139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0663 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0663  ABC-2 type transporter  100 
 
 
678 aa  1338    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0811  YhgE/Pip C-terminal domain protein  83.19 
 
 
678 aa  1070    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5526  YhgE/Pip C-terminal domain protein  42.53 
 
 
631 aa  504  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  40.62 
 
 
695 aa  468  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  33.07 
 
 
759 aa  342  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0432  YhgE/Pip C-terminal domain protein  34.12 
 
 
666 aa  340  5.9999999999999996e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347032  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0761  YhgE/Pip N-terminal domain protein  32.87 
 
 
711 aa  330  6e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0952  YhgE/Pip C-terminal domain protein  35.19 
 
 
646 aa  310  4e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0289849  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4995  ABC-2 type transporter  32.21 
 
 
669 aa  302  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0951558  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1752  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 
669 aa  290  9e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0560  YhgE/Pip C-terminal domain protein  29.18 
 
 
692 aa  265  3e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000430326 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0395  hypothetical protein  34.21 
 
 
728 aa  259  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.564778  normal  0.0901394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0282  YhgE/Pip C-terminal domain protein  31.27 
 
 
702 aa  259  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459983  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6104  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  30.8 
 
 
597 aa  259  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.16 
 
 
769 aa  250  8e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  26.39 
 
 
825 aa  243  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  27.32 
 
 
797 aa  237  7e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  29.53 
 
 
819 aa  226  9e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5739  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  30.69 
 
 
683 aa  223  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.979212 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  27.93 
 
 
666 aa  217  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  26.98 
 
 
666 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.31 
 
 
737 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  26.98 
 
 
666 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0082  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.88 
 
 
785 aa  213  7e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  26.7 
 
 
666 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  26.7 
 
 
666 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  27.33 
 
 
666 aa  211  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  28.2 
 
 
663 aa  211  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  26.55 
 
 
666 aa  209  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  27 
 
 
666 aa  206  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  29.53 
 
 
1114 aa  204  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  27.36 
 
 
772 aa  191  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  29.2 
 
 
1111 aa  190  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  31.13 
 
 
857 aa  184  5.0000000000000004e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3321  transcriptional regulator, MarR family  27.65 
 
 
733 aa  182  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156979  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1944  hypothetical protein  24.58 
 
 
721 aa  169  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  27.14 
 
 
869 aa  168  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  27.14 
 
 
869 aa  168  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  27.14 
 
 
869 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  26.96 
 
 
869 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  27.65 
 
 
782 aa  164  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  28.02 
 
 
923 aa  164  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2594  phage infection protein, putative  22.79 
 
 
721 aa  162  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06020  YhgE/Pip-like protein  26.21 
 
 
717 aa  162  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.333428  normal  0.219375 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  28.54 
 
 
924 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02050  YhgE/Pip-like protein  35.78 
 
 
988 aa  160  9e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2916  putative phage infection protein  23.53 
 
 
721 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11020  YhgE/Pip-like protein  25.32 
 
 
958 aa  157  4e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.458925  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2134  hypothetical protein  22.7 
 
 
772 aa  157  7e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00916626  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  25.5 
 
 
911 aa  155  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5390  hypothetical protein  26.84 
 
 
512 aa  151  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2915  putative phage infection protein  22.35 
 
 
718 aa  150  8e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2593  phage infection protein, putative  21.87 
 
 
718 aa  148  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0499  YhgE/Pip N-terminal domain protein  23.82 
 
 
876 aa  147  6e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1501  hypothetical protein  25.18 
 
 
887 aa  145  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  26.95 
 
 
915 aa  145  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3327  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  28.41 
 
 
649 aa  145  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0644816  normal  0.846988 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  31.26 
 
 
1037 aa  140  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15730  YhgE/Pip-like protein  30.84 
 
 
882 aa  141  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0180  hypothetical protein  23.92 
 
 
754 aa  135  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267919  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3217  YhgE/Pip N-terminal domain protein  27.21 
 
 
740 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0017826  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1247  hypothetical protein  24.49 
 
 
720 aa  130  6e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1462  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.94 
 
 
728 aa  125  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3037  YhgE/Pip N-terminal domain protein  28.55 
 
 
732 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0498  YhgE/Pip C-terminal domain protein  22.43 
 
 
726 aa  121  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.325694  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0687  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.82 
 
 
946 aa  121  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1632  membrane protein-like protein  29.75 
 
 
955 aa  120  7e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000847897  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1762  YhgE/Pip N-terminal domain protein  23.31 
 
 
723 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2510  YhgE/Pip N-terminal domain protein  22.6 
 
 
705 aa  118  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26740  YhgE/Pip-like protein  29.94 
 
 
823 aa  117  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11010  YhgE/Pip-like protein  23.48 
 
 
724 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.659482  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1246  hypothetical protein  22.88 
 
 
876 aa  114  6e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2667  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 
993 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2723  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 
993 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0758  YhgE/Pip N-terminal domain protein  32.65 
 
 
718 aa  104  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0473  phage infection protein  23.35 
 
 
981 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2262  phage infection protein  28.7 
 
 
954 aa  102  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  25.95 
 
 
623 aa  101  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0417  phage infection protein  24.47 
 
 
991 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466576 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4888  phage infection protein  26.51 
 
 
953 aa  100  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108734  normal  0.760577 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0484  hypothetical protein  24.94 
 
 
953 aa  100  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0346  hypothetical protein  24.62 
 
 
941 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0430  hypothetical protein  30.6 
 
 
953 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0882227  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0360  hypothetical protein  24.62 
 
 
941 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0350  hypothetical protein  30.6 
 
 
953 aa  99.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0374  hypothetical protein  24.62 
 
 
941 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0357  ABC-2 type transporter  26.18 
 
 
940 aa  99  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1500  hypothetical protein  23.7 
 
 
779 aa  99  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0355  ABC-2 type transporter  30.05 
 
 
981 aa  98.2  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1969  hypothetical protein  26.69 
 
 
789 aa  95.1  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06030  YhgE/Pip-like protein  25.98 
 
 
967 aa  87.4  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.646381  normal  0.719714 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  29.47 
 
 
1054 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  39.2 
 
 
1246 aa  67.4  0.0000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2261  hypothetical protein  30.65 
 
 
266 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000562988 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1469  membrane protein-like protein  40.23 
 
 
238 aa  65.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6227  hypothetical protein  31.55 
 
 
465 aa  65.1  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5806  hypothetical protein  31.33 
 
 
442 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  25.29 
 
 
1040 aa  61.6  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  25 
 
 
1211 aa  60.8  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  31.68 
 
 
1038 aa  60.8  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>