54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3154 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3154  membrane protein-like protein  100 
 
 		 470 aa  945    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.131996  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10181  transmembrane protein  39.73 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5806  hypothetical protein  34.59 
 
 		 442 aa  233  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6227  hypothetical protein  30.57 
 
 		 465 aa  183  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2823  hypothetical protein  24.87 
 
 		 393 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3117  hypothetical protein  23.97 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3138  hypothetical protein  25.45 
 
 		 393 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.393136  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3135  hypothetical protein  23.51 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2897  hypothetical protein  23.32 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3114  hypothetical protein  23.32 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2866  hypothetical protein  23.7 
 
 		 393 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.96349  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2892  hypothetical protein  24.09 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0559889  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26740  YhgE/Pip-like protein  29.22 
 
 		 823 aa  60.5  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0499  YhgE/Pip N-terminal domain protein  24.71 
 
 		 876 aa  59.7  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0213  hypothetical protein  23.63 
 
 		 379 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2132  phage infection protein  25 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06030  YhgE/Pip-like protein  24.2 
 
 		 967 aa  54.3  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.646381  normal  0.719714 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1944  hypothetical protein  26.21 
 
 		 721 aa  54.7  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2134  hypothetical protein  25.57 
 
 		 772 aa  54.3  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00916626  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2446  hypothetical protein  22.54 
 
 		 425 aa  54.3  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2400  hypothetical protein  22.54 
 
 		 425 aa  54.3  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.361611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3105  phage infection protein  24.47 
 
 		 393 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0195  ABC-2 type transporter  21.29 
 
 		 392 aa  53.5  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2915  putative phage infection protein  25.88 
 
 		 718 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0184  hypothetical protein  21.39 
 
 		 379 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  26.04 
 
 		 772 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1896  membrane protein-like protein  23.19 
 
 		 380 aa  51.6  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2593  phage infection protein, putative  25.86 
 
 		 718 aa  50.1  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0811  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.33 
 
 		 678 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0663  ABC-2 type transporter  29.38 
 
 		 678 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  24.58 
 
 		 857 aa  48.9  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1461  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.9 
 
 		 881 aa  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  0.893103 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0346  hypothetical protein  25.52 
 
 		 941 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2916  putative phage infection protein  25.53 
 
 		 721 aa  47.8  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0181  hypothetical protein  20.99 
 
 		 379 aa  47.4  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0556073  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2510  YhgE/Pip N-terminal domain protein  25.17 
 
 		 705 aa  47  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1246  hypothetical protein  28.7 
 
 		 876 aa  46.2  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0159  hypothetical protein  19.55 
 
 		 412 aa  46.6  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0360  hypothetical protein  24.83 
 
 		 941 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0374  hypothetical protein  24.83 
 
 		 941 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1752  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 		 669 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2594  phage infection protein, putative  27.06 
 
 		 721 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0082  YhgE/Pip C-terminal domain protein  24.75 
 
 		 785 aa  45.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0417  phage infection protein  22.94 
 
 		 991 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466576 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0484  hypothetical protein  23.23 
 
 		 953 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4888  phage infection protein  24.2 
 
 		 953 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108734  normal  0.760577 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0350  hypothetical protein  23.23 
 
 		 953 aa  44.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07149  conserved hypothetical protein  21.77 
 
 		 438 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0430  hypothetical protein  24.2 
 
 		 953 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0882227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0473  phage infection protein  22.94 
 
 		 981 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4995  ABC-2 type transporter  23.68 
 
 		 669 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0951558  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1969  hypothetical protein  21.59 
 
 		 789 aa  44.3  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  25.32 
 
 		 695 aa  44.3  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1037 aa  43.5  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>