55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0159 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0159  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  833    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0181  hypothetical protein  24.76 
 
 
379 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0556073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0184  hypothetical protein  24.58 
 
 
379 aa  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0213  hypothetical protein  24.1 
 
 
379 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0195  ABC-2 type transporter  24.4 
 
 
392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  29.03 
 
 
737 aa  57.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0432  YhgE/Pip C-terminal domain protein  22.47 
 
 
666 aa  56.2  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347032  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6227  hypothetical protein  22.08 
 
 
465 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0021  hypothetical protein  22.46 
 
 
396 aa  55.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.637243  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.08 
 
 
857 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0180  hypothetical protein  31.25 
 
 
754 aa  53.9  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  26.39 
 
 
666 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2446  hypothetical protein  20.71 
 
 
425 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  25.74 
 
 
819 aa  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2400  hypothetical protein  20.71 
 
 
425 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.361611  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  25 
 
 
666 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  25 
 
 
666 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  25.51 
 
 
695 aa  50.8  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  22.6 
 
 
666 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  25.69 
 
 
666 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  22.52 
 
 
666 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  25.69 
 
 
663 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  30.63 
 
 
825 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  25 
 
 
666 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  22.47 
 
 
666 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  30.63 
 
 
869 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  30.61 
 
 
769 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1896  membrane protein-like protein  26.36 
 
 
380 aa  47.8  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  30.63 
 
 
869 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  30.63 
 
 
911 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  30.63 
 
 
924 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  30.63 
 
 
923 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  30.63 
 
 
869 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  30.63 
 
 
869 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  23.56 
 
 
623 aa  47.4  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5391  phage infection protein  31.91 
 
 
142 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3154  membrane protein-like protein  19.55 
 
 
470 aa  46.6  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.131996  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2262  phage infection protein  27.03 
 
 
954 aa  46.6  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  25 
 
 
759 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0758  YhgE/Pip N-terminal domain protein  26.92 
 
 
718 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  30 
 
 
1114 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  30.91 
 
 
1111 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  32.58 
 
 
417 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06030  YhgE/Pip-like protein  18.87 
 
 
967 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.646381  normal  0.719714 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1752  ABC-2 type transporter  24.21 
 
 
669 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4995  ABC-2 type transporter  22.75 
 
 
669 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0951558  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6104  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  23.35 
 
 
597 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26740  YhgE/Pip-like protein  22.7 
 
 
823 aa  44.3  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0357  ABC-2 type transporter  25.32 
 
 
940 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  24.03 
 
 
395 aa  44.3  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1944  hypothetical protein  30 
 
 
721 aa  44.3  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  23.81 
 
 
797 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0560  YhgE/Pip C-terminal domain protein  21.43 
 
 
692 aa  43.9  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000430326 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11020  YhgE/Pip-like protein  22.91 
 
 
958 aa  43.1  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.458925  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0213  hypothetical protein  25.44 
 
 
115 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>