136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5526 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5526  YhgE/Pip C-terminal domain protein  100 
 
 		 631 aa  1247    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  48.01 
 
 		 695 aa  600  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0663  ABC-2 type transporter  42.53 
 
 		 678 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0811  YhgE/Pip C-terminal domain protein  41.55 
 
 		 678 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0432  YhgE/Pip C-terminal domain protein  36.02 
 
 		 666 aa  361  3e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347032  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4995  ABC-2 type transporter  34.95 
 
 		 669 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0951558  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1752  ABC-2 type transporter  35.64 
 
 		 669 aa  325  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0395  hypothetical protein  36.18 
 
 		 728 aa  310  6.999999999999999e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.564778  normal  0.0901394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6104  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  33.33 
 
 		 597 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0952  YhgE/Pip C-terminal domain protein  35.42 
 
 		 646 aa  308  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0289849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0761  YhgE/Pip N-terminal domain protein  30.34 
 
 		 711 aa  295  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  30.83 
 
 		 759 aa  292  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0282  YhgE/Pip C-terminal domain protein  31.2 
 
 		 702 aa  266  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0560  YhgE/Pip C-terminal domain protein  27.05 
 
 		 692 aa  260  5.0000000000000005e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000430326 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  27.35 
 
 		 666 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  26.95 
 
 		 666 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  27.54 
 
 		 666 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  26.58 
 
 		 666 aa  213  7e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  26.69 
 
 		 666 aa  211  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  26.8 
 
 		 666 aa  210  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  26.8 
 
 		 663 aa  210  8e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  26.8 
 
 		 666 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  26.8 
 
 		 666 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.05 
 
 		 737 aa  199  9e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02050  YhgE/Pip-like protein  35.14 
 
 		 988 aa  182  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5739  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  29.35 
 
 		 683 aa  177  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.979212 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.86 
 
 		 857 aa  176  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3327  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  30.52 
 
 		 649 aa  173  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0644816  normal  0.846988 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3321  transcriptional regulator, MarR family  26.59 
 
 		 733 aa  173  9e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.17 
 
 		 769 aa  163  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  27.6 
 
 		 1114 aa  161  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  27.66 
 
 		 1111 aa  160  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  27.94 
 
 		 911 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  36.68 
 
 		 819 aa  159  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2916  putative phage infection protein  23.41 
 
 		 721 aa  158  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  26.68 
 
 		 924 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2594  phage infection protein, putative  23.42 
 
 		 721 aa  156  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  26.27 
 
 		 923 aa  153  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2915  putative phage infection protein  23.07 
 
 		 718 aa  152  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  28.1 
 
 		 797 aa  150  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  25.36 
 
 		 869 aa  145  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  25.36 
 
 		 869 aa  145  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  25.99 
 
 		 915 aa  145  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  25.36 
 
 		 869 aa  145  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  25.36 
 
 		 869 aa  144  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2510  YhgE/Pip N-terminal domain protein  25.08 
 
 		 705 aa  144  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2593  phage infection protein, putative  22.61 
 
 		 718 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1501  hypothetical protein  23.55 
 
 		 887 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0499  YhgE/Pip N-terminal domain protein  23.31 
 
 		 876 aa  140  8.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0687  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.7 
 
 		 946 aa  140  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1247  hypothetical protein  24.06 
 
 		 720 aa  138  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5390  hypothetical protein  27.59 
 
 		 512 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1632  membrane protein-like protein  26.93 
 
 		 955 aa  138  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000847897  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1500  hypothetical protein  23.11 
 
 		 779 aa  138  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 825 aa  137  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0758  YhgE/Pip N-terminal domain protein  27.6 
 
 		 718 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0082  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.45 
 
 		 785 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15730  YhgE/Pip-like protein  31.41 
 
 		 882 aa  134  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1762  YhgE/Pip N-terminal domain protein  22.49 
 
 		 723 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2134  hypothetical protein  21.37 
 
 		 772 aa  130  6e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00916626  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26740  YhgE/Pip-like protein  30.61 
 
 		 823 aa  130  8.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1944  hypothetical protein  21.99 
 
 		 721 aa  124  4e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3037  YhgE/Pip N-terminal domain protein  29.21 
 
 		 732 aa  124  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  25.8 
 
 		 772 aa  118  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  29.74 
 
 		 1037 aa  117  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11010  YhgE/Pip-like protein  23.33 
 
 		 724 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.659482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1246  hypothetical protein  23.87 
 
 		 876 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1462  YhgE/Pip C-terminal domain protein  22.95 
 
 		 728 aa  112  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0357  ABC-2 type transporter  22.77 
 
 		 940 aa  110  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0498  YhgE/Pip C-terminal domain protein  21.52 
 
 		 726 aa  110  7.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.325694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1969  hypothetical protein  25.49 
 
 		 789 aa  107  7e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  27.49 
 
 		 782 aa  106  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  27.74 
 
 		 623 aa  105  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11020  YhgE/Pip-like protein  23.08 
 
 		 958 aa  103  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.458925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0473  phage infection protein  22.53 
 
 		 981 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2667  ABC-2 type transporter  25.08 
 
 		 993 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2723  ABC-2 type transporter  25.08 
 
 		 993 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0484  hypothetical protein  27.14 
 
 		 953 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0180  hypothetical protein  22.45 
 
 		 754 aa  97.1  8e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0355  ABC-2 type transporter  25.29 
 
 		 981 aa  95.9  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0430  hypothetical protein  26.77 
 
 		 953 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0882227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0417  phage infection protein  25.33 
 
 		 991 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466576 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0360  hypothetical protein  25.67 
 
 		 941 aa  94.7  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0350  hypothetical protein  23.53 
 
 		 953 aa  94.7  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0374  hypothetical protein  25.67 
 
 		 941 aa  94.7  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06030  YhgE/Pip-like protein  29.61 
 
 		 967 aa  94.7  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.646381  normal  0.719714 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0346  hypothetical protein  25.67 
 
 		 941 aa  94.4  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4888  phage infection protein  27.16 
 
 		 953 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108734  normal  0.760577 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2262  phage infection protein  23.43 
 
 		 954 aa  91.7  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06020  YhgE/Pip-like protein  26.39 
 
 		 717 aa  90.9  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.333428  normal  0.219375 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3217  YhgE/Pip N-terminal domain protein  37.84 
 
 		 740 aa  89  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0017826  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1461  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.3 
 
 		 881 aa  70.1  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  0.893103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5806  hypothetical protein  33.96 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  24.48 
 
 		 1049 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  31.22 
 
 		 1068 aa  67.8  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5391  phage infection protein  26.81 
 
 		 142 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  30.17 
 
 		 1246 aa  61.2  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  23.77 
 
 		 1038 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2132  phage infection protein  24.37 
 
 		 393 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3135  hypothetical protein  27.12 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>