49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10181 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10181  transmembrane protein  100 
 
 
452 aa  898    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3154  membrane protein-like protein  39.95 
 
 
470 aa  315  8e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.131996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5806  hypothetical protein  40 
 
 
442 aa  251  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6227  hypothetical protein  35.32 
 
 
465 aa  242  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1896  membrane protein-like protein  22.79 
 
 
380 aa  66.6  0.0000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2897  hypothetical protein  27.8 
 
 
393 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2446  hypothetical protein  20.83 
 
 
425 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3114  hypothetical protein  27.8 
 
 
393 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394395  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2400  hypothetical protein  20.83 
 
 
425 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.361611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3117  hypothetical protein  27.8 
 
 
393 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3135  hypothetical protein  27.67 
 
 
393 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2892  hypothetical protein  27.27 
 
 
393 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0559889  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2866  hypothetical protein  29.31 
 
 
393 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.96349  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4995  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 
669 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0951558  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3138  hypothetical protein  27.84 
 
 
393 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.393136  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3321  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 
733 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156979  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2823  hypothetical protein  26.14 
 
 
393 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1752  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 
669 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  30.46 
 
 
695 aa  50.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3105  phage infection protein  25.71 
 
 
393 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2132  phage infection protein  25.71 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0159  hypothetical protein  19.06 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2510  YhgE/Pip N-terminal domain protein  27.27 
 
 
705 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.44 
 
 
769 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1762  YhgE/Pip N-terminal domain protein  26.7 
 
 
723 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7772  putative integral membrane protein  30.35 
 
 
344 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  36.14 
 
 
797 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26740  YhgE/Pip-like protein  25.93 
 
 
823 aa  47.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.96 
 
 
857 aa  47.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0432  YhgE/Pip C-terminal domain protein  25.6 
 
 
666 aa  47.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  26.92 
 
 
869 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  26.92 
 
 
869 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  26.92 
 
 
869 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0386  ABC transporter, permease component  24.44 
 
 
428 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246762  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06020  YhgE/Pip-like protein  26.8 
 
 
717 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.333428  normal  0.219375 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  26.03 
 
 
772 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  26.5 
 
 
759 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1969  hypothetical protein  28.3 
 
 
789 aa  45.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0195  ABC-2 type transporter  21.52 
 
 
392 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  26.07 
 
 
911 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5526  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.78 
 
 
631 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  26.07 
 
 
869 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  26.07 
 
 
923 aa  44.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6104  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  34.02 
 
 
597 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  26.07 
 
 
924 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  27.88 
 
 
1037 aa  43.5  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  26.5 
 
 
1114 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2916  putative phage infection protein  27.61 
 
 
721 aa  43.5  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0499  YhgE/Pip N-terminal domain protein  25.5 
 
 
876 aa  43.1  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>