109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06020 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_06020  YhgE/Pip-like protein  100 
 
 
717 aa  1441    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.333428  normal  0.219375 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11010  YhgE/Pip-like protein  39.56 
 
 
724 aa  541  9.999999999999999e-153  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.659482  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1462  YhgE/Pip C-terminal domain protein  37.23 
 
 
728 aa  480  1e-134  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1500  hypothetical protein  36.03 
 
 
779 aa  476  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1247  hypothetical protein  36.19 
 
 
720 aa  466  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0498  YhgE/Pip C-terminal domain protein  32.43 
 
 
726 aa  412  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.325694  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0499  YhgE/Pip N-terminal domain protein  30.81 
 
 
876 aa  348  3e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06030  YhgE/Pip-like protein  29.8 
 
 
967 aa  334  4e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.646381  normal  0.719714 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1501  hypothetical protein  31.5 
 
 
887 aa  328  3e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11020  YhgE/Pip-like protein  30.72 
 
 
958 aa  328  3e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.458925  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1246  hypothetical protein  28.4 
 
 
876 aa  296  9e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2510  YhgE/Pip N-terminal domain protein  27.89 
 
 
705 aa  287  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2916  putative phage infection protein  26.73 
 
 
721 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2594  phage infection protein, putative  26.19 
 
 
721 aa  268  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1762  YhgE/Pip N-terminal domain protein  25.2 
 
 
723 aa  256  8e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2593  phage infection protein, putative  27.18 
 
 
718 aa  244  5e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2915  putative phage infection protein  27.54 
 
 
718 aa  242  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0357  ABC-2 type transporter  26.95 
 
 
940 aa  198  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0473  phage infection protein  28.29 
 
 
981 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0355  ABC-2 type transporter  25.89 
 
 
981 aa  196  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0350  hypothetical protein  29.58 
 
 
953 aa  194  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0484  hypothetical protein  27.7 
 
 
953 aa  194  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0430  hypothetical protein  27.89 
 
 
953 aa  192  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0882227  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0346  hypothetical protein  26.32 
 
 
941 aa  191  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0417  phage infection protein  27.35 
 
 
991 aa  191  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466576 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0360  hypothetical protein  26.32 
 
 
941 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0374  hypothetical protein  26.32 
 
 
941 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4888  phage infection protein  25.17 
 
 
953 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108734  normal  0.760577 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  25.86 
 
 
772 aa  183  9.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2262  phage infection protein  28.05 
 
 
954 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  24.92 
 
 
666 aa  173  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2667  ABC-2 type transporter  28.68 
 
 
993 aa  172  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2723  ABC-2 type transporter  28.68 
 
 
993 aa  172  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  23.99 
 
 
666 aa  172  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  22.11 
 
 
769 aa  170  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0432  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.4 
 
 
666 aa  169  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  23.78 
 
 
666 aa  169  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  24.29 
 
 
666 aa  168  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  23.99 
 
 
666 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  23.99 
 
 
666 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  24.93 
 
 
663 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  23.51 
 
 
666 aa  164  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  23.64 
 
 
666 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  24.71 
 
 
737 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4995  ABC-2 type transporter  26.17 
 
 
669 aa  157  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0951558  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  27.31 
 
 
695 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1461  YhgE/Pip C-terminal domain protein  29.93 
 
 
881 aa  151  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  0.893103 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0663  ABC-2 type transporter  26.49 
 
 
678 aa  150  8e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0560  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.33 
 
 
692 aa  148  3e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000430326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5526  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.93 
 
 
631 aa  144  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0952  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.29 
 
 
646 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0289849  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0761  YhgE/Pip N-terminal domain protein  25.79 
 
 
711 aa  142  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1752  ABC-2 type transporter  25.26 
 
 
669 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3321  transcriptional regulator, MarR family  24.02 
 
 
733 aa  139  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156979  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0811  YhgE/Pip C-terminal domain protein  24.83 
 
 
678 aa  139  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1944  hypothetical protein  23.56 
 
 
721 aa  137  8e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0282  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.48 
 
 
702 aa  125  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459983  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  22.74 
 
 
825 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  24.89 
 
 
1111 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  21.52 
 
 
869 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  21.3 
 
 
869 aa  107  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  21.3 
 
 
869 aa  107  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  21.3 
 
 
869 aa  107  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  25.74 
 
 
1114 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  22.27 
 
 
911 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  22.77 
 
 
923 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0758  YhgE/Pip N-terminal domain protein  24.26 
 
 
718 aa  106  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2134  hypothetical protein  24.44 
 
 
772 aa  105  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00916626  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  22.77 
 
 
924 aa  105  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  25.17 
 
 
915 aa  104  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02050  YhgE/Pip-like protein  25.78 
 
 
988 aa  100  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1632  membrane protein-like protein  22.86 
 
 
955 aa  99.8  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000847897  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  22.67 
 
 
797 aa  100  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  27.46 
 
 
857 aa  99.8  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5390  hypothetical protein  23.11 
 
 
512 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0082  YhgE/Pip C-terminal domain protein  27.7 
 
 
785 aa  94.7  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26740  YhgE/Pip-like protein  27.03 
 
 
823 aa  94.4  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  28.75 
 
 
819 aa  90.9  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1969  hypothetical protein  25.31 
 
 
789 aa  89  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6104  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  31.74 
 
 
597 aa  87.4  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  23.29 
 
 
782 aa  87  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0180  hypothetical protein  23.87 
 
 
754 aa  83.2  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267919  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  23 
 
 
623 aa  81.6  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  29.14 
 
 
1037 aa  79  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5739  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  25.26 
 
 
683 aa  79  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.979212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0395  hypothetical protein  28.27 
 
 
728 aa  78.2  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.564778  normal  0.0901394 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5391  phage infection protein  34.4 
 
 
142 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15730  YhgE/Pip-like protein  27.69 
 
 
882 aa  65.5  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0687  YhgE/Pip C-terminal domain protein  29.7 
 
 
946 aa  63.5  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  31.37 
 
 
759 aa  62  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3327  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  23.82 
 
 
649 aa  58.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0644816  normal  0.846988 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3105  phage infection protein  28.57 
 
 
393 aa  57  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2132  phage infection protein  30.69 
 
 
393 aa  57  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3217  YhgE/Pip N-terminal domain protein  24.87 
 
 
740 aa  55.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0017826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3117  hypothetical protein  26.21 
 
 
393 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2897  hypothetical protein  26.21 
 
 
393 aa  52  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3114  hypothetical protein  26.21 
 
 
393 aa  52  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394395  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2892  hypothetical protein  26.73 
 
 
393 aa  51.6  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0559889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3138  hypothetical protein  24.81 
 
 
393 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.393136  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3135  hypothetical protein  25.96 
 
 
393 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>