147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_32380 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  100 
 
 
695 aa  1336    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5526  YhgE/Pip C-terminal domain protein  47.16 
 
 
631 aa  589  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0663  ABC-2 type transporter  40.62 
 
 
678 aa  429  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0811  YhgE/Pip C-terminal domain protein  39.72 
 
 
678 aa  421  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0761  YhgE/Pip N-terminal domain protein  31.71 
 
 
711 aa  296  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0432  YhgE/Pip C-terminal domain protein  31.6 
 
 
666 aa  290  4e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347032  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4995  ABC-2 type transporter  31.71 
 
 
669 aa  282  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0951558  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0395  hypothetical protein  37.59 
 
 
728 aa  274  4.0000000000000004e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.564778  normal  0.0901394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1752  ABC-2 type transporter  31.44 
 
 
669 aa  273  9e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0952  YhgE/Pip C-terminal domain protein  32.87 
 
 
646 aa  268  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0289849  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  30.63 
 
 
759 aa  268  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0560  YhgE/Pip C-terminal domain protein  29.15 
 
 
692 aa  267  5e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000430326 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0282  YhgE/Pip C-terminal domain protein  31.81 
 
 
702 aa  259  8e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459983  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  28.52 
 
 
797 aa  259  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  27.71 
 
 
769 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  29 
 
 
772 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.95 
 
 
857 aa  253  7e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6104  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  29.99 
 
 
597 aa  250  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  32.07 
 
 
819 aa  246  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.53 
 
 
737 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  27.47 
 
 
666 aa  238  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  27.03 
 
 
666 aa  234  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  27.03 
 
 
666 aa  234  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  27.33 
 
 
663 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  27.03 
 
 
666 aa  233  9e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  26.74 
 
 
666 aa  231  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  26.87 
 
 
666 aa  229  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  23.63 
 
 
825 aa  227  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  25.84 
 
 
666 aa  223  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  26.28 
 
 
666 aa  221  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  24.1 
 
 
869 aa  213  7e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0082  YhgE/Pip C-terminal domain protein  30.22 
 
 
785 aa  210  7e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2134  hypothetical protein  27.85 
 
 
772 aa  201  3e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00916626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  28.81 
 
 
1111 aa  197  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3321  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 
733 aa  191  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156979  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  28.25 
 
 
1114 aa  191  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0687  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.52 
 
 
946 aa  184  4.0000000000000006e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5390  hypothetical protein  28.3 
 
 
512 aa  178  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  25.17 
 
 
869 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  25.17 
 
 
869 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  25.29 
 
 
869 aa  171  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  31.3 
 
 
1037 aa  169  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  28.38 
 
 
782 aa  164  6e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1944  hypothetical protein  26.21 
 
 
721 aa  162  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0499  YhgE/Pip N-terminal domain protein  25.34 
 
 
876 aa  162  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  27.44 
 
 
911 aa  160  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  24.63 
 
 
924 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  24.46 
 
 
923 aa  159  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02050  YhgE/Pip-like protein  34.11 
 
 
988 aa  157  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  25.74 
 
 
915 aa  152  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06020  YhgE/Pip-like protein  25.66 
 
 
717 aa  145  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.333428  normal  0.219375 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1969  hypothetical protein  24 
 
 
789 aa  145  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5739  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  29.52 
 
 
683 aa  145  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.979212 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15730  YhgE/Pip-like protein  33.64 
 
 
882 aa  139  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11020  YhgE/Pip-like protein  24.41 
 
 
958 aa  137  5e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.458925  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2915  putative phage infection protein  23.42 
 
 
718 aa  137  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2916  putative phage infection protein  22.8 
 
 
721 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1501  hypothetical protein  24.86 
 
 
887 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0498  YhgE/Pip C-terminal domain protein  24.3 
 
 
726 aa  135  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.325694  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2593  phage infection protein, putative  23.45 
 
 
718 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1462  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.2 
 
 
728 aa  132  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0758  YhgE/Pip N-terminal domain protein  30.14 
 
 
718 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2594  phage infection protein, putative  20.66 
 
 
721 aa  127  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0180  hypothetical protein  22.43 
 
 
754 aa  127  9e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267919  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26740  YhgE/Pip-like protein  29.41 
 
 
823 aa  127  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  24.96 
 
 
623 aa  125  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1762  YhgE/Pip N-terminal domain protein  24.18 
 
 
723 aa  125  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1500  hypothetical protein  23.42 
 
 
779 aa  124  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2510  YhgE/Pip N-terminal domain protein  24.11 
 
 
705 aa  124  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1247  hypothetical protein  24.46 
 
 
720 aa  124  6e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3037  YhgE/Pip N-terminal domain protein  29.96 
 
 
732 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11010  YhgE/Pip-like protein  23.01 
 
 
724 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.659482  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1246  hypothetical protein  25.62 
 
 
876 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1632  membrane protein-like protein  25.17 
 
 
955 aa  112  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000847897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3327  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  30.94 
 
 
649 aa  108  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0644816  normal  0.846988 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0473  phage infection protein  22.24 
 
 
981 aa  108  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3217  YhgE/Pip N-terminal domain protein  29.79 
 
 
740 aa  107  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0017826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4888  phage infection protein  23.6 
 
 
953 aa  105  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108734  normal  0.760577 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0417  phage infection protein  21.96 
 
 
991 aa  105  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466576 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0350  hypothetical protein  23.68 
 
 
953 aa  103  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0357  ABC-2 type transporter  32.2 
 
 
940 aa  103  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0430  hypothetical protein  23.3 
 
 
953 aa  103  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0882227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0484  hypothetical protein  23.51 
 
 
953 aa  100  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0355  ABC-2 type transporter  21.3 
 
 
981 aa  97.8  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0346  hypothetical protein  22.54 
 
 
941 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06030  YhgE/Pip-like protein  27.14 
 
 
967 aa  94.4  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.646381  normal  0.719714 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0360  hypothetical protein  22.37 
 
 
941 aa  94  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0374  hypothetical protein  22.37 
 
 
941 aa  94  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2667  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 
993 aa  86.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2723  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 
993 aa  86.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1461  YhgE/Pip C-terminal domain protein  27.15 
 
 
881 aa  82.8  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  0.893103 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2262  phage infection protein  25.22 
 
 
954 aa  81.6  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  27.11 
 
 
1040 aa  76.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  33.33 
 
 
1246 aa  75.9  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1908  membrane protein-like protein  26.91 
 
 
642 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0193377  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  29.82 
 
 
1068 aa  75.5  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  23.71 
 
 
1038 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  25.81 
 
 
1041 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  25.09 
 
 
1038 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  24.37 
 
 
1038 aa  70.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>