  261  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0882227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0350  hypothetical protein  34.04 
 
 
953 aa  261  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1247  hypothetical protein  26.06 
 
 
720 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4888  phage infection protein  33.97 
 
 
953 aa  253  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108734  normal  0.760577 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1462  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.2 
 
 
728 aa  240  5.999999999999999e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.12 
 
 
769 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0560  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.94 
 
 
692 aa  215  2.9999999999999995e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000430326 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  25.6 
 
 
666 aa  208  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  25.68 
 
 
666 aa  205  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  25.18 
 
 
666 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  25.39 
 
 
663 aa  204  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  25.18 
 
 
666 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  25.64 
 
 
666 aa  204  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2262  phage infection protein  31.71 
 
 
954 aa  204  6e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  25.04 
 
 
666 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  24.65 
 
 
825 aa  201  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  25.18 
 
 
666 aa  200  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  25.35 
 
 
666 aa  200  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0180  hypothetical protein  25.13 
 
 
754 aa  198  3e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267919  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2667  ABC-2 type transporter  31.23 
 
 
993 aa  196  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2723  ABC-2 type transporter  31.23 
 
 
993 aa  196  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  22.76 
 
 
797 aa  194  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.79 
 
 
737 aa  191  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  25.62 
 
 
772 aa  189  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6104  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  23.3 
 
 
597 aa  187  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0761  YhgE/Pip N-terminal domain protein  25.53 
 
 
711 aa  182  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2134  hypothetical protein  24.78 
 
 
772 aa  182  2.9999999999999997e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00916626  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1944  hypothetical protein  24.13 
 
 
721 aa  178  4e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  22.96 
 
 
759 aa  173  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0282  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.18 
 
 
702 aa  164  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459983  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5526  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.12 
 
 
631 aa  159  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0432  YhgE/Pip C-terminal domain protein  20.94 
 
 
666 aa  157  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347032  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0952  YhgE/Pip C-terminal domain protein  21.48 
 
 
646 aa  157  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0289849  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4995  ABC-2 type transporter  23.91 
 
 
669 aa  156  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0951558  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1632  membrane protein-like protein  25.18 
 
 
955 aa  151  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000847897  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  24.73 
 
 
923 aa  145  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  24.73 
 
 
924 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1752  ABC-2 type transporter  22.6 
 
 
669 aa  144  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0663  ABC-2 type transporter  23.9 
 
 
678 aa  143  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1461  YhgE/Pip C-terminal domain protein  41.24 
 
 
881 aa  143  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  0.893103 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  21.78 
 
 
695 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  24.26 
 
 
1114 aa  139  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  24.27 
 
 
911 aa  137  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  23.89 
 
 
869 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  23.89 
 
 
869 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  23.89 
 
 
869 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  24.24 
 
 
1111 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  23.27 
 
 
869 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1969  hypothetical protein  29.92 
 
 
789 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  25.56 
 
 
915 aa  123  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3321  transcriptional regulator, MarR family  20.26 
 
 
733 aa  121  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156979  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  30.17 
 
 
857 aa  120  7.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0811  YhgE/Pip C-terminal domain protein  21.82 
 
 
678 aa  114  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0082  YhgE/Pip C-terminal domain protein  36.05 
 
 
785 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5390  hypothetical protein  23.83 
 
 
512 aa  110  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02050  YhgE/Pip-like protein  21.62 
 
 
988 aa  103  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0395  hypothetical protein  26.43 
 
 
728 aa  97.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.564778  normal  0.0901394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0758  YhgE/Pip N-terminal domain protein  29.65 
 
 
718 aa  95.1  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  27.46 
 
 
623 aa  94.7  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  22.1 
 
 
819 aa  94.4  8e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5391  phage infection protein  31.34 
 
 
142 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  20.79 
 
 
782 aa  90.1  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  19.55 
 
 
1037 aa  82.8  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26740  YhgE/Pip-like protein  24.91 
 
 
823 aa  82.8  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5739  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  25.56 
 
 
683 aa  81.6  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.979212 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0687  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.32 
 
 
946 aa  82  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1469  membrane protein-like protein  36.14 
 
 
238 aa  73.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3037  YhgE/Pip N-terminal domain protein  21.03 
 
 
732 aa  70.5  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3217  YhgE/Pip N-terminal domain protein  19.07 
 
 
740 aa  70.1  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0017826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2892  hypothetical protein  28.41 
 
 
393 aa  66.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0559889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2132  phage infection protein  31.75 
 
 
393 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3117  hypothetical protein  31.71 
 
 
393 aa  64.3  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0267  hypothetical protein  25 
 
 
1009 aa  63.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0274  hypothetical protein  25 
 
 
1009 aa  63.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1573  hypothetical protein  29.44 
 
 
1197 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.275879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3138  hypothetical protein  28.41 
 
 
393 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.393136  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3135  hypothetical protein  27.22 
 
 
393 aa  61.6  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>